N,N-dimethyl aminomethylene-2'-3'-O-isopropylidene guanosine | 132459-19-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N,N-dimethyl aminomethylene-2'-3'-O-isopropylidene guanosine
• 英文别名: N,N-dimethylaminomethylene-2',3'-O,O-isopropylideneguanosine；N'-[9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]-N,N-dimethylmethanimidamide
• CAS: 132459-19-9
• 化学式: C₁₆H₂₂N₆O₅
• 分子量: 378.388
• InChiKey: XEUXBOVRHTWSIA-IDTAVKCVSA-N

物化性质

• 熔点：
  >200 °C
• 密度：
  1.62±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  123
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N-dimethyl aminomethylene-2'-3'-O-isopropylidene guanosine 在 四氮唑 、 叔丁基过氧化氢 、 氨 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 9.5h， 生成 O-(5’-guanosine)-O-propargyl monophosphate
  参考文献：
  名称：

  一种化学酶促方法，用于特异性单击修饰的RNA。

  摘要：

  对RNA的单分子分析的兴趣日益增长，这就要求在固相合成RNA的视野之外需要可编程的酶标记策略。在本文中，我们描述了一种简单而通用的化学酶方法，可通过单击化学在其末端或定义的内部位置标记RNA。

  DOI：

  10.1039/c3cc40594j
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 在 高氯酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N,N-dimethyl aminomethylene-2'-3'-O-isopropylidene guanosine
  参考文献：
  名称：

  一种化学酶促方法，用于特异性单击修饰的RNA。

  摘要：

  对RNA的单分子分析的兴趣日益增长，这就要求在固相合成RNA的视野之外需要可编程的酶标记策略。在本文中，我们描述了一种简单而通用的化学酶方法，可通过单击化学在其末端或定义的内部位置标记RNA。

  DOI：

  10.1039/c3cc40594j

文献信息

• Design, Synthesis, and Characterization of Sulfamide and Sulfamate Nucleotidomimetic Inhibitors of hHint1
  作者：Rachit Shah、Alexander Strom、Andrew Zhou、Kimberly M. Maize、Barry C. Finzel、Carston R. Wagner

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.6b00169

  日期：2016.8.11

  tolerance, neuropathic pain, and nicotine dependence. A series of inhibitors were rationally designed, synthesized, and tested for their inhibitory activity against hHint1 using isothermal titration calorimetry (ITC). The studies resulted in the development of the first small-molecule inhibitors of hHint1 with submicromolar binding affinities. A combination of thermodynamic and high-resolution X-ray crystallographic

  由于Hint1参与了广泛的中枢神经系统功能的调节，包括阿片类信号传导，耐受性，神经性疼痛和尼古丁依赖性，因此最近已成为人们关注的重要目标。使用等温滴定量热法（ITC）合理设计，合成了一系列抑制剂，并测试了它们对hHint1的抑制活性。这些研究导致了第一个具有亚微摩尔结合亲和力的hHint1小分子抑制剂的开发。热力学和高分辨率X射线晶体学研究的结合提供了hHint1对配体的生物分子识别的见解。这些新型抑制剂作为分子探针具有潜在用途，可以更好地了解hHint1在中枢神经系统中的作用和功能。
• SULFAMIDE AND SULFAMATE INHIBITORS OF hHint1
  申请人：Wagner Carston R.

  公开号：US20180065965A1

  公开（公告）日：2018-03-08

  Embodiments provide, among things, compounds of the formula I and methods for using such compounds to reduce pain (e.g., neuronal pain), treat a mammal's addiction to nicotine or anti-pain drugs, and increase a mammal's sensitivity to drugs that bind MOR or NMDAR.

  实施例提供了一些化合物I的公式和使用这些化合物来减轻疼痛（例如神经性疼痛）、治疗哺乳动物对尼古丁或镇痛药物的成瘾，并增加哺乳动物对结合MOR或NMDAR的药物的敏感性的方法。
• Modified GSMP Synthesis Greatly Improves the Disulfide Crosslink of T7 Run-Off siRNAs with Cell Penetrating Peptides
  作者：Ute Schepers、Katja Schmitz、Frank Hahn

  DOI：10.1055/s-0030-1259022

  日期：2010.12

  intramolecular cyclization greatly improves 5'-deoxy-5'-thioguanosine monophosphorothioate (GSMP) synthesis and its application as a potent initiator nucleotide for T7 run-off transcription of noncoding RNAs. GSMP was efficiently incorporated into the 5'-end of siRNA sense strands and the resulting thiol-modified siRNA was crosslinked with a free cysteine of cell penetrating peptide Penetratin as monitored

  阻止分子内环化极大地改善了 5'-脱氧-5'-硫代鸟苷单硫代磷酸酯 (GSMP) 的合成及其作为非编码 RNA 的 T7 径流转录的有效起始核苷酸的应用。GSMP 被有效地整合到 siRNA 有义链的 5' 端，所得的硫醇修饰的 siRNA 与细胞穿透肽 Penetratin 的游离半胱氨酸交联，如质谱监测。在原代细胞中评估了肽偶联 siRNA (pepsiRNA) 的细胞摄取和击倒潜力。
• The use of dialkyl acetals in the N-alkylation of 8-oxoadenosine and guanosine. Mechanistic studies and rate determination
  作者：Tewoderos Ayele、Stephanie J. Chang、Marino J.E. Resendiz

  DOI：10.1016/j.tetlet.2015.06.002

  日期：2015.7

  The use of seven N,N-dimethylformamide dialkyl acetals (methyl-, ethyl-, benzyl-, n-propyl-, n-butyl-, t-butyl, and neopentyl-) was explored for the exocyclic amine protection and subsequent N-alkylation of 8-oxoadenosine and guanosine. Reactions occurred in good to modest yields (50-95%) upon addition of heat (60 degrees C) using DMF as solvent. We determined relative rates of reaction and kinetic experiments resulted in the following order: Me >> Bn approximate to t-Bu >> Et approximate to n-Pr approximate to n-Bu > Me (Np, neopentyl). We found that groups that stabilize a pseudo-carbocation intermediate facilitate the completion of the reaction and lead to different reaction pathways, including elimination of isobutylene and ethylene in some cases. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.