[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxothieno[3,2-d]pyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate | 1176747-58-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxothieno[3,2-d]pyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 1176747-58-2
• 化学式: C₁₁H₁₅N₂O₁₅P₃S
• 分子量: 540.232
• InChiKey: VVYMMYQBMNAPMR-DAGMQNCNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.7
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  287
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxothieno[3,2-d]pyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate 、 胞苷-5’-三磷酸 、 5’-三磷酸腺苷 、 Guanosine 5'-triphosphate 在 T₇ RNA polymerase 、 亚精胺 、 乙二胺四乙酸 、 3'-ATT ATG CTG AGT GAT ATC GCG GCA CGT-5' 、 5'-TAA TAC GAC TCA CTA TAG-3' 、 三羟甲基氨基甲烷盐酸盐 、 sodium chloride 、 magnesium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 12.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  发射性嘧啶核糖核苷酸的酶促掺入

  摘要：

  发射：T7 RNA 聚合酶结合一系列噻吩修饰的三磷酸尿苷 (UTP) 类似物来生成发射 RNA 转录本。标记实验表明，该酶经常在掺入位置暂停，当掺入确实发生时，T7 RNA 聚合酶无法延长修饰的寡核苷酸并产生中止的转录本。TP=三磷酸盐。

  DOI：

  10.1002/asia.200800370

文献信息

• Enzymatic Incorporation of Emissive Pyrimidine Ribonucleotides
  作者：Seergazhi G. Srivatsan、Yitzhak Tor

  DOI：10.1002/asia.200800370

  日期：2009.3.2

  Making an emission: T7 RNA polymerase incorporates a series of thiophene‐modified uridine triphosphate (UTP) analogues to generate emissive RNA transcripts. Labeling experiments suggested that the enzyme frequently pauses at the incorporation position and, when incorporation does take place, T7 RNA polymerase fails to elongate the modified oligonucleotides and yields aborted transcripts. TPs=triphosphates

  发射：T7 RNA 聚合酶结合一系列噻吩修饰的三磷酸尿苷 (UTP) 类似物来生成发射 RNA 转录本。标记实验表明，该酶经常在掺入位置暂停，当掺入确实发生时，T7 RNA 聚合酶无法延长修饰的寡核苷酸并产生中止的转录本。TP=三磷酸盐。