phomopsene | 1119804-68-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: phomopsene
• 英文别名: (1S,2S,9S,10R,14R)-2,6,11,11,14-pentamethyltetracyclo[7.6.0.01,5.010,14]pentadec-5-ene
• CAS: 1119804-68-0
• 化学式: C₂₀H₃₂
• 分子量: 272.474
• InChiKey: WFXPJSKWJXCYJM-TWRRNRRFSA-N

物化性质

• 沸点：
  345.0±9.0 °C(predicted)
• 密度：
  0.97±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.1
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.9
• 拓扑面积：
  0
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  phomopsene 在 氧气 、 臭氧 、 potassium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 16.17h， 生成 1-((1S,3aS,4R,5aS,5bR,8aR,9aS)-3a-hydroxy-1,6,6,8a-tetramethyldodecahydro-1H-dicyclopenta[a,d]pentalen-4-yl)ethan-1-one
  参考文献：
  名称：

  放线菌中的二萜生物合成：关于Cattleyene合酶和Phopopene合酶的研究。

  摘要：

  研究了来自放线菌的三种二萜合酶。来自卡特彼勒链霉菌的第一种酶产生了新型的化合物卡特琳。来自诺卡氏菌诺卡氏菌和鼠李糖诺卡氏菌的另外两种酶被鉴定为光红素合酶。通过与同位素标记的前体的孵育实验，广泛研究了丙二烯合酶的环化机理及其产物的EIMS片段化机理。氧化转化扩大了这些独特的二萜的化学空间。

  DOI：

  10.1002/anie.201902950
• 作为产物：
  描述：

  牛儿基牛儿基焦磷酸三铵盐 在 recombinant glutathione-S-transferase - Phomopsis amygdali phomopsene synthase fusion proteine 作用下， 生成 phomopsene
  参考文献：
  名称：

  生物合成基因为基础的次生代谢物筛选：一种新的二萜，甲基Phomopsenonate，从真菌拟茎点amygdali

  摘要：

  geranylgeranyl二磷酸合酶（GGS）基因的存在是二萜生物合成的基因簇的共同特征。我们证明了使用基于同源性的GGS基因PCR和随后的基因组在真菌扁桃体N2中行走的二萜基因簇的鉴定。通过重组萜烯合酶PaPS的酶促合成提供的新型二萜碳氢化合物红磷烯的结构测定，以及参照磷烯的特征NMR信号筛选真菌肉汤提取物，使我们能够分离出新的双萜，磷甲基膦酸甲酯。关于真菌基因组数据，讨论了未鉴定的二萜基于基因的筛选的多功能性。

  DOI：

  10.1021/jo802319e

文献信息

• Total Syntheses of Polycyclic Diterpenes Phomopsene, Methyl Phomopsenonate, and <i>iso</i>-Phomopsene via Reorganization of C–C Single Bonds
  作者：Jun-Jie Yin、Yun-Peng Wang、Jun Xue、Feng-Fan Zhou、Xing-Qian Shan、Rong Zhu、Kun Fang、Lei Shi、Shu-Yu Zhang、Si-Hua Hou、Wujiong Xia、Yong-Qiang Tu

  DOI：10.1021/jacs.3c07044

  日期：2023.10.4

  The first total syntheses of polycyclic diterpenes phomopsene (1), methyl phomopsenonate (2), and iso-phomopsene (3) have been accomplished through the unusual cascade reorganization of C–C single bonds. This approach features: (i) a synergistic Nazarov cyclization/double ring expansions in one-step, developed by authors, to rapid and stereospecific construction of the 5/5/5/5 tetraquinane scaffold

  通过 C-C 单键的不寻常级联重组，首次全合成了多环二萜 phomopsene ( 1 )、methyl phomopsenenate ( 2 ) 和iso -phomopsene ( 3 )。该方法的特点是：（i）由作者开发的一步协同纳扎罗夫环化/双环扩展，以快速和立体定向构建带有连续四元中心的 5/5/5/5 四奎烷支架；（ii） -通过贝克曼断裂/重组进行战略环扩展，以有效组装目标分子所需的 5/5/6/5 四环骨架1 – 3。这项工作使我们能够确定异磷烯的正确结构实际上是最初指定结构的 C7 差向异构体。最后，通过对映选择性合成确认了三个目标分子的绝对构型。
• Diterpene Biosynthesis in Actinomycetes: Studies on Cattleyene Synthase and Phomopsene Synthase
  作者：Jan Rinkel、Simon T. Steiner、Jeroen S. Dickschat

  DOI：10.1002/anie.201902950

  日期：2019.7

  Three diterpene synthases from actinomycetes have been studied. The first enzyme from Streptomyces cattleya produced the novel compound cattleyene. The other two enzymes from Nocardia testacea and Nocardia rhamnosiphila were identified as phomopsene synthases. The cyclisation mechanism of cattleyene synthase and the EIMS fragmentation mechanism of its product were extensively studied by incubation

  研究了来自放线菌的三种二萜合酶。来自卡特彼勒链霉菌的第一种酶产生了新型的化合物卡特琳。来自诺卡氏菌诺卡氏菌和鼠李糖诺卡氏菌的另外两种酶被鉴定为光红素合酶。通过与同位素标记的前体的孵育实验，广泛研究了丙二烯合酶的环化机理及其产物的EIMS片段化机理。氧化转化扩大了这些独特的二萜的化学空间。
• Biosynthetic Gene-Based Secondary Metabolite Screening: A New Diterpene, Methyl Phomopsenonate, from the Fungus <i>Phomopsis amygdali</i>
  作者：Tomonobu Toyomasu、Akane Kaneko、Tetsuo Tokiwano、Yuya Kanno、Yuri Kanno、Rie Niida、Shigeyoshi Miura、Taiki Nishioka、Chiho Ikeda、Wataru Mitsuhashi、Tohru Dairi、Tomikazu Kawano、Hideaki Oikawa、Nobuo Kato、Takeshi Sassa

  DOI：10.1021/jo802319e

  日期：2009.2.20

  of gene clusters for diterpene biosynthesis. We demonstrated identification of a diterpene gene cluster using homology-based PCR of GGS genes and the subsequent genome walking in the fungus Phomopsis amygdali N2. Structure determination of a novel diterpene hydrocarbon phomopsene provided by enzymatic synthesis with the recombinant terpene synthase PaPS and screening of fungal broth extracts with reference

  geranylgeranyl二磷酸合酶（GGS）基因的存在是二萜生物合成的基因簇的共同特征。我们证明了使用基于同源性的GGS基因PCR和随后的基因组在真菌扁桃体N2中行走的二萜基因簇的鉴定。通过重组萜烯合酶PaPS的酶促合成提供的新型二萜碳氢化合物红磷烯的结构测定，以及参照磷烯的特征NMR信号筛选真菌肉汤提取物，使我们能够分离出新的双萜，磷甲基膦酸甲酯。关于真菌基因组数据，讨论了未鉴定的二萜基于基因的筛选的多功能性。