β-Galp-(1->3)-β-GalpNAc-(1->4)-β-Galp-(1->4)-Glc

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: β-Galp-(1->3)-β-GalpNAc-(1->4)-β-Galp-(1->4)-Glc
• 英文别名: Galβ1-3GalNAcβ1-4Galβ1-4Glc；Galbeta1-3GalNAcbeta1-4Galbeta1-4Glc；N-[(2S,3R,4R,5R,6R)-2-[(2R,3R,4R,5R,6S)-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-[(2R,3S,4R,5R)-4,5,6-trihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-4-[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-3-yl]acetamide
• 化学式: C₂₆H₄₅NO₂₁
• 分子量: 707.637
• InChiKey: HCXIEPLIUZXCMD-NLFJORDCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -8.5
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.96
• 拓扑面积：
  357
• 氢给体数：
  14
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  β-Galp-(1->3)-β-GalpNAc-(1->4)-β-Galp-(1->4)-Glc 在 三乙胺 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-(N-methyl-O-[2-(2-mercaptobutanamido)ethyl]hydroxylamino)-β-D-galactopyranosyl-(1→3)-2-acetamido-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  [EN] CARBOHYDRATE LIGANDS THAT BIND TO ANTIBODIES AGAINST GLYCOEPITOPES OF GLYCOSPHINGOLIPIDS
  [FR] LIGANDS GLUCIDIQUES SE LIANT À DES ANTICORPS DIRIGÉS CONTRE DES GLYCOÉPITOPES DE GLYCOSPHINGOLIPIDES

  摘要：

  该发明涉及与神经系统的糖脂类似的糖配体和基团，分别模拟由神经系统的糖脂类脂质组成的糖基表位，特别是由脑苷脂、球脂、神经节脂和磺酸葡糖醛基球脂类脂质组成的糖基表位，这些表位被与神经系统疾病相关的抗糖基抗体所结合。该发明还涉及利用这些糖配体/基团在诊断以及治疗与抗糖基抗体相关的神经系统疾病中的用途。具体而言，该发明涉及符合以下化合物的公式(I)和(II)以及包含这些化合物众多的治疗可接受聚合物，包括具有一种公式(I)或(II)化合物的负载或几种公式(I)和/或(II)化合物的组合的聚合物。公式(I)化合物定义为：公式(I)，其中RI1为Z或(AA)或(BB)或(CC)或(DD)；其中RI2为H、SO3H或(EE)或(FF)或(GG)或(HH)或(JJ)或(KK)或(LL)，其中RI3为H或(MM)；其中RI4为H或(NN)或(OO)，其中RI5和RI6独立地为H或(EE)；其中RI7为H或(EE)或(FF)，公式(II)化合物定义为：公式(II)，其中RII1为Z或(PP)，其中RII2为Z或(QQ)或(RR)或(SS)或(TT)，其中Z为-N(Ra)-A-B-CH2-(CH2)q-SH，其中Ra为H、C1-C4-烷基、C1-C4-烷氧基、CH2C6H5、CH2CH2C6H5、OCH2C6H5或OCH2CH2C6H5；A为C1-C7-烷基、C1-C7-烷氧基、C1-C4-烷基-(OCH2CH2)pO-C1-C4-烷基或C1-C7-烷氧基-Rb，其中Rb为可选择取代的芳基或可选择取代的杂环烷基，p为0至6，优选p为1、2或3，更优选p为1；B为NHC(O)、S或CH2；q为0至6，优选q为1、2、3或4，更优选q为1或2。

  公开号：

  WO2017046172A1

文献信息

• Novel substrate specificities of two lacto-N-biosidases towards β-linked galacto-N-biose-containing oligosaccharides of globo H, Gb5, and GA1
  作者：Aina Gotoh、Toshihiko Katoh、Yuta Sugiyama、Shin Kurihara、Yuji Honda、Haruko Sakurama、Taiho Kambe、Hisashi Ashida、Motomitsu Kitaoka、Kenji Yamamoto、Takane Katayama

  DOI：10.1016/j.carres.2015.03.005

  日期：2015.5

  We describe the novel substrate specificities of two independently evolved lacto-N-biosidases (LnbX and LnbB) towards the sugar chains of globo-and ganglio-series glycosphingolipids. LnbX, a non-classified member of the glycoside hydrolase family, isolated from Bifidobacterium longum subsp. longum, was shown to liberate galacto-N-biose (GNB: Gal beta 1-3GalNAc) and 2'-fucosyl GNB (a type-4 trisaccharide) from Gb5 pentasaccharide and globo H hexasaccharide, respectively. LnbB, a member of the glycoside hydrolase family 20 isolated from Bifidobacterium bifidum, was shown to release GNB from Gb5 and GA1 oligosaccharides. This is the first report describing enzymatic release of beta-linked GNB from natural substrates. These unique activities may play a role in modulating the microbial composition in the gut ecosystem, and may serve as new tools for elucidating the functions of sugar chains of glycosphingolipids. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• [EN] CARBOHYDRATE LIGANDS THAT BIND TO ANTIBODIES AGAINST GLYCOEPITOPES OF GLYCOSPHINGOLIPIDS<br/>[FR] LIGANDS GLUCIDIQUES SE LIANT À DES ANTICORPS DIRIGÉS CONTRE DES GLYCOÉPITOPES DE GLYCOSPHINGOLIPIDES
  申请人：UNIV BASEL

  公开号：WO2017046172A1

  公开（公告）日：2017-03-23

  The invention relates to carbohydrate ligands and moieties, respectively, mimicking glycoepitopes comprised by glycosphingolipids of the nervous system, particularly glycoepitopes comprised by glycosphingolipids of the cerebroside, the globoside-, the ganglioside- and the sulfoglucuronyl paragloboside type, which are bound by anti-glycan antibodies associated with neurological diseases. The invention further relates to the use of these carbohydrate ligands/moieties, in diagnosis as well as for the treatment of neurological diseases associated with anti-glycan antibodies. In particular, the invention relates to compounds of formula (I) and (II) and to therapeutically acceptable polymers comprising a multitude of these compounds, including polymers with loading of one compound of formula (I) or (II) or combinations of several compounds of formula (I), and/or (II). The compounds of formula (I) are defined as: formula (I), wherein RI1 is Z or (AA) or (BB) or (CC) or (DD); wherein RI2 is H, SO3H, or (EE) or (FF) or (GG) or (HH) or (JJ) or (KK) or (LL), wherein RI3 is H or (MM); wherein RI4 is H or (NN) or (OO), wherein RI5 and RI6 are independently H or (EE); wherein RI7 is H or (EE) or (FF) and compounds of formula (II) are defined as: formula (II), wherein RII1 is Z or (PP), wherein RII2 is Z or (QQ) or (RR) or (SS) or (TT), wherein Z is -N(Ra)-A-B-CH2-(CH2)q-SH, wherein Ra is H, C1-C4-alkyl, C1-C4-alkoxy, CH2C6H5, CH2CH2C6H5, OCH2C6H5, or OCH2CH2C6H5; A is C1-C7-alkylene, C1-C7-alkoxy, C1-C4-alkyl–(OCH2CH2)pO–C1-C4-alkyl, or C1-C7-alkoxy-Rb, wherein Rb is an optionally substituted aryl or an optionally substituted heteroaryl, and wherein p is 0 to 6, preferably p is 1, 2 or 3, and further preferably p is 1; B is NHC(O), S or CH2; q is 0 to 6, preferably q is 1, 2, 3 or 4, and further preferably q is 1 or 2.

  该发明涉及与神经系统的糖脂类似的糖配体和基团，分别模拟由神经系统的糖脂类脂质组成的糖基表位，特别是由脑苷脂、球脂、神经节脂和磺酸葡糖醛基球脂类脂质组成的糖基表位，这些表位被与神经系统疾病相关的抗糖基抗体所结合。该发明还涉及利用这些糖配体/基团在诊断以及治疗与抗糖基抗体相关的神经系统疾病中的用途。具体而言，该发明涉及符合以下化合物的公式(I)和(II)以及包含这些化合物众多的治疗可接受聚合物，包括具有一种公式(I)或(II)化合物的负载或几种公式(I)和/或(II)化合物的组合的聚合物。公式(I)化合物定义为：公式(I)，其中RI1为Z或(AA)或(BB)或(CC)或(DD)；其中RI2为H、SO3H或(EE)或(FF)或(GG)或(HH)或(JJ)或(KK)或(LL)，其中RI3为H或(MM)；其中RI4为H或(NN)或(OO)，其中RI5和RI6独立地为H或(EE)；其中RI7为H或(EE)或(FF)，公式(II)化合物定义为：公式(II)，其中RII1为Z或(PP)，其中RII2为Z或(QQ)或(RR)或(SS)或(TT)，其中Z为-N(Ra)-A-B-CH2-(CH2)q-SH，其中Ra为H、C1-C4-烷基、C1-C4-烷氧基、CH2C6H5、CH2CH2C6H5、OCH2C6H5或OCH2CH2C6H5；A为C1-C7-烷基、C1-C7-烷氧基、C1-C4-烷基-(OCH2CH2)pO-C1-C4-烷基或C1-C7-烷氧基-Rb，其中Rb为可选择取代的芳基或可选择取代的杂环烷基，p为0至6，优选p为1、2或3，更优选p为1；B为NHC(O)、S或CH2；q为0至6，优选q为1、2、3或4，更优选q为1或2。