tert-butyl 20-azido-3,6,9,12,15,18-hexaoxaeicosanoate | 297162-49-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机1,3-偶极化合物 - 烯丙基型1,3-偶极有机化合物
• 英文名称: tert-butyl 20-azido-3,6,9,12,15,18-hexaoxaeicosanoate
• 英文别名: tert-butyl 20-azido-3,6,9,12,15,18-hexaoxicosanoate；tert-butyl 2-[monoazide(hexaethyleneoxy)]acetate；Azido-PEG6-C1-Boc；tert-butyl 2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]acetate
• CAS: 297162-49-3
• 化学式: C₁₈H₃₅N₃O₈
• 分子量: 421.491
• InChiKey: FWZLCXSEDMBOJP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.94
• 拓扑面积：
  96
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  10

安全信息

• 储存条件：
  存储条件：2-8°C，需密封保存并在干燥处存放。

制备方法与用途

Azido-PEG6-C1-Boc是一种PROTAC连接子，属于聚乙二醇（PEG）类化合物，可用于合成PROTAC分子。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl 20-azido-3,6,9,12,15,18-hexaoxaeicosanoate 在 5percent Pd/C 氢气 、 碳酸氢钠 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 氯仿 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 FMOC酰胺-六聚乙二醇-乙酸
  参考文献：
  名称：

  多聚环状RGD肽可作为靶向肿瘤的潜在工具：固相肽合成和化学选择性肟连接。

  摘要：

  alpha v beta 3整合素受体在人类转移和肿瘤诱导的血管生成中起重要作用。靶向该受体可以提供有关肿瘤的受体状态的信息，并可以进行特定的治疗计划。描述了多聚环（-RGDfE-）-肽的固相肽合成，由于多价效应，其提供了增强整联蛋白靶向性的可能性。这些肽含有一个氨基氧基，可进行通用的化学选择性肟连接。与对三甲基锡烷基苯甲醛结合产生放射性碘十二烷甲酰化的前体，这将使它们可用作靶向和成像表达αv beta 3的肿瘤细胞的潜在工具。不需要保护策略并且在温和条件下以高收率获得了缀合物。

  DOI：

  10.1002/chem.200204304
• 作为产物：
  描述：

  六甘醇 在 sodium azide 、 三氟化硼乙醚 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 2.25h， 生成 tert-butyl 20-azido-3,6,9,12,15,18-hexaoxaeicosanoate
  参考文献：
  名称：

  多聚环状RGD肽可作为靶向肿瘤的潜在工具：固相肽合成和化学选择性肟连接。

  摘要：

  alpha v beta 3整合素受体在人类转移和肿瘤诱导的血管生成中起重要作用。靶向该受体可以提供有关肿瘤的受体状态的信息，并可以进行特定的治疗计划。描述了多聚环（-RGDfE-）-肽的固相肽合成，由于多价效应，其提供了增强整联蛋白靶向性的可能性。这些肽含有一个氨基氧基，可进行通用的化学选择性肟连接。与对三甲基锡烷基苯甲醛结合产生放射性碘十二烷甲酰化的前体，这将使它们可用作靶向和成像表达αv beta 3的肿瘤细胞的潜在工具。不需要保护策略并且在温和条件下以高收率获得了缀合物。

  DOI：

  10.1002/chem.200204304

文献信息

• Amide bond-containing monodisperse polyethylene glycols beyond 10 000 Da
  作者：Zihong Wan、Yu Li、Shaowei Bo、Ming Gao、Xuemeng Wang、Kai Zeng、Xin Tao、Xuefei Li、Zhigang Yang、Zhong-Xing Jiang

  DOI：10.1039/c6ob01286h

  日期：——

  valuable in biomedical applications, their synthesis remains a long-standing challenge. To this end, a peptide-based strategy for such M-PEGs was developed. With macrocyclic sulfates as the key intermediates, a panel of oligoethylene glycol (OEG) containing ω-amino acids were prepared with high efficiency. Through solid phase peptide synthesis (SPPS), these amino acids were conveniently assembled into a series

  尽管大于4000 Da的单分散聚乙二醇（M-PEG）在生物医学应用中特别有价值，但其合成仍然是一项长期的挑战。为此，开发了用于这种M-PEG的基于肽的策略。以大环硫酸盐为主要中间体，高效制备了一组含有ω-氨基酸的低聚乙二醇（OEG）。通过固相肽合成（SPPS），这些氨基酸可以方便地组装成一系列具有酰胺键的M-PEG，在分子量和酰胺密度选择方面具有很高的灵活性。通过这种策略，以克为单位制备了10 262 Da的M-PEG，并在小鼠模型中评估了其生物相容性。
• TARGET PROTEIN EED DEGRADATION-INDUCING DEGRADUCER, PREPARATION METHOD THEREOF, AND PHARMACEUTICAL COMPOSITION FOR PREVENTING OR TREATING DISEASES RELATED TO EED, EZH2, OR PRC2, COMPRISING SAME AS ACTIVE INGREDIENT
  申请人：Korea Research Institute of Chemical Technology

  公开号：EP3922632A1

  公开（公告）日：2021-12-15

  The present invention relates to a target protein degradation-inducing Degraducer, a preparation method thereof, and a pharmaceutical composition for preventing or treating diseases related to EED, EZH2, or PRC2 comprising same as an active ingredient. A novel compound represented by formula 1, according to the present invention is a Degraducer compound that induces degradation of a target protein, i.e., embryonic ectoderm development (EED) or polycomb repressive complex 2 (PRC2), utilizing cereblon E3 ubiquitin ligase, von Hippel-Lindau tumor suppressor (VHL) E3 ubiquitin ligase, mouse double minute 2 homolog (MDM2) E3 ubiquitin ligase, and cellular inhibitor of apoptosis protein 1 (cIAP) E3 ubiquitin ligase, wherein the compound has an aspect of remarkably achieving target protein degradation-inducing activity through a ubiquitin proteasome system (UPS), and therefore there is a useful effect in that it is possible to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating diseases or conditions related to a target protein, and a functional health food composition for preventing or improving same, comprising said compound as an active ingredient.

  本发明涉及一种靶蛋白降解诱导剂Degraducer，其制备方法以及包含其作为活性成分的用于预防或治疗与EED、EZH2或PRC2相关疾病的药物组合物。根据本发明，由式1表示的一种新化合物是一种Degraducer化合物，通过利用cereblon E3泛素连接酶、von Hippel-Lindau肿瘤抑制因子（VHL）E3泛素连接酶、鼠双分钟2同源物（MDM2）E3泛素连接酶和细胞凋亡抑制蛋白1（cIAP）E3泛素连接酶诱导靶蛋白，即胚胎外胚层发育（EED）或多能复合体抑制2（PRC2）的降解，其中该化合物通过泛素蛋白酶体系统（UPS）显著实现靶蛋白降解诱导活性的方面，因此可以提供一种用于预防或治疗与靶蛋白相关疾病或症状的药物组合物，以及包含所述化合物作为活性成分的功能性保健食品组合物，具有有益效果。
• Intracellular Protein-Labeling Probes for Multicolor Single-Molecule Imaging of Immune Receptor–Adaptor Molecular Dynamics
  作者：Ryota Sato、Jun Kozuka、Masahiro Ueda、Reiko Mishima、Yutaro Kumagai、Akimasa Yoshimura、Masafumi Minoshima、Shin Mizukami、Kazuya Kikuchi

  DOI：10.1021/jacs.7b08262

  日期：2017.12.6

  multicolor SMI of intracellular proteins is challenging because of high background signals and other limitations of current fluorescence labeling approaches. To achieve reproducible intracellular SMI, a labeling probe ensuring both efficient membrane permeability and minimal non-specific binding to cell components is essential. We developed near-infrared fluorescent probes for protein labeling that specifically

  单分子成像 (SMI) 已被广泛用于研究活细胞中的生物分子动力学和蛋白质 - 蛋白质相互作用。然而，由于高背景信号和当前荧光标记方法的其他限制，细胞内蛋白质的多色 SMI 具有挑战性。为了实现可重复的细胞内 SMI，确保有效的膜通透性和与细胞成分的非特异性结合最小的标记探针是必不可少的。我们开发了用于蛋白质标记的近红外荧光探针，该探针与突变的 β-内酰胺酶标签特异性结合。通过细胞通透性的结构微调和最小化非特异性结合，SiRcB4 与基于 HaloTag 的红色荧光探针结合实现了多色 SMI。在加入亚纳摩尔浓度的两种化学探针后，单分子成像揭示了 TLR4 及其衔接蛋白 TIRAP 的动态，它们参与了先天免疫系统。对动力学中的定量特性和时间推移变化的统计分析揭示了响应配体刺激的蛋白质-蛋白质相互作用。
• Synthesis of a Series of Oligo(ethylene glycol)-Terminated Alkanethiol Amides Designed to Address Structure and Stability of Biosensing Interfaces
  作者：Sofia Svedhem、Carl-Åke Hollander、Jing Shi、Peter Konradsson、Bo Liedberg、Stefan C. T. Svensson

  DOI：10.1021/jo0012290

  日期：2001.6.1

  oligo(ethylene glycols) with up to 12 units were prepared. Selective monoacylation of the symmetrical tetra- and hexa(ethylene glycol) diols as their mesylates with the use of silver(I) oxide was performed. The synthetic approach was based on carbodiimide couplings of various oligo(ethylene glycol) derivatives to omega-(acetylthio) carboxylic acids via a terminal amino or hydroxyl function. SAM structures on gold

  一系列密切相关的寡聚（乙二醇）末端链烷硫醇酰胺（主要是HS（CH（2））（m）CONH（CH（2）CH（2）O）（n）H; m的合成策略＝ 2、5、11、15，n ＝ 1、2、4、6、8、10、12），并且已经开发出类似的酯。制备这些化合物是为了研究金上自组装单分子膜（SAMs）的结构和稳定性，以期设计出新的生物传感界面。为此，制备了具有多达12个单元的单分散性杂官能低聚（乙二醇）。使用氧化银（I）对对称的四和六（乙二醇）二醇作为甲磺酸酯进行选择性单酰化。合成方法基于各种低聚（乙二醇）衍生物的碳二亚胺通过末端氨基或羟基官能团与ω-（乙酰硫基）羧酸的偶联。研究了金的SAM结构的厚度，润湿性（水接触角约为30度）和构象。对于单层厚度（d）与低聚（乙二醇）链中单元数（n）之间的关系，获得了很好的拟合：d = 2.8n + 21.8（A）。有趣的是，相应的红外光谱分析表明寡聚链的构象从全反式（n =
• An easy access to asymmetrically substituted oligoethylene glycols from 18-crown-6
  作者：Polina I. Abronina、Alexander I. Zinin、Anna V. Orlova、Sergey L. Sedinkin、Leonid O. Kononov

  DOI：10.1016/j.tetlet.2013.06.065

  日期：2013.8

  A new route for the preparation of multi-gram quantities of the heterobifunctional oligoethylene glycol (OEG) derivatives (n = 6, 7) is reported based on decyclization of 18-crown-6.

  据报道，基于18-crown-6的脱环作用，制备了多克量的异双功能低聚乙二醇（OEG）衍生物（n  = 6、7 ）的新途径。