(E)-cyclooct-4-enol | 85081-69-2

• 物质功能分类: 催化剂及助剂 - 聚合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (E)-cyclooct-4-enol
• 英文别名: 5-hydroxy-trans-cyclooctene；(1R,4E)-cyclooct-4-en-1-ol；TCO；(R)-Tco-OH
• CAS: 85081-69-2
• 化学式: C₈H₁₄O
• 分子量: 126.199
• InChiKey: UCPDHOTYYDHPEN-CMLYIYFCSA-N

物化性质

• 沸点：
  202.2±29.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.954±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  溶于二甲基亚砜

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  20.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  1

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 危险性防范说明：
  P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H319
• 储存条件：
  20°C

制备方法与用途

羟基改性的环辛烯衍生物可以与1,2,4,5-四嗪进行菌株促进的无铜点击化学环加成反应。这种环辛烯能够与四嗪官能化化合物或生物分子反应，无需催化剂即可生成稳定的共价键。

反式环辛烯和四嗪之间的4+2反电子需求Diels-Alder环加成反应是报道中最快的生物相容性连接技术，在生物标记和成像方面具有广泛的应用。此外，（E）-环辛-4-烯醇可用于多步合成反式环辛烯香叶基二磷酸，这是一种含有应变环的新颖蛋白法尼基转移酶（PFTase）底物，适用于位点特异性修饰技术。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-cyclooct-4-enol 在 正丁基锂 、 sodium hydride 、 二异丙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 mineral oil 为溶剂， 反应 46.5h， 生成 (E-minor)-2,5-dioxopyrrolidin-1-yl 2-(cyclooct-4-en-1-yloxy)-2-methylpropanoate
  参考文献：
  名称：

  Pretargeting kit, method and agents used therein

  摘要：

  描述了一种预靶向方法，以及相关的用于靶向医学成像和/或治疗的试剂盒，其中利用表现出彼此生物正交反应性的无机反应性化学基团。该发明涉及在预靶向探针和效应探针之间提供[4+2]逆电子需求（反）Diels-Alder化学反应的偶联。为此，其中一个探针包括富电子不足的四氮唑或其他适当的二烯，另一个包括一个具有一个或多个轴取代基的E-环辛烯。

  公开号：

  US09463256B2
• 作为产物：
  描述：

  (Z)-cyclooct-4-enol 在 苯甲酸甲酯 作用下， 以 乙醚 、 环己烷 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 (E)-cyclooct-4-enol
  参考文献：
  名称：

  MULTIPLE ORTHOGONAL LABELLING OF OLIGONUCLEOTIDES

  摘要：

  总之，本发明涉及一种用于多重正交标记寡核苷酸（优选为RNA或DNA）的方法，通过同时进行反Diels-Alder反应（DAinv）和铜催化点击反应（CuAAC），其中该方法在单一步骤中使用，只需将不同的反应组分混合并在室温下孵育水溶性反应混合物，优选为一小时。详细来说，反应组分包括一个或多个N3修饰标签，一个铜化合物，一个稳定配体，一个还原剂和一个或多个电子不足的标记修饰二烯，它们与至少双重修饰的寡核苷酸一起添加，其中至少含有一个或多个N3反应基团和一个或多个电子富集的二烯酰化物，优选使用端基炔烃基团作为N3反应基团，优选使用frans-环辛烯基团或去氢莰烯作为电子富集的二烯酰化物，更优选为frans-环辛烯基团。因此，本发明提供了一种用于后合成多重正交标记寡核苷酸的一锅法，允许在固相合成后将至少两个标记引入寡核苷酸的特定位点，其中DAinv仅在二烯基团修饰上发生，而CuAAC选择性地在N3反应基团修饰上发生。

  公开号：

  US20150218203A1

文献信息

• PRETARGETING KIT, METHOD AND AGENTS USED THEREIN
  申请人：Lub Johan

  公开号：US20130189184A1

  公开（公告）日：2013-07-25

  Described is a pretargeting method, and related kits, for targeted medical imaging and/or therapeutics, wherein use is made of abiotic reactive chemical groups that exhibit bio-orthogonal reactivity towards each other. The invention involves the use of [4+2] inverse electron demand (retro) Diels-Alder chemistry in providing the coupling between a Pre-targeting Probe and an Effector Probe. To this end one of these probes comprises an electron-deficient tetrazine or other suitable diene, and the other an E-cyclooctene which has one or more axial substituents.

  描述了一种预靶向方法及相关试剂盒，用于靶向医学成像和/或治疗，其中利用表现出生物正交反应性的无机反应性化学基团。该发明涉及使用[4+2]逆电子需求（反）Diels-Alder化学在预靶向探针和效应探针之间提供偶联。为此，其中一种探针包括富电子缺陷的四唑或其他适当的双烯，另一种是具有一个或多个轴取代基的E-环辛烯。
• Synthesis and evaluation of photo-activatable β-diarylsydnone-<scp>l</scp>-alanines for fluorogenic photo-click cyclization of peptides
  作者：Zhuojun Yao、Xueting Wu、Xiaocui Zhang、Qin Xiong、Shichao Jiang、Zhipeng Yu

  DOI：10.1039/c9ob00898e

  日期：——

  β-Diarylsydnone-l-alanines were designed and introduced into peptides allowing photo-cyclization only in phosphate containing buffer with concomitant fluorescence generation in live cells.

  β-二芳基亚醌-l-丙氨酸被设计并引入到肽中，只允许在含磷缓冲液中进行光环化反应，并在活细胞中产生伴随荧光的结果。
• Site-Specific Antibody Functionalization Using Tetrazine–Styrene Cycloaddition
  作者：Benjamin J. Umlauf、Kalie A. Mix、Vanessa A. Grosskopf、Ronald T. Raines、Eric V. Shusta

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.8b00114

  日期：2018.5.16

  Biologics, such as antibody–drug conjugates, are becoming mainstream therapeutics. Consequently, methods to functionalize biologics without disrupting their native properties are essential for identifying, characterizing, and translating candidate biologics from the bench to clinical practice. Here, we present a method for site-specific, carboxy-terminal modification of single-chain antibody fragments (scFvs). ScFvs displayed on the surface of yeast were isolated and functionalized by combining intein-mediated expressed protein ligation (EPL) with inverse electron-demand Diels–Alder (IEDDA) cycloaddition using a styrene–tetrazine pair. The high thiol concentration required to trigger EPL can hinder the subsequent chemoselective ligation reactions; therefore, the EPL reaction was used to append styrene to the scFv, limiting tetrazine exposure to damaging thiols. Subsequently, the styrene-functionalized scFv was reacted with tetrazine-conjugated compounds in an IEDDA cycloaddition to generate functionalized scFvs that retain their native binding activity. Rapid functionalization of yeast surface-derived scFv in a site-directed manner could find utility in many downstream laboratory and preclinical applications.

  生物制剂，如抗体-药物偶连物，正逐渐成为主流治疗方法。因此，开发在不破坏其天然特性的情况下功能化生物制剂的方法，对于识别、表征和将候选生物制剂从实验室转化到临床应用至关重要。在此，我们提出了一种对单链抗体片段（scFv）进行特定位点、羧基末端修饰的方法。通过将内肽介导的表达蛋白连接（EPL）与反向电子需求Diels–Alder（IEDDA）环加成结合，分离并功能化了显示在酵母表面的scFv，采用的是苯乙烯-四氮唑配对。触发EPL所需的高硫醇浓度可能会妨碍后续的化学选择性连接反应；因此，使用EPL反应将苯乙烯附加到scFv上，从而限制了四氮唑暴露于有害硫醇中。随后，将苯乙烯功能化的scFv与四氮唑偶联化合物进行IEDDA环加成反应，生成保留其天然结合活性的功能化scFv。以定点方式快速功能化酵母表面衍生的scFv，可能在许多下游实验室和临床前应用中具有实用性。
• Amino Acids for Diels-Alder Reactions in Living Cells
  作者：Tilman Plass、Sigrid Milles、Christine Koehler、Jędrzej Szymański、Rainer Mueller、Manfred Wießler、Carsten Schultz、Edward A. Lemke

  DOI：10.1002/anie.201108231

  日期：2012.4.23

  unnatural amino acids can be used for biocompatible site‐specific labeling of proteins with fluorogenic dyes. The new compounds have norbornene and trans‐cyclooctene units that react with tetrazine derivatives in an inverse‐electron‐demand Diels–Alder cycloaddition (left in picture). The technique offers fast labeling that is orthogonal to labeling through azide–cyclooctyne click reaction (right).

  承受压力：一组遗传编码的非天然氨基酸可用于荧光染料对蛋白质的生物相容性位点特异性标记。新化合物具有降冰片烯和反式环辛烯单元，它们与反电子需求的Diels-Alder环加成反应中的四嗪衍生物反应（图左）。该技术提供了与通过叠氮化物-环辛炔点击反应进行标记正交的快速标记（右）。
• Click to Release: Instantaneous Doxorubicin Elimination upon Tetrazine Ligation
  作者：Ron M. Versteegen、Raffaella Rossin、Wolter ten Hoeve、Henk M. Janssen、Marc S. Robillard

  DOI：10.1002/anie.201305969

  日期：2013.12.23

  Eliminated without a trace: The fastest click reaction, the highly selective inverse‐electron‐demand Diels–Alder reaction, has been modified to enable selective bioorthogonal release. Thus, the click reaction of a tetrazine with a drug‐bound trans‐cyclooctene caused the instantaneous release of the drug and CO2 (see scheme). One possible application is the chemically triggered release, and thereby

  消除无影无踪：最快的点击反应，即高度选择性的逆电子需求Diels-Alder反应，已经过改良，可以实现选择性的生物正交释放。因此，四嗪与药物结合的反式环辛烯的点击反应会导致药物和CO 2的瞬时释放（请参阅方案）。一种可能的应用是化学触发的药物从肿瘤结合的抗体-药物结合物中的释放，从而被激活。