DBCO-acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: DBCO-acid
• 英文别名: dibenzocyclooctyne acid；11,12-didehydro-γ-oxodibenz[b,f]azocine-5(6H)-butanoic acid；DBCO-C6-acid；6-(2-azatricyclo[10.4.0.04,9]hexadeca-1(16),4,6,8,12,14-hexaen-10-yn-2-yl)-6-oxohexanoic acid
• 化学式: C₂₁H₁₉NO₃
• 分子量: 333.387
• InChiKey: NIRLBCOFKPVQLM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  57.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  DBCO-acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 Azadibenzocyclooctyne-PEG4-acid
  参考文献：
  名称：

  操纵二苯并氮杂环辛炔的点击反应性：通过银催化从叠氮化物点击组分到笼式酰化试剂。

  摘要：

  使用二苯并氮杂环辛炔（DBCO）进行的应变促进的叠氮化物-炔烃环加成反应广泛用于无铜生物正交反应中。此处报道的是DBCO的有效酸促进的重排和银催化的酰胺化反应，可显着改变其点击反应性。在切换点击反应中，DBCO作为笼状酰化试剂，可在银催化剂促进的降解作用后快速进行肽/蛋白质修饰，从而使Fc靶向肽特异性结合IgG抗体。

  DOI：

  10.1002/anie.202009408
• 作为产物：
  描述：

  5-二苯并环庚烯酮 在 吡啶 、 lithium aluminium tetrahydride 、 Eaton’s reagent 、 盐酸羟胺 、 potassium tert-butylate 、 溴 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 61.5h， 生成 DBCO-acid
  参考文献：
  名称：

  操纵二苯并氮杂环辛炔的点击反应性：通过银催化从叠氮化物点击组分到笼式酰化试剂。

  摘要：

  使用二苯并氮杂环辛炔（DBCO）进行的应变促进的叠氮化物-炔烃环加成反应广泛用于无铜生物正交反应中。此处报道的是DBCO的有效酸促进的重排和银催化的酰胺化反应，可显着改变其点击反应性。在切换点击反应中，DBCO作为笼状酰化试剂，可在银催化剂促进的降解作用后快速进行肽/蛋白质修饰，从而使Fc靶向肽特异性结合IgG抗体。

  DOI：

  10.1002/anie.202009408
• 作为试剂：
  描述：

  (5H-dibenzo[b,f]azepine-5-carbonyl)(3-phenyl-1,2,3-oxadiazol-3-ium-5-yl)amide 在 次氯酸叔丁酯 、 DBCO-acid 作用下， 以 aq. phosphate buffer 、 二甲基亚砜 、 乙腈 为溶剂， 生成 卡马西平
  参考文献：
  名称：

  用于快速释放酰胺、磺胺和尿素药物的亚氨基磺酸的选择性氯化

  摘要：

  在此，我们描述了一种亚氨基西酮氯化的方法，并证明了这种修饰对这些中间离子偶极子在应变促进的环加成反应中的反应性的高度有益影响。利用它们与环辛炔的反应，我们使用这些新的亚氨基糖酮来生物正交释放含有酰胺、尿素和磺酰胺的药物。值得注意的是，含有末端酰胺功能的药物首次以良好的动力学常数释放。

  DOI：

  10.1039/d2cc02784d

文献信息

• Exploration of the carmaphycins as payloads in antibody drug conjugate anticancer agents
  作者：Jehad Almaliti、Bailey Miller、Halina Pietraszkiewicz、Evgenia Glukhov、C. Benjamin Naman、Toni Kline、Jeffrey Hanson、Xiaofan Li、Sihong Zhou、Frederick A. Valeriote、William H. Gerwick

  DOI：10.1016/j.ejmech.2018.10.024

  日期：2019.1

  conjugates (ADCs) represent a new dimension of anticancer chemotherapeutics, with warheads to date generally involving either antitubulin or DNA-directed agents to achieve low-to sub-nanomolar potency. However, other potent cytotoxins working by different pharmacological mechanisms are under investigation, such as α,β-epoxyketone based proteasome inhibitors. These proteasome active agents are an emerging

  抗体-药物偶联物（ADC）代表了抗癌化学疗法的新领域，迄今为止，弹头通常涉及抗微管蛋白或DNA定向剂，以实现低至亚纳摩尔的效能。但是，正在研究通过不同药理机制起作用的其他有效细胞毒素，例如基于α，β-环氧酮的蛋白酶体抑制剂。这些蛋白酶体活性剂是一类新兴的抗癌药物，对某些癌细胞系具有超强的细胞毒性。Carmaphycins是我们从海洋蓝细菌中分离和鉴定的后一类的代表，这些以及一些合成类似物均显示出这种水平的效力。在当前的工作中，我们研究了在新型ADC设计中使用这些强力细胞毒性化合物作为战斗部。我们设计并合成了含有胺手柄的卡马霉素B类似物文库，可将其连接至抗体接头。这些掺入的胺手柄的碱性显示出强烈影响其细胞毒性的特性。直链胺导致最大的细胞毒性降低，而碱性较弱的芳族胺保留了强大的活性，如4-磺酰基苯胺衍生物所证明的。这些研究结果确定了卡马霉素中的P2残基是最合适的接头连接点位点，因此，我们合成了
• Bioorthogonal Click and Release Reaction of Iminosydnones with Cycloalkynes
  作者：Sabrina Bernard、Davide Audisio、Margaux Riomet、Sarah Bregant、Antoine Sallustrau、Lucie Plougastel、Elodie Decuypere、Sandra Gabillet、Ramar Arun Kumar、Jijy Elyian、Minh Nguyet Trinh、Oleksandr Koniev、Alain Wagner、Sergii Kolodych、Frédéric Taran

  DOI：10.1002/anie.201708790

  日期：2017.12.4

  We report the discovery of a new bioorthogonal click‐and‐release reaction involving iminosydnones and strained alkynes. This transformation leads to two products resulting from the ligation and fragmentation of iminosydnones under physiological conditions. Optimized iminosydnones were successfully used to design innovative cleavable linkers for protein modification, thus opening up new areas in the

  我们报告发现了一种新的生物正交的点击释放反应，涉及到亚氨基sydnones和应变炔烃。这种转化导致在生理条件下亚氨基sydnones的连接和断裂产生两种产物。优化的亚氨基缩醛成功用于设计用于蛋白质修饰的创新性可裂解连接子，从而在药物释放和目标捕捞应用领域开辟了新领域。这种点击释放技术可在温和生物正交条件下为功能化的环辛炔交换蛋白质上的标签。
• Sydnone-coumarins as clickable turn-on fluorescent sensors for molecular imaging
  作者：Elodie Decuypère、Margaux Riomet、Antoine Sallustrau、Sarah Bregant、Robert Thai、Grégory Pieters、Gilles Clavier、Davide Audisio、Frédéric Taran

  DOI：10.1039/c8cc06070c

  日期：——

  Copper-catalyzed and copper-free sydnone–alkyne cycloaddition reactions have emerged as complementary click tools for chemical biology but their use in bioorthogonal labeling is still in its infancy. Herein, combinations of alkynes and coumarin-sydnones were screened for their ability to generate pyrazole products displaying strong fluoroscence enhancement compared to reactants. One sydnone was identified

  铜催化的和无铜的亚砜-炔烃环加成反应已经成为化学生物学的补充点击工具，但它们在生物正交标记中的应用仍处于起步阶段。在此，对炔烃和香豆素-sydnones的组合进行筛选，以确定它们与反应物相比具有产生强烈荧光增强作用的吡唑产物的能力。一个sydnone被确定为特别适合蛋白质标记的新型开启探针。
• “Doubly Orthogonal” Labeling of Peptides and Proteins
  作者：Romain Tessier、Javier Ceballos、Nora Guidotti、Raphael Simonet-Davin、Beat Fierz、Jerome Waser

  DOI：10.1016/j.chempr.2019.06.022

  日期：2019.8

  bioconjugation methodology for the introduction of hypervalent iodine compounds onto biomolecules. Ethynylbenziodoxolones (EBXs) engage thiols in small organic molecules and cysteine-containing peptides and proteins in a fast and selective addition onto the alkynyl triple bond, resulting in stable vinylbenziodoxolone hypervalent iodine conjugates. The conjugation occurs at room temperature in an open

  在本文中，我们报告了将高价碘化合物引入生物分子的半胱氨酸生物缀合方法。乙炔基苯并恶唑啉酮（EBX）将小分子有机分子中的硫醇与含半胱氨酸的肽和蛋白质快速选择性地结合到炔基三键上，形成稳定的乙烯基苯并恶唑酮高价碘缀合物。所述缀合在生理条件下在室温下在开放烧瓶中发生。带有叠氮化物的EBX试剂的使用，可以通过应变释放驱动的环加成反应和乙烯基高价碘键的Suzuki-Miyaura交叉偶联，使生物缀合物实现“双正交”功能。我们成功地将该方法应用于相关和复杂的生物分子，例如组蛋白。通过单分子实验 我们通过引入接近荧光团的三重态猝灭剂说明了这种双反应生物共轭物的潜力，该猝灭剂通过抑制光漂白延长了其寿命。因此，预期这项工作将在肽和蛋白质功能化方面找到广泛的应用。
• Ultrafast Click Chemistry with Fluorosydnones
  作者：Hui Liu、Davide Audisio、Lucie Plougastel、Elodie Decuypere、David‐Alexandre Buisson、Oleksandr Koniev、Sergii Kolodych、Alain Wagner、Mourad Elhabiri、Anna Krzyczmonik、Sarita Forsback、Olof Solin、Véronique Gouverneur、Frédéric Taran

  DOI：10.1002/anie.201606495

  日期：2016.9.19

  reactivity towards both copper‐catalyzed and strain‐promoted cycloaddition reactions with alkynes. Synthetic access to these new mesoionic compounds was granted by electrophilic fluorination of σ‐sydnone PdII precursors in the presence of Selectfluor. Their reactions with terminal and cyclic alkynes were found to proceed very rapidly and selectively, affording 5‐fluoro‐1,4‐pyrazoles with bimolecular

  我们报告了4-氟丁酮的合成和反应性，这是一类独特的中离子偶极子，对炔烃的铜催化和应变促进的环加成反应均显示出出色的反应性。在Selectfluor的存在下，通过σ-sydnonePd II前体的亲电氟化反应，可以合成这些新的中离子化合物。发现它们与末端和环状炔烃的反应非常迅速且选择性地进行，从而提供双分子速率常数高达10 4  m -1  s -1的5-氟-1,4-吡唑，超过了文献中有关环炔烃的文献记载。进行了动力学研究以阐明反应的机理，并成功地用[ 18 F] Selectfluor进行了放射性标记，进一步突出了4-氟丁酮的价值。