20-氨基-3,6,9,12,15,18-六氧杂二十烷酸叔丁酯 | 297162-50-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 20-氨基-3,6,9,12,15,18-六氧杂二十烷酸叔丁酯
• 英文名称: tert-butyl 20-amino-3,6,9,12,15,18-hexaoxaeicosanoate
• 英文别名: 20-amino-3,6,9,12,15,18-hexaoxaeicosanoic acid tert-butyl ester；tert-butyl 20-amino-3,6,9,12,15,18-hexaoxicosanoate；NH2CH2CH2(OCH2CH2)5CH2CO2tBu；tert-butyl 2-[amino(hexaethyleneoxy)]acetate；NH2CH2CH2(OCH2CH2)5OCH2CO2-t-Bu；H2N-PEG6-CH2COOtBu；tert-butyl 2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]acetate
• CAS: 297162-50-6
• 化学式: C₁₈H₃₇NO₈
• 分子量: 395.494
• InChiKey: UKWWZGJYUFLISW-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  463.4±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.065±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.94
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

安全信息

• 储存条件：
  2-8°C，应避光、干燥且密封保存。

制备方法与用途

NH₂-PEG₆-C₁-Boc 是一种PROTAC连接子，属于PEG类化合物，可用于合成PROTAC分子。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  20-氨基-3,6,9,12,15,18-六氧杂二十烷酸叔丁酯 在 碳酸氢钠 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 FMOC酰胺-六聚乙二醇-乙酸
  参考文献：
  名称：

  多聚环状RGD肽可作为靶向肿瘤的潜在工具：固相肽合成和化学选择性肟连接。

  摘要：

  alpha v beta 3整合素受体在人类转移和肿瘤诱导的血管生成中起重要作用。靶向该受体可以提供有关肿瘤的受体状态的信息，并可以进行特定的治疗计划。描述了多聚环（-RGDfE-）-肽的固相肽合成，由于多价效应，其提供了增强整联蛋白靶向性的可能性。这些肽含有一个氨基氧基，可进行通用的化学选择性肟连接。与对三甲基锡烷基苯甲醛结合产生放射性碘十二烷甲酰化的前体，这将使它们可用作靶向和成像表达αv beta 3的肿瘤细胞的潜在工具。不需要保护策略并且在温和条件下以高收率获得了缀合物。

  DOI：

  10.1002/chem.200204304
• 作为产物：
  描述：

  六甘醇 在 5percent Pd/C sodium azide 、 三氟化硼乙醚 、 氢气 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 2.25h， 生成 20-氨基-3,6,9,12,15,18-六氧杂二十烷酸叔丁酯
  参考文献：
  名称：

  多聚环状RGD肽可作为靶向肿瘤的潜在工具：固相肽合成和化学选择性肟连接。

  摘要：

  alpha v beta 3整合素受体在人类转移和肿瘤诱导的血管生成中起重要作用。靶向该受体可以提供有关肿瘤的受体状态的信息，并可以进行特定的治疗计划。描述了多聚环（-RGDfE-）-肽的固相肽合成，由于多价效应，其提供了增强整联蛋白靶向性的可能性。这些肽含有一个氨基氧基，可进行通用的化学选择性肟连接。与对三甲基锡烷基苯甲醛结合产生放射性碘十二烷甲酰化的前体，这将使它们可用作靶向和成像表达αv beta 3的肿瘤细胞的潜在工具。不需要保护策略并且在温和条件下以高收率获得了缀合物。

  DOI：

  10.1002/chem.200204304

文献信息

• Amide bond-containing monodisperse polyethylene glycols beyond 10 000 Da
  作者：Zihong Wan、Yu Li、Shaowei Bo、Ming Gao、Xuemeng Wang、Kai Zeng、Xin Tao、Xuefei Li、Zhigang Yang、Zhong-Xing Jiang

  DOI：10.1039/c6ob01286h

  日期：——

  valuable in biomedical applications, their synthesis remains a long-standing challenge. To this end, a peptide-based strategy for such M-PEGs was developed. With macrocyclic sulfates as the key intermediates, a panel of oligoethylene glycol (OEG) containing ω-amino acids were prepared with high efficiency. Through solid phase peptide synthesis (SPPS), these amino acids were conveniently assembled into a series

  尽管大于4000 Da的单分散聚乙二醇（M-PEG）在生物医学应用中特别有价值，但其合成仍然是一项长期的挑战。为此，开发了用于这种M-PEG的基于肽的策略。以大环硫酸盐为主要中间体，高效制备了一组含有ω-氨基酸的低聚乙二醇（OEG）。通过固相肽合成（SPPS），这些氨基酸可以方便地组装成一系列具有酰胺键的M-PEG，在分子量和酰胺密度选择方面具有很高的灵活性。通过这种策略，以克为单位制备了10 262 Da的M-PEG，并在小鼠模型中评估了其生物相容性。
• TARGET PROTEIN EED DEGRADATION-INDUCING DEGRADUCER, PREPARATION METHOD THEREOF, AND PHARMACEUTICAL COMPOSITION FOR PREVENTING OR TREATING DISEASES RELATED TO EED, EZH2, OR PRC2, COMPRISING SAME AS ACTIVE INGREDIENT
  申请人：Korea Research Institute of Chemical Technology

  公开号：EP3922632A1

  公开（公告）日：2021-12-15

  The present invention relates to a target protein degradation-inducing Degraducer, a preparation method thereof, and a pharmaceutical composition for preventing or treating diseases related to EED, EZH2, or PRC2 comprising same as an active ingredient. A novel compound represented by formula 1, according to the present invention is a Degraducer compound that induces degradation of a target protein, i.e., embryonic ectoderm development (EED) or polycomb repressive complex 2 (PRC2), utilizing cereblon E3 ubiquitin ligase, von Hippel-Lindau tumor suppressor (VHL) E3 ubiquitin ligase, mouse double minute 2 homolog (MDM2) E3 ubiquitin ligase, and cellular inhibitor of apoptosis protein 1 (cIAP) E3 ubiquitin ligase, wherein the compound has an aspect of remarkably achieving target protein degradation-inducing activity through a ubiquitin proteasome system (UPS), and therefore there is a useful effect in that it is possible to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating diseases or conditions related to a target protein, and a functional health food composition for preventing or improving same, comprising said compound as an active ingredient.

  本发明涉及一种靶蛋白降解诱导剂Degraducer，其制备方法以及包含其作为活性成分的用于预防或治疗与EED、EZH2或PRC2相关疾病的药物组合物。根据本发明，由式1表示的一种新化合物是一种Degraducer化合物，通过利用cereblon E3泛素连接酶、von Hippel-Lindau肿瘤抑制因子（VHL）E3泛素连接酶、鼠双分钟2同源物（MDM2）E3泛素连接酶和细胞凋亡抑制蛋白1（cIAP）E3泛素连接酶诱导靶蛋白，即胚胎外胚层发育（EED）或多能复合体抑制2（PRC2）的降解，其中该化合物通过泛素蛋白酶体系统（UPS）显著实现靶蛋白降解诱导活性的方面，因此可以提供一种用于预防或治疗与靶蛋白相关疾病或症状的药物组合物，以及包含所述化合物作为活性成分的功能性保健食品组合物，具有有益效果。
• Synthesis of a Series of Oligo(ethylene glycol)-Terminated Alkanethiol Amides Designed to Address Structure and Stability of Biosensing Interfaces
  作者：Sofia Svedhem、Carl-Åke Hollander、Jing Shi、Peter Konradsson、Bo Liedberg、Stefan C. T. Svensson

  DOI：10.1021/jo0012290

  日期：2001.6.1

  oligo(ethylene glycols) with up to 12 units were prepared. Selective monoacylation of the symmetrical tetra- and hexa(ethylene glycol) diols as their mesylates with the use of silver(I) oxide was performed. The synthetic approach was based on carbodiimide couplings of various oligo(ethylene glycol) derivatives to omega-(acetylthio) carboxylic acids via a terminal amino or hydroxyl function. SAM structures on gold

  一系列密切相关的寡聚（乙二醇）末端链烷硫醇酰胺（主要是HS（CH（2））（m）CONH（CH（2）CH（2）O）（n）H; m的合成策略＝ 2、5、11、15，n ＝ 1、2、4、6、8、10、12），并且已经开发出类似的酯。制备这些化合物是为了研究金上自组装单分子膜（SAMs）的结构和稳定性，以期设计出新的生物传感界面。为此，制备了具有多达12个单元的单分散性杂官能低聚（乙二醇）。使用氧化银（I）对对称的四和六（乙二醇）二醇作为甲磺酸酯进行选择性单酰化。合成方法基于各种低聚（乙二醇）衍生物的碳二亚胺通过末端氨基或羟基官能团与ω-（乙酰硫基）羧酸的偶联。研究了金的SAM结构的厚度，润湿性（水接触角约为30度）和构象。对于单层厚度（d）与低聚（乙二醇）链中单元数（n）之间的关系，获得了很好的拟合：d = 2.8n + 21.8（A）。有趣的是，相应的红外光谱分析表明寡聚链的构象从全反式（n =
• Influence of the number and distribution of NLS peptides on the photosensitizing activity of multimeric porphyrin–NLS
  作者：Martha Sibrian-Vazquez、Timothy J. Jensen、M. Graça H. Vicente

  DOI：10.1039/b917280g

  日期：——

  Porphyrin–peptide conjugates bearing multiple nuclear localization sequences (NLS) could show increased tumor cell uptake and affinity for nuclear receptors, and consequently increased photodynamic activity. Previous studies suggest that an increase number of NLS might enhance the nuclear uptake of proteins and other macromolecules. We report the syntheses and investigation of a series of multimeric porphyrin–NLS conjugates bearing two, three or four peptides with the minimum sequence PKKKRKV, linked via PEG or 5-carbon linkers, and with different distributions at the porphyrin periphery. Our results show that the tumor cell uptake and phototoxicity of these conjugates is mainly determined by their amphiphilic character, and not the number of NLS residues per molecule, contrary to previous studies. The mono- and di-substituted photosensitizers bearing one or two PEG linkers and up to three peptide sequences were found to be the most phototoxic toward human carcinoma HEp2 cells, while the tetra-NLS conjugates symmetrically substituted around the porphyrin ring accumulated the least within cells and were non-phototoxic. All conjugates localized intracellularly within endosomal vesicles and lysosomes, probably as a result of an endocytic mechanism of uptake; as a consequence no nuclear uptake was detected by fluorescence microscopy.

  含有多个核定位序列 (NLS) 的卟啉-肽缀合物可能显示出增加的肿瘤细胞摄取和亲核受体能力，从而增强光动力活性。先前研究表明，NLS 数量的增加可能会增强蛋白质和其他大分子的核摄取。我们报道了一系列含有两个、三个或四个最小序列为PKKKRKV的肽的多聚卟啉-NLS缀合物的合成和研究，这些缀合物通过 PEG 或五碳连接体连接，并在卟啉外围具有不同的分布。我们的结果表明，这些缀合物的肿瘤细胞摄取和光毒性主要取决于它们的亲疏水性，而不是每个分子中 NLS 残基的数量，这与之前的研究相反。含有一个或两个 PEG 链接体和最多三个肽序列的单取代和二取代光敏剂对人类癌细胞 HEp2 最具光毒性，而四取代 NLS 結合物在卟啉环上对称地取代，在细胞内积累最少且无光毒性。所有缀合物都定位在细胞内囊泡和溶酶体中，可能是由于内吞机制的摄取结果；因此，荧光显微镜未检测到核摄取。
• Synthesis and cellular studies of PPIX-homing peptide conjugates
  作者：Martha Sibrian-Vazquez、Xiaoke Hu、Timothy J. Jensen、M. Graça H. Vicente

  DOI：10.1142/s1088424612500599

  日期：2012.5

  Five amphiphilic protoporphyrin IX-peptide conjugates bearing the sequences ATWLPPR, AAhexPQRRSARLSA and cERGDPhe conjugated via the propionic side chains, were synthesized and evaluated in vitro using two cell lines: human carcinoma HEp2 and human leukemia HL-60. All conjugates were found to have low dark- and photo-toxicities in both cell lines, and 3 to 10-fold higher accumulation was observed within HL-60 vs. HEp2 cells, depending on the nature of the peptide sequence. The preferential subcellular sites of localization for all conjugates were found to be the lysosomes in HEp2 cells, and the mitochondria in HL-60 cells, suggesting different mechanisms of cellular internalization.

  我们合成了五种两亲性原卟啉 IX-肽共轭物，它们分别含有 ATWLPPR、AAhexPQRRSARLSA 和通过丙酸侧链共轭的 cERGDPhe 序列，并使用两种细胞系（人类癌 HEp2 和人类白血病 HL-60）进行了体外评估。结果发现，所有共轭物在两种细胞系中的暗毒性和光毒性都很低，而且根据肽序列的性质，HL-60 细胞与 HEp2 细胞相比，蓄积量高出 3 到 10 倍。在 HEp2 细胞中，所有共轭物的首选亚细胞定位点是溶酶体，而在 HL-60 细胞中则是线粒体，这表明细胞内化的机制不同。