西奈芬净 | 58944-73-3

• 物质功能分类: 生物化工 - 抑制剂
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 中文名称: 西奈芬净
• 中文别名: 西奈芬近
• 英文名称: sinefungin
• 英文别名: (2S,5S)-2,5-diamino-6-((2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino- 9H-purin-9-yl)-3,4- dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)hexanoic acid；S-adenosylornithine；sinefungine；(2S,5S)-2,5-diamino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]hexanoic acid
• CAS: 58944-73-3
• 化学式: C₁₅H₂₃N₇O₅
• 分子量: 381.392
• InChiKey: LMXOHSDXUQEUSF-YECHIGJVSA-N

物化性质

• 比旋光度：
  D25 -2.61° (c = 5 in water); D23 +12 ±2° (c = 0.227 in water)
• 沸点：
  783.2±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.91±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于水中
• 稳定性/保质期：
  遵照规定使用和储存，则不会发生分解。

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.3
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  209
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  11

安全信息

• 危险品标志：
  Xn
• 储存条件：
  存放在2-8 ºC阴凉干燥处

制备方法与用途

腺苷衍生物：西奈芬净

西奈芬净（9，sinefungin）是一种腺苷衍生物，属于泛甲基转移酶抑制剂，最初从灰质链霉菌中分离出来，作为一种潜在的抗真菌药物。Hercik 等报道了西奈芬净与ZIKV 甲基转移酶形成的晶体结构。S-腺苷蛋氨酸（SAM）是甲基转移酶（MTase）的天然底物，而西奈芬净则是其竞争性抑制剂。西奈芬净与GTP 和GDP 类似物相结合，可能增强这些类似物对酶的亲和力，从而获得更好的选择性和对ZIKV 复制更强的抑制作用。然而，在狗和山羊上作为抗寄生虫剂进行实验时，发现其具有毒性，阻碍了临床应用。

生物活性

Sinefungin 是病毒粒子mRNA (鸟嘌呤-7-)-甲基转移酶、 mRNA (核苷-2'-)-甲基转移酶的有效抑制剂，并且是一种 SET7/9 抑制剂。它通过抑制H3K4 甲基化来改善肾纤维化。

体外研究

Sinefungin（0.5 或1.0 μg/mL，60 分钟）可缓解TGF-β1诱导的α-SMA 增加，并在肾上皮细胞和肾成纤维细胞中抑制组蛋白H3K4 单甲基化。

Western Blot分析

• 细胞系：肾上皮细胞
• 浓度：0.5 或1.0 μg/mL
• 孵育时间：TGF-β1（10 ng/mL）预处理前60 分钟
• 结果：在NRK-52E 和NRK-49F 细胞中，剂量依赖性地显著减少TGF-β1诱导的α-SMA 蛋白表达，并抑制H3K4me1。

体内研究

Sinefungin（每天每公斤体重10 mg，在UUO 后立即给药）可以缓解梗阻性肾病中的肾纤维化。

实验结果

• 动物模型：8 周龄雄性C57BL/6J 小鼠
• 用药剂量：10 mg/kg
• 给药方式：腹腔注射，每天立即在UUO 后给药（悬浮于无菌水和0.9% NaCl溶液中）
• 结果：抑制α-SMA 蛋白表达，并在3 和7 天后缓解UUO 引起的α-SMA、FSP-1、胶原蛋白1 和胶原蛋白3 的增加。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  西奈芬净 在 双(对硝基苯基)磷酸酯 作用下， 以 甲醇 、 丙酮 为溶剂， 反应 120.0h， 生成 (3S,6S)-3-Amino-6-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-purin-9-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl]-piperidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  西奈芬净的生物合成：使用无细胞系统的研究

  摘要：

  西奈芬净的腺苷基部分的起源已经通过向灰链链霉菌的无细胞提取物施用双标记形式的ATP和腺苷进行了研究。结果表明，在掺入西芬芬净之前，提取物会显着降解ATP和腺苷。然而，显示腺苷的核糖环完整地并入西芬芬净中，并且不会从C-5'中损失tri。该观察结果排除了A9145C在西芬芬净生物合成中的中介作用。描述了另外的实验，这些实验表明精氨酸的C-5和核糖衍生物的C-5之间的CC键形成可以在腺嘌呤环的连接之前。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)86497-8
• 作为产物：
  描述：

  9-(methyl 9(S)-(((tert-butyloxy)carbonyl)amino)-6-cyano-5,6,7,8,9-pentadeoxy-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribo-decafuranosyluronate)adenine 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 甲酸 、 双氧水 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 [双(三氟乙酰氧基)碘]苯 作用下， 以 甲醇 、 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.02h， 生成 西奈芬净
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of sinefungin and its C-6' epimer

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja00364a028
• 作为试剂：
  描述：

  alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 在 西奈芬净 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (2E,4E,6E)-7-[3-Hydroxy-5-((3E,5E)-2-hydroxy-7-{3-hydroxy-2-[(2R,3R,4R,6S)-2,3,4-trihydroxy-5,5-dimethyl-6-((1E,3Z)-penta-1,3-dienyl)-tetrahydro-pyran-2-yl]-propionylamino}-1,3-dimethyl-hepta-3,5-dienyl)-tetrahydro-furan-2-yl]-hepta-2,4,6-trienoic acid 、 (2E,4E,6E)-7-[5-[(4E,6E)-8-[[3-[(2R,4S,5S,6S)-4,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy-2-[(2R,3R,4R,6S)-2,3,4-trihydroxy-5,5-dimethyl-6-[(1E,3Z)-penta-1,3-dienyl]oxan-2-yl]propanoyl]amino]-3-hydroxy-4-methylocta-4,6-dien-2-yl]-3-hydroxyoxolan-2-yl]hepta-2,4,6-trienoic acid 、 、 (2E,4E,6E)-7-[5-[(4E,6E)-8-[[2-[(2R,3R,4R,6S)-2,3-dihydroxy-5,5-dimethyl-6-[(1E,3Z)-penta-1,3-dienyl]-4-(2-phenylacetyl)oxyoxan-2-yl]-3-[(2R,4S,5S,6S)-4,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxypropanoyl]amino]-3-hydroxy-4-methylocta-4,6-dien-2-yl]-3-hydroxyoxolan-2-yl]hepta-2,4,6-trienoic acid
  参考文献：
  名称：

  西奈芬净对甘霉素生物合成的影响。ganefromycins的结构δ 1-4

  摘要：

  在存在西奈芬净时，链霉菌属链霉菌属。tanzanius，所述ganefromycin生产者，仅使截断ganefromycins δ 1-4（3-6）。O-甲基化步骤的抑制导致中间体的积聚，这些中间体被阻止进一步的生物合成转化。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(95)00149-7

文献信息

• [EN] SUBSTITUTED NUCLEOSIDE ANALOGUES FOR USE AS PRMT5 INHIBITORS<br/>[FR] ANALOGUES DE NUCLÉOSIDES SUBSTITUÉS DESTINÉS À ÊTRE UTILISÉS EN TANT QU'INHIBITEURS DE PRMT5
  申请人：JANSSEN PHARMACEUTICA NV

  公开号：WO2017153186A1

  公开（公告）日：2017-09-14

  The present invention relates novel substituted nucleoside analogues of Formula (I) wherein the variables have the meaning defined in the claims. The compounds according to the present invention are useful as PRMT5 inhibitors. The invention further relates to pharmaceutical compositions comprising said compounds as an active ingredient as well as the use of said compounds as a medicament.

  本发明涉及式(I)的新型取代核苷类似物，其中变量具有如权利要求中所定义的含义。根据本发明的化合物作为PRMT5抑制剂是有用的。本发明进一步涉及包含所述化合物作为活性成分的药物组合物，以及将所述化合物用作药物的应用。
• [EN] BICYCLIC COMPOUND AND USE THEREOF FOR INHIBITING HISTONE METHYLTRANSFERASE<br/>[FR] COMPOSÉ BICYCLIQUE ET SON UTILISATION POUR INHIBER L'HISTONE MÉTHYLTRANSFÉRASE
  申请人：ONCOTHERAPY SCIENCE INC

  公开号：WO2018165112A1

  公开（公告）日：2018-09-13

  The present invention relates to a compound represented by formula (I), a method for the preparation thereof, and a pharmaceutical composition containing the compound as an active ingredient for inhibiting histone methyltransferase such as SUV39H2.

  本发明涉及一种由式（I）表示的化合物，其制备方法，以及含有该化合物作为活性成分的药物组合物，用于抑制组蛋白甲基转移酶，如SUV39H2。
• Preparation Method for Amide Compounds and Use Thereof in Medical Field
  申请人：Shanghai Synergy Pharmaceutical Sciences Co., Ltd.

  公开号：US20220024941A1

  公开（公告）日：2022-01-27

  Provided are a preparation method for amide compounds and use thereof in medical field. Specifically, provided are small molecule amide compounds. Such compounds are inhibitors of enhancer homolog 2 (EZH2) of Zeste gene, and can be used for preventing and/or treating related diseases mediated by EZH2, including tumors, myeloproliferative diseases or autoimmune diseases.

  提供了一种酰胺化合物的制备方法及其在医学领域中的用途。具体来说，提供了小分子酰胺化合物。这些化合物是Zeste基因的增强子同源物2（EZH2）的抑制剂，可用于预防和/或治疗由EZH2介导的相关疾病，包括肿瘤、骨髓增生性疾病或自身免疫疾病。
• ETHANEDIAMINE-HETEROCYCLE DERIVATIVES AS INHIBITORS OF PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASES
  申请人：Board of Regents, The University of Texas System

  公开号：US20190270739A1

  公开（公告）日：2019-09-05

  The present invention relates to ethanediamine-heterocycle compounds that are able to act as inhibitors of PRMTs (protein arginine methyltransferases) for treating cancer and other diseases mediated by PRMTs.

  本发明涉及乙二胺-杂环化合物，能够作为PRMTs（蛋白精氨酸甲基转移酶）的抑制剂，用于治疗由PRMTs介导的癌症和其他疾病。
• USE OF SUBSTITUTED ISOQUINOLINONES, ISOQUINOLINDIONES, ISOQUINOLINTRIONES AND DIHYDROISOQUINOLINONES OR IN EACH CASE SALTS THEREOF AS ACTIVE AGENTS AGAINST ABIOTIC STRESS IN PLANTS
  申请人：Frackenpohl Jens

  公开号：US20140302987A1

  公开（公告）日：2014-10-09

  Use of substituted isoquinolinones, isoquinolinediones, isoquinolinetriones and dihydroisoquinolinones of the general formula (I) or their respective salts where the radicals in the general formula (I) correspond to the definitions given in the description, for enhancing stress tolerance in plants to abiotic stress, for strengthening plant growth and/or for increasing plant yield, and selected processes for preparing the compounds mentioned above.

  使用通式（I）中的替代的异喹啉酮、异喹啉二酮、异喹啉三酮和二氢异喹啉酮或它们的相应盐，其中通式（I）中的基团对应于描述中给出的定义，用于增强植物对非生物胁迫的耐受性，增强植物生长和/或增加植物产量，并选择性地制备上述化合物的过程。