prepare 4'-F RNA successfully. In the context of an RNA strand, 4'FU, which existed in a North conformation, was reasonably stable and resembled unmodified uridine well. The 19F NMR signal of 4'FU was sensitive to RNA secondary structure, with a chemical shift dispersion as large as 4 ppm (compared with <1 ppm for 2'FU), which makes it a valuable probe for discriminating single-stranded RNA and A-type, B-type
氟化 RNA 分子,特别是 2'-F RNA,已在 RNA 治疗、RNA 适体和核酶中广泛应用,并作为 19F NMR 探针用于阐明 RNA 结构。由于 4'-F
核糖核苷的不稳定性,4'-F 修饰的 RNA 的合成长期以来一直是一个挑战。在这项研究中,我们开发了一种合成 4'-F-
尿苷 (4'FU) 亚
磷酰胺的策略,并成功地用它制备了 4'-F RNA。在 RNA 链的背景下,以 North 构象存在的 4'FU 相当稳定,并且与未修饰的
尿苷非常相似。4'FU 的 19F NMR 信号对 RNA 二级结构敏感,
化学位移色散高达 4 ppm(相比之下 2'FU <1 ppm),这使其成为区分单链 RNA 和一种,B 型和不匹配的双链体。此外,我们证明,因为 RNA 加工酶处理 4'FU 与未修饰的
尿苷相同,4'FU 可用于监测 RNA 结构动力学和酶介导的 RNA 加工。总之,我们的结果表明