5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-6-iodo-2',3'-O-isopropylideneuridine | 142682-82-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-6-iodo-2',3'-O-isopropylideneuridine
• 英文别名: 1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-6-iodopyrimidine-2,4-dione
• CAS: 142682-82-4
• 化学式: C₁₈H₂₉IN₂O₆Si
• 分子量: 524.428
• InChiKey: HGPNIKGIDVEPCW-JUDXGUMMSA-N

物化性质

• 密度：
  1.48±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.58
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  86.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-6-iodo-2',3'-O-isopropylideneuridine 在 吡啶 、 水 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 6-N-methylamino-uridine-5'-O-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  WO2008/83465

  摘要：

  公开号：
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 咪唑 、 硫酸 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-6-iodo-2',3'-O-isopropylideneuridine
  参考文献：
  名称：

  一种有效的，具有抗疟疾活性的牙足苷5'-单磷酸脱羧酶的共价抑制剂。

  摘要：

  卵磷脂5'-单磷酸脱羧酶（ODCase）已经进化为在没有任何共价中间体的情况下催化了Orotidine 5'-单磷酸的脱羧反应。ODCase中的活性位点残基参与广泛的氢键网络。我们发现6-碘尿苷5'-单磷酸酯（6-碘-UMP）不可逆地抑制了嗜热自养甲烷杆菌和恶性疟原虫ODCase的催化活性。酶抑制剂复合物的质谱分析证实了抑制剂与ODCase的共价结合，伴随着两个质子和碘部分的损失。抑制剂和ODCase的复合物的X射线晶体结构（分辨率为1.6 A）清楚地显示了与活性位点Lys-72 [校正]残基形成的共价键。6-碘-UMP以时间和浓度依赖性方式抑制ODCase。6-碘尿苷（6-碘-UMP的核苷形式）显示出有效的抗血浆活性，对恶性疟原虫ItG和3D7分离株的IC50分别为4.4 +/- 1.3 microM和6.2 +/- 0.7 microM。6-碘尿苷5'-单磷酸酯是ODCase的新型共价

  DOI：

  10.1021/jm060827p

文献信息

• Practical synthesis of 6-aryluridines via palladium(II) acetate catalyzed Suzuki–Miyaura cross-coupling reaction
  作者：Yu-Chiao Shih、Tun-Cheng Chien

  DOI：10.1016/j.tet.2011.03.051

  日期：2011.5

  Sugar-protected 6-halouridine derivatives underwent Suzuki–Miyaura cross-coupling reactions with arylboronic acids in the presence of palladium(II) acetate as a catalyst, triphenylphosphine as a ligand, and sodium carbonate as a base. This methodology is applicable to both the C5- and C6-position of uridine and provides a direct access for versatile uridine derivatives.

  在乙酸钯（II）作为催化剂，三苯基膦作为配体和碳酸钠作为碱的存在下，糖保护的6-卤代吡啶衍生物与芳基硼酸进行了Suzuki-Miyaura交叉偶联反应。该方法学适用于尿苷的C5和C6位置，并为通用尿苷衍生物提供了直接途径。
• Synthesis of C-6-substituted uridine phosphonates through aerobic ligand-free Suzuki–Miyaura cross-coupling
  作者：Radim Nencka、Davy Sinnaeve、Izet Karalic、José C. Martins、Serge Van Calenbergh

  DOI：10.1039/c0ob00061b

  日期：——

  An efficient protocol for the construction of C-6-(hetero)aryl-substituted uridine phosphonate analogues utilizing an aerobic, ligand-free Suzuki–Miyaura cross-coupling reaction of a 6-iodo-precursor in aqueous media has been established. The method presents a modular approach toward the target compounds as demonstrated by the synthesis of a small library comprising 14 novel nucleoside phosphonates.

  建立了一种利用水相中6-碘前体进行无配体Suzuki-Miyaura交叉偶联反应的高效协议，用于构建C-6-(杂)芳基取代的尿苷膦酸类似物。该方法提供了一种模块化合成目标化合物的方法，如通过合成一个包含14种新型核苷膦酸的小型化合物库所示。
• Face selective 6,1′-(1-oxo)ethano bridge formation of uracil nucleosides under hypoiodite reaction conditions
  作者：Atsushi Kittaka、Hajime Kato、Hiromichi Tanaka、Yumiko Nonaka、Midori Amano、Kazuo T. Nakamura、Tadashi Miyasaka

  DOI：10.1016/s0040-4020(99)00232-x

  日期：1999.4

  Synthesis of novel spiro uracil nucleosides with an anomeric orthoester structure in a stereoselective manner under the hypoio dite reaction conditions of Heusler-Kalvoda and Suárez is fully described. While 2′-deoxy-6-(hydroxymethyl)uridine 2 and 2′-deoxy-6-[(1-hydroxy-1-methyl)ethyl]uridine 4 gave β- and α-spiro nucleosides in 43–68% yields with low selectivity (), the secondary ary alcohols 3a and

  充分描述了在Heusler-Kalvoda和Suárez的低碘反应条件下以立体选择性方式合成具有异头酯原酸酯结构的新型螺尿嘧啶核苷。2'-deoxy-6-（羟甲基）尿苷2和2'-deoxy-6-[（1-羟基-1-甲基）乙基]尿苷4以43-68％的产率得到β-和α-螺代核苷，由于低选择性（），仲醇3a和3b的化学产率为68–79％，选择性明显好于（）。在该6-（羟基）尿苷同行的方向6-8，16-17，和19似乎不仅受2'-取代基的控制，而且受C6-侧链的C7-立体中心的手性的控制，就像在2'-脱氧尿苷系列中一样。该反应的过渡态的几何形状被假定基于环化产物的X射线晶体结构20 α和24 β。
• Design of Inhibitors of Orotidine Monophosphate Decarboxylase Using Bioisosteric Replacement and Determination of Inhibition Kinetics
  作者：Ewa Poduch、Angelica M. Bello、Sishi Tang、Masahiro Fujihashi、Emil F. Pai、Lakshmi P. Kotra

  DOI：10.1021/jm060202r

  日期：2006.8.1

  Inhibitors of orotidine monophosphate decarboxylase (ODCase) have applications in RNA viral, parasitic, and other infectious diseases. ODCase catalyzes the decarboxylation of orotidine monophosphate (OMP), producing uridine monophosphate (UMP). Novel inhibitors 6-amino-UMP and 6-cyano-UMP were designed on the basis of the substructure volumes in the substrate OMP and in an inhibitor of ODCase, barbituric

  酪蛋白单磷酸脱羧酶（ODCase）抑制剂可用于RNA病毒，寄生虫和其他传染病。ODCase催化牛尿苷单磷酸酯（OMP）的脱羧，产生尿苷单磷酸酯（UMP）。根据底物OMP和ODCase抑制剂巴比妥酸单磷酸酯BMP中亚结构的体积设计了新型抑制剂6-氨基-UMP和6-氰基-UMP。为了研究ODCase的抑制动力学，开发了一种使用等温滴定热法（ITC）的新酶分析方法。反应速率是通过监测在酪蛋白单磷酸的酪蛋白的脱羧反应过程中产生的热量来测量的。确定了动力学参数（k（cat）= 21 s（-1），KM = 5 microM）和摩尔焓（DeltaH（app）= 5 kcal / mol），用于通过ODCase进行底物的脱羧。观察到该酶的竞争性抑制，并且对于6-氮杂-UMP和6-氰基-UMP，抑制常数（Ki）被确定为分别为12.4μM和29μM。发现6-氨基-UMP是ODCase的有效抑制剂之一，其抑制常
• NMR-based conformational analysis of 2′,6-disubstituted uridines and antiviral evaluation of new phosphoramidate prodrugs
  作者：Fábio da Paixão Soares、Elisabetta Groaz、Eveline Lescrinier、Johan Neyts、Pieter Leyssen、Piet Herdewijn

  DOI：10.1016/j.bmc.2015.07.003

  日期：2015.9

  Six novel phosphoramidate prodrugs of uridine analogues, with structural modifications introduced at the 6- and 2',6-positions, have been prepared and evaluated for selective antiviral activity against hepatitis C virus, as well as other positive-stranded RNA viruses. An analysis of the conformational properties of the parent nucleosides was carried out using two-dimensional NMR spectroscopy based experiments, highlighting a 3'-endo (North) sugar puckering preference and syn orientation. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.