7-甲基-6-硫代鸟苷 | 1401777-29-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 7-甲基-6-硫代鸟苷
• 中文别名: 四氯苯酚-13C6
• 英文名称: 2-amino-6-mercapto-7-methylpurine ribonucleoside
• 英文别名: 2-amino-6-mercapto-7-methylpurine riboside；7-methyl-6-thioguanosine；7-methylthioguanosine；MESG；2-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-7-methylpurin-9-ium-6-thiolate
• CAS: 1401777-29-4；55727-10-1
• 化学式: C₁₁H₁₅N₅O₄S
• 分子量: 313.337
• InChiKey: RFHIWBUKNJIBSE-KQYNXXCUSA-N

物化性质

• 熔点：
  >175°C (dec.)
• 溶解度：
  DMF：50 mg/ml； DMSO：30 mg/ml； PBS（pH 7.2）：10 mg/ml

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

制备方法与用途

生物活性方面，7-甲基-6-硫鸟苷（MESG）是一种发色底物，可以用于定量检测无机磷酸盐。此外，7-甲基-6-硫鸟苷也可用于测定嘌呤核苷磷酸化酶的活性。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  7-甲基-6-硫代鸟苷 、 [4-[4-Fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]phenyl] dihydrogen phosphate 在 Mycobacterium tuberculosis phosphatase PtpB 、 purine nucleotide phosphorylase 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 生成 ribose 1-phosphate
  参考文献：
  名称：

  用于鉴定结核分枝杆菌磷酸酶 PtpB 强效抑制剂的基于片段的底物活性筛选方法

  摘要：

  提出了一种用于鉴定新型 PTP 抑制剂的新的基于底物的片段方法。该方法应用于结核分枝杆菌 PtpB，这是治疗结核病的一个有前途的新靶点。这导致了迄今为止报道的最有效的 PtpB 抑制剂 (0.22 μM) 的开发，具有低分子量和对一组其他蛋白酪氨酸磷酸酶的良好选择性。

  DOI：

  10.1021/ja0727520
• 作为试剂：
  描述：

  N-acetyl-D-mannosamine 、 磷烯醇丙酮酸 在 7-甲基-6-硫代鸟苷 、 purine nucleoside phosphorylase 、 Aliivibrio salmonicida sialic acid synthase NeuB₁ 、 manganese(ll) chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 0.08h， 生成 N-acetyl neuraminic acid
  参考文献：
  名称：

  Characterization of the sialic acid synthase from Aliivibrio salmonicida suggests a novel pathway for bacterial synthesis of 7-O-acetylated sialic acids

  摘要：

  解决细菌中产生硅烷酸（Sias）的酶解途径对于了解它们在致病过程中的作用以及随后开发抗感染工具至关重要。由于 Sias 具有高度适用性，可广泛用于医疗应用和人类营养，因此对相关酶进行详细表征也至关重要。产生 Sias 的细菌菌株主要在细胞表面显示 Sias，以模仿动物细胞，从而躲避宿主的免疫系统。尽管进行了多项研究，但人们对鱼类病原体沙门氏菌的致病机制知之甚少。沙门氏菌 LFI1238 的基因组包含一个与大肠杆菌神经氨酸（Neu）基因簇同源的基因簇，该基因簇参与大肠杆菌胶囊中 Sias 的生物合成。该基因簇很可能负责沙门氏菌中 Neu 的生物合成。在这项工作中，我们制备并鉴定了该途径中的关键酶--Sialic 酸（Sia）合成酶 NeuB1。Sia 合成酶是一种通过 N-乙酰甘露胺和磷酸烯醇丙酮酸缩合产生 N-乙酰神经氨酸的酶。根据基因组内容、获得的动力学数据以及结构上的考虑，我们预测来自沙门氏菌、大肠杆菌和无乳链球菌等的 NeuB1 的底物是 4-O-乙酰基-N-乙酰甘露糖胺。这意味着它的酶促反应产物是 7-O-乙酰基-N-乙酰神经氨酸。我们提出了沙门氏菌产生这种 Sia 的途径，并提出了该细菌中存在二乙酰化 Neu 的证据。

  DOI：

  10.1093/glycob/cwt018

文献信息

• Synthesis of a C-phosphonate mimic of maltose-1-phosphate and inhibition studies on Mycobacterium tuberculosis GlgE
  作者：Sri Kumar Veleti、Jared J. Lindenberger、Donald R. Ronning、Steven J. Sucheck

  DOI：10.1016/j.bmc.2013.12.058

  日期：2014.2

  enzyme assay which measures orthophosphate release. The requirement of M1P for the assay necessitated the development of an expedited synthetic route to M1P from an intermediate used in the MCP 13 synthesis. In conclusion, we designed a substrate analogue of M1P that is the first to exhibit Mtb GlgE inhibition.

  广泛耐药结核病 (XDR-TB) 的出现需要确定新的抗结核药物靶点以及更好地了解基本的生物合成途径。GlgE 是一种结核分枝杆菌( Mtb ) 编码的麦芽糖基转移酶，参与 α-葡聚糖生物合成。Mtb中 GlgE 的缺失导致细胞内 M1P 的积累，导致生物体快速死亡。为了抑制 GlgE，麦芽糖-C-膦酸酯 (MCP) 13被设计为 M1P 的等排非水解模拟物。MCP 13，唯一已知的Mtb抑制剂使用 Wittig 烯化作为将麦芽糖转化为所需产品的关键步骤，成功合成了 GlgE。MCP 13抑制Mtb GlgE，IC 50  = 230 ± 24 μM，使用测量正磷酸盐释放的偶联酶测定法测定。M1P 用于测定需要开发一条从 MCP 13合成中使用的中间体到 M1P 的快速合成路线。总之，我们设计了 M1P 的底物类似物，它是第一个表现出Mtb GlgE 抑制的。
• Synthesis and Evaluation of <scp>l</scp>-Rhamnose 1C-Phosphonates as Nucleotidylyltransferase Inhibitors
  作者：Matthew W. Loranger、Stephanie M. Forget、Nicole E. McCormick、Raymond T. Syvitski、David L. Jakeman

  DOI：10.1021/jo401542s

  日期：2013.10.4

  experiments were performed using water-ligand observed binding via gradient spectroscopy (WaterLOGSY) NMR for known sugar nucleotide substrates and selected phosphonate analogues. IC50 values were measured and Ki values were calculated for inhibitors. New insights were gained into the binding promiscuity of enzymes within the prokaryotic l-rhamnose biosynthetic pathway (Cps2L, RmlB–D) and into the mechanism

  我们报道了一系列具有不同氟化程度的1-鼠李糖支架的膦酸酯和酮糖膦酸酯的合成。这些化合物被评估为潜在的α - d-葡萄糖1-磷酸胸苷基转移酶（Cps2L）抑制剂，这是肺炎链球菌1-鼠李糖生物合成中的第一种酶，也是一种新型的抗生素靶标。酶-底物和酶-抑制剂结合实验是使用水-配体通过梯度光谱法（WaterLOGSY）NMR观察到的已知糖核苷酸底物和选定的膦酸酯类似物的结合而进行的。测量IC 50值并测定K i计算抑制剂的值。对原核生物l-鼠李糖生物合成途径（Cps2L，RmlB–D）中酶的结合混杂性以及该系列中最有效的抑制剂l-鼠李糖1C-膦酸酯的抑制机理有了新的认识。
• Nucleotidylation of unsaturated carbasugar in validamycin biosynthesis
  作者：Jongtae Yang、Hui Xu、Yirong Zhang、Linquan Bai、Zixin Deng、Taifo Mahmud

  DOI：10.1039/c0ob00475h

  日期：——

  Validamycin A is a member of microbial-derived C7N-aminocyclitol family of natural products that is widely used as crop protectant and the precursor of the antidiabetic drug voglibose. Its biosynthetic gene clusters have been identified in several Streptomyces hygroscopicus strains, and a number of genes within the clusters have been functionally analyzed. Of these genes, valB, which encodes a sugar nucleotidyltransferase, was found through inactivation study to be essential for validamycin biosynthesis, but its role was unclear. To characterize the role of ValB in validamycin biosynthesis, four carbasugar phosphate analogues were synthesized and tested as substrate for ValB. The results showed that ValB efficiently catalyzes the conversion of valienol 1-phosphate to its nucleotidyl diphosphate derivatives, whereas other unsaturated carbasugar phosphates were found to be not the preferred substrate. ValB requires Mg2+, Mn2+, or Co2+ for its optimal activity and uses the purine-based nucleotidyltriphosphates (ATP and GTP) more efficiently than the pyrimidine-based NTPs (CTP, dTTP, and UTP) as nucleotidyl donor. ValB represents the first member of unsaturated carbasugar nucleotidyltransferases involved in natural products biosynthesis. Its characterization not only expands our understanding of aminocyclitol-derived natural products biosynthesis, but may also facilitate the development of new tools for chemoenzymatic synthesis of carbohydrate mimetics.

  Validamycin A 是源自微生物的 C7N-aminocyclitol 天然产物家族中的一员，被广泛用作作物保护剂和抗糖尿病药物伏格列波糖的前体。已在多个吸水链霉菌株中发现了其生物合成基因簇，并对基因簇中的一些基因进行了功能分析。在这些基因中，通过灭活研究发现编码糖核苷酸转移酶的 ValB 是有效霉素生物合成所必需的，但其作用尚不清楚。为了确定 ValB 在有效霉素生物合成中的作用，研究人员合成了四种碳糖磷酸类似物，并将其作为 ValB 的底物进行了测试。结果表明，ValB 能有效催化缬烯醇 1- 磷酸酯向其核苷酸二磷酸衍生物的转化，而其他不饱和碳糖磷酸酯并非其首选底物。ValB 需要 Mg2+、Mn2+ 或 Co2+ 才能达到最佳活性，它使用嘌呤型核苷酸三磷酸酯（ATP 和 GTP）作为核苷酸供体的效率要高于嘧啶型 NTP（CTP、dTTP 和 UTP）。ValB 是参与天然产物生物合成的不饱和碳糖核苷酸转移酶的第一个成员。对它的鉴定不仅拓展了我们对氨环糖醇衍生天然产物生物合成的了解，还有助于开发化学合成碳水化合物模拟物的新工具。