4,4,5,5-tetramethyl-2-(2-(2-methyl-5-phenylthiophen-3-yl)cyclopent-1-enyl)-1,3,2-dioxaborolane | 1229936-73-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物
• 英文名称: 4,4,5,5-tetramethyl-2-(2-(2-methyl-5-phenylthiophen-3-yl)cyclopent-1-enyl)-1,3,2-dioxaborolane
• 英文别名: 4,4,5,5-Tetramethyl-2-[2-(2-methyl-5-phenylthiophen-3-yl)cyclopenten-1-yl]-1,3,2-dioxaborolane
• CAS: 1229936-73-5
• 化学式: C₂₂H₂₇BO₂S
• 分子量: 366.332
• InChiKey: AIPILFZKDLVFIB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.29
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  46.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4,4,5,5-tetramethyl-2-(2-(2-methyl-5-phenylthiophen-3-yl)cyclopent-1-enyl)-1,3,2-dioxaborolane 、 5-碘-2'-脱氧结核菌素 在 (1,1'-bis(diphenylphosphino)ferrocene)palladium(II) dichloride 、 caesium carbonate 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.0h， 以75%的产率得到(2R,3S,5R)-5-(4-amino-5-(2-(2-methyl-5-phenylthiophen-3-yl)cyclopent-1-en-1-yl)-7Hpyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
  参考文献：
  名称：

  烷基取代基在基于脱氮基腺嘌呤的二芳基乙烯光开关中的作用。

  摘要：

  双芳烃是一类重要的可逆光开关，通常声称在碳原子上需要两个烷基取代基，在两个碳原子之间在电环重排中形成或断开键。在这里，我们通过合成和表征在这些位置带有一个或两个甲基的四对基于脱氮腺嘌呤的二芳基乙烯光开关来探讨这一主张。根据取代方式的不同，具有一个烷基的二芳烃可表现出显着的光致变色性，但它们通常对扩展的紫外线辐射显示出较差的稳定性，较低的热稳定性和降低的抗疲劳性。获得的结果为设计用于生物纳米技术和合成生物学的新型高效DNA光开关提供了重要的方向。

  DOI：

  10.3762/bjoc.12.106
• 作为产物：
  描述：

  4,4,5,5-tetramethyl-2-(2-methyl-5-phenylthiophen-3-yl)-1,3,2-dioxaborolane 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 四(三苯基膦)钯 、 potassium acetate 、 caesium carbonate 、 2-二环己基磷-2,4,6-三异丙基联苯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 4,4,5,5-tetramethyl-2-(2-(2-methyl-5-phenylthiophen-3-yl)cyclopent-1-enyl)-1,3,2-dioxaborolane
  参考文献：
  名称：

  Optochemical control of transcription by the use of 7-deaza-adenosine-based diarylethenes

  摘要：

  从九种不同的7-脱氮腺苷二芳乙烯中，我们确定了一种高性能光开关，适用于合成光变DNA。

  DOI：

  10.1039/d1cc02639a

文献信息

• Development of High‐Performance Pyrimidine Nucleoside and Oligonucleotide Diarylethene Photoswitches
  作者：Theresa Kolmar、Simon M. Büllmann、Christopher Sarter、Katharina Höfer、Andres Jäschke

  DOI：10.1002/anie.202014878

  日期：2021.4.6

  their further development is hampered by the poor understanding of how the chemical structure modulates the photochromic properties. Here we synthesized 26 systematically varied deoxyuridine‐ and deoxycytidine‐derived DAEs and analyzed reaction quantum yields, composition of the photostationary states, thermal and photochemical stability, and reversibility. This analysis identified two high‐performance

  核苷和寡核苷酸二芳基乙烯（DAE）是一类新兴的光致变色材料，具有很高的应用潜力。然而，由于对化学结构如何调节光致变色性能的了解不足，它们的进一步发展受到阻碍。在这里，我们合成了 26 种系统不同的脱氧尿苷和脱氧胞苷衍生的 DAE，并分析了反应量子产率、光稳态的组成、热稳定性和光化学稳定性以及可逆性。该分析确定了两种高性能光电开关，具有近乎定量、完全可逆的来回开关，并且没有可检测到的热或光化学劣化。当掺入具有启动子序列的寡核苷酸时，核苷酸保持其光致变色性，并允许以高达 2.4 倍的关闭因子调节 T7 RNA 聚合酶的转录活性，这证明了光化学控制生物过程的潜力。
• Nucleoside-Based Diarylethene Photoswitches and Their Facile Incorporation into Photoswitchable DNA
  作者：Hana Cahová、Andres Jäschke

  DOI：10.1002/anie.201209943

  日期：2013.3.11

  thien‐3‐yl]cyclopent‐1‐ene (see scheme). Synthesis using an aqueous‐phase Suzuki–Miyaura cross‐coupling allows for one‐step conversion of iodo‐modified oligonucleotides into fully reversible DNA photoswitches.

  揭露：发现嘧啶核苷与2- [2-甲基-5-苯基噻吩-3-基]环戊-1-烯共价连接后，在光照射下会发生快速且可逆的闭环（请参见方案）。使用水相Suzuki-Miyaura交叉偶联进行合成可以将碘修饰的寡核苷酸一步转化为完全可逆的DNA光开关。
• [EN] AN ALL-OPTICAL EXCITONIC SWITCH OPERATED IN LIQUID AND SOLID PHASES<br/>[FR] COMMUTATEUR EXCITONIQUE TOUT OPTIQUE FONCTIONNANT DANS DES PHASES LIQUIDES ET SOLIDES
  申请人：UNIV BOISE STATE

  公开号：WO2020159967A1

  公开（公告）日：2020-08-06

  The present disclosure is directed to an all-optical excitonic switch comprising one or two oligonucleotides that comprises in turn donor/acceptor chromophores and photochromic nucleotide and is assembled with nanometer scale precision using DNA nanotechnology. The disclosed all-optical excitonic switches operate successfully in both liquid and solid phases, exhibiting high ON/OFF switching contrast with no apparent cyclic fatigue. The all-optical excitonic switches disclosed herein have small footprint and volume, low energy requirement, and potential ability to switch at speeds in tens of picosecond.

  本公开涉及一种全光子激子开关，包括一个或两个寡核苷酸，其依次包括供体/受体色素和光致变色核苷酸，并利用DNA纳米技术以纳米尺度精确组装。所披露的全光子激子开关在液态和固态中均能成功运行，具有高的开关对比度，没有明显的循环疲劳。本公开的全光子激子开关具有小的占地面积和体积，低能耗要求，并具有在数十皮秒内切换的潜在能力。
• Reversibly Photoswitchable Nucleosides: Synthesis and Photochromic Properties of Diarylethene-Functionalized 7-Deazaadenosine Derivatives
  作者：Marco Singer、Andres Jäschke

  DOI：10.1021/ja1024782

  日期：2010.6.23

  used this important feature of diarylethenes to shift the switching wavelength from initially 300 nm (1a) to 405 nm (1cH(+)). In a second step, we generated a pair of orthogonal switches, differing enough in their respective switching wavelengths to be controlled independently in the same sample. Finally, a molecular switch was developed that showed both photochromism and acidichromism, thereby illustrating

  光致变色核苷的设计将核酸的结构特征和分子识别特性与二芳基乙烯的光敏性相结合。目标化合物 1a-c 由 7-脱氮杂腺苷单元组成，该单元通过 1,2- 环戊烯基接头连接到作为第二芳基官能团的噻吩。这些核苷类似物经历可逆的电环重排，在紫外线照射下产生强烈的有色闭环异构体，而暴露在可见光下会触发环回复为无色开环形式。UV-vis 光谱、HPLC 和 (1) H NMR 测量显示互补胸苷的识别和高达 97% 的转化为在紫外线照射后热稳定的闭环异构体。发现闭环所需的波长因连接到噻吩部分的取代基而异。在第一个设计步骤中，我们使用二芳基乙烯的这一重要特性将开关波长从最初的 300 nm (1a) 转移到 405 nm (1cH(+))。在第二步中，我们生成了一对正交开关，它们各自的开关波长差异很大，可以在同一样本中独立控制。最后，开发了一种同时显示光致变色和酸性变色的分子开关，从而说明了将光谱特性门控到多种刺激的可能性。
• Photochromism of Diarylethene-Functionalized 7-Deazaguanosines
  作者：Marco Singer、Alexander Nierth、Andres Jäschke

  DOI：10.1002/ejoc.201300261

  日期：2013.5

  In a prior report we introduced a novel class of photochromic nucleosides (PCNs) that combine the structural features of adenine with the photochromic properties of diarylethenes. Herein, we translated this concept to the nucleoside guanosine, generating reversibly switching guanosine-like PCNs. These switches consist of a 7-deazaguanosine unit and a second aryl functionality, which are linked through

  在之前的一份报告中，我们介绍了一类新的光致变色核苷 (PCN)，它结合了腺嘌呤的结构特征和二芳基乙烯的光致变色特性。在这里，我们将这个概念转化为核苷鸟苷，产生可逆转换的鸟苷样 PCN。这些开关由 7-脱氮鸟苷单元和第二个芳基官能团组成，它们通过环戊烯单元连接。用 300 nm 光照射开环异构体会引起周环反应，该反应可以用可见光逆转。除了光刺激外，这些开关还对光无关的刺激做出反应，例如酸的存在或与金属离子的络合。