苯基丙酰-辅酶A | 117411-09-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: 苯基丙酰-辅酶A
• 英文名称: 3-phenylpropanoyl-CoA
• 英文别名: phenylpropionyl-CoA；phenylpropanoyl-CoA；3-phenylpropionyl-CoA；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 3-phenylpropanethioate
• CAS: 117411-09-3
• 化学式: C₃₀H₄₄N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 899.703
• InChiKey: HYSDRCZPYSOWME-FUEUKBNZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.8
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  对氰基苄胺 、 苯基丙酰-辅酶A 在 N-acyltransferase from Capsicum annuum 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 N-(4-cyanobenzyl)-3-phenylpropanamide
  参考文献：
  名称：

  通用的生物合成方法来形成酰胺键

  摘要：

  通用和可持续的酰胺键形成催化策略的开发是制药行业和更广泛的化学工业的主要目标。在这里，我们报告了一种酰胺合成的生物催化方法，该方法利用了自然界中形成酰胺键的酶，N-酰基转移酶（NAT）和CoA连接酶（CL）的多样性。通过选择具有所需底物特征的NAT和CL的组合，可以以可预测的方式构建非天然的生物催化途径，以允许使用化学计量比的羧酸和胺偶联伙伴以高收率获得结构多样的仲和叔酰胺。可以使用分离的酶在体外或体内进行转化反应仅依赖于细胞产生的辅因子。这些全细胞系统的实用性通过Losmapimod的关键中间体（GW856553X）的制备规模合成得到展示，Losmapimod是一种选择性的p38促分裂原活化蛋白激酶抑制剂。

  DOI：

  10.1039/c8gc01697f
• 作为产物：
  描述：

  3-(4-苯氧基苯基)丙酸 在 氯化亚砜 、 sodium iodide 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 氯仿 、 丙酮 为溶剂， 反应 77.0h， 生成 苯基丙酰-辅酶A
  参考文献：
  名称：

  在水性介质中使用甲基磷酸酯合成辅酶A硫酯†

  摘要：

  辅酶A（CoA）的区域选择性S-酰化作用是在水性条件下使用各种活化的脂族和芳族羧酸作为甲基酰基磷酸酯单酯进行的。与许多疏水性活化基团不同，阴离子甲基酰基磷酸酯混合酸酐与水性溶剂更相容，使其可用于在水性介质中进行酰化反应。

  DOI：

  10.1039/c4ob02079k

文献信息

• Screening and Engineering the Synthetic Potential of Carboxylating Reductases from Central Metabolism and Polyketide Biosynthesis
  作者：Dominik M. Peter、Lennart Schada von Borzyskowski、Patrick Kiefer、Philipp Christen、Julia A. Vorholt、Tobias J. Erb

  DOI：10.1002/anie.201505282

  日期：2015.11.2

  Carboxylating enoyl‐thioester reductases (ECRs) are a recently discovered class of enzymes. They catalyze the highly efficient addition of CO2 to the double bond of α,β‐unsaturated CoA‐thioesters and serve two biological functions. In primary metabolism of many bacteria they produce ethylmalonyl‐CoA during assimilation of the central metabolite acetyl‐CoA. In secondary metabolism they provide distinct

  羧化烯酰硫酯还原酶（ECR）是最近发现的一类酶。它们催化高效添加CO 2与α，β-不饱和CoA-硫酯的双键结合，具有两个生物学功能。在许多细菌的初级代谢中，它们在吸收中央代谢物乙酰辅酶A的过程中会产生乙基丙二酰辅酶A。在次级代谢中，它们提供独特的α-羧基-酰基-硫代酯，以改变许多聚酮化合物天然产物的主链。使用各种可能的底物库系统评估了不同的ECR。我们鉴定了三个活性位点残基，以区分仅限于C4和C5-烯酰基-CoA的ECR和高度混杂的ECR，并成功地设计了一种选定的ECR作为原理证明。这项研究定义了ECR反应性的分子基础，从而可以预测和操纵天然产物多样化中的关键反应。
• [EN] METHOD FOR SYNTHESISING AMIDES<br/>[FR] PROCÉDÉ DE SYNTHÈSE D'AMIDES
  申请人：GLAXOSMITHKLINE IP DEV LTD

  公开号：WO2018029097A1

  公开（公告）日：2018-02-15

  The present invention relates to a method for synthesising amides that is of general applicability. The method may be performed in vitro or in vivo. Cell lines for use in the in vivo methods also form aspects of the invention. The method for synthesising a non-natural amide comprises: a. reaction of a carboxylic acid with a naturally occurring CoA ligase or a variant thereof; and b. reaction of the product of step a with an amine in the presence of a naturally occurring acyltransferase or a variant thereof; with the proviso that where the CoA ligase and acyltransferase are both naturally occurring, they are not derived from the same source species and do not act sequentially in a metabolic pathway; and with the proviso that the non-natural product is not N-(E)-p-coumaroyl-3-hydroxyanthranilic acid or N-(E)-p-caffeoyl-3-hydroxyanthranilic acid. Further, a method for producing an active pharmaceutical ingredient by the aforementioned method and host cells for carrying out said methods are envisaged.

  本发明涉及一种合成酰胺的方法，具有普遍适用性。该方法可以在体外或体内进行。用于体内方法的细胞系也构成本发明的方面之一。合成非天然酰胺的方法包括：a. 将羧酸与天然存在的辅酶A连接酶或其变体反应；b. 在天然存在的酰基转移酶或其变体存在下，将步骤a的产物与胺反应；但辅酶A连接酶和酰基转移酶若均为天然存在，则不能来自相同源物种且不能在代谢途径中依次作用；并且非天然产物不是N-(E)-对香豆酰-3-羟基蒽醌酸或N-(E)-对咖啡酰-3-羟基蒽醌酸。此外，还可以通过上述方法生产活性药物成分的方法和用于执行该方法的宿主细胞。
• ATP Regeneration System in Chemoenzymatic Amide Bond Formation with Thermophilic CoA Ligase
  作者：Chloé M. Lelièvre、Mélanie Balandras、Jean‐Louis Petit、Carine Vergne‐Vaxelaire、Anne Zaparucha

  DOI：10.1002/cctc.201901870

  日期：2020.2.20

  counterparts. To limit the use of ATP, we implemented an ATP regeneration system combining polyphosphate kinase 2 (PPK2 Class III) and inorganic pyrophosphatase. Suitability of this system was illustrated by the lab‐scale chemoenzymatic synthesis of N‐methylbutyrylamide in 77 % yield using low enzyme loading and 5 % molar ATP.

  CoA连接酶是通过腺苷酸中间体分两步催化ATP依赖的辅酶A加成到羧酸的酶。该中间体可通过亲核非酶加成胺而转移，以得到用于合成目的的相应酰胺。为此，我们选择了嗜热性CoA连接酶来研究各种羧酸向其酰胺对应物的转化。为了限制ATP的使用，我们实施了一个ATP再生系统，该系统结合了多磷酸激酶2（PPK2 III类）和无机焦磷酸酶。该系统的适用性通过实验室规模的化学酶法合成N-甲基丁酰酰胺，使用低酶负荷和5％摩尔ATP的产率为77％来说明。
• Establishing a Toolkit for Precursor-Directed Polyketide Biosynthesis: Exploring Substrate Promiscuities of Acid-CoA Ligases
  作者：Maybelle Kho Go、Jeng Yeong Chow、Vivian Wing Ngar Cheung、Yan Ping Lim、Wen Shan Yew

  DOI：10.1021/bi300425j

  日期：2012.6.5

  biosynthesized from acyl-CoA precursors by polyketide synthases. One of the limitations to combinatorial biosynthesis of polyketides has been the lack of a toolkit that describes the means of delivering novel acyl-CoA precursors necessary for polyketide biosynthesis. Using five acid-CoA ligases obtained from various plants and microorganisms, we biosynthesized an initial library of 79 acyl-CoA thioesters by screening

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建
• Uncovering the Formation and Selection of Benzylmalonyl-CoA from the Biosynthesis of Splenocin and Enterocin Reveals a Versatile Way to Introduce Amino Acids into Polyketide Carbon Scaffolds
  作者：Chenchen Chang、Rong Huang、Yan Yan、Hongmin Ma、Zheng Dai、Benying Zhang、Zixin Deng、Wen Liu、Xudong Qu

  DOI：10.1021/jacs.5b00728

  日期：2015.4.1

  polyketide structural diversification. Yet, this scope is currently restricted to simple aliphatic groups due to (1) limited variety of CoA-linked extender units, which lack aromatic structures and chemical reactivity, and (2) narrow acyltransferase (AT) specificity, which is limited to aliphatic CoA-linked extender units. In this report, we uncovered and characterized the first aromatic CoA-linked

  通过生物合成工程选择性修饰碳支架对于聚酮化合物结构多样化很重要。然而，这一范围目前仅限于简单的脂肪族基团，因为 (1) CoA 连接的扩展单元种类有限，缺乏芳香结构和化学反应性，以及 (2) 酰基转移酶 (AT) 特异性窄，仅限于脂肪族 CoA连接的扩展器单元。在本报告中，我们发现并表征了来自链霉菌属中脾脏素和肠毒素的生物合成途径的第一个芳香 CoA 连接的扩展单元苄基丙二酰辅酶 A。CNQ431。其合成采用脱氨/还原羧化策略将苯丙氨酸转化为苄基丙二酰辅酶 A，从而在氨基酸和辅酶 A 连接的扩展单元合成之间建立联系。通过对其选择的表征，我们进一步验证了脾脏的 AT 结构域和抗霉素聚酮化合物合酶能够选择该扩展单元将苯基引入其双内酯支架中。参与形成这种扩展单元的生物合成机制是高度通用的，可以潜在地针对酪氨酸、组氨酸和天冬氨酸进行定制。所公开的芳香族扩展单元、面向氨基酸的合成途径和芳香族选择性 AT