5-(2-hydroxyethyl)-2,3,3-trimethyl-3H-indole | 228272-75-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 5-(2-hydroxyethyl)-2,3,3-trimethyl-3H-indole
• 英文别名: 5-hydroxyethyl-2,3,3-trimethylindolenine；2-(2,3,3-Trimethylindol-5-yl)ethanol
• CAS: 228272-75-1
• 化学式: C₁₃H₁₇NO
• 分子量: 203.284
• InChiKey: CWCJPZKTUSKCRG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  32.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(2-hydroxyethyl)-2,3,3-trimethyl-3H-indole 在 sodium azide 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 硫酸 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 苯 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 5-(2-azidoethyl)-1,3,3-trimethyl-2-methyleneindoline
  参考文献：
  名称：

  Rational design, synthesis, and characterization of highly fluorescent optical switches for high-contrast optical lock-in detection (OLID) imaging microscopy in living cells

  摘要：

  control of cellular processes. These studies require microscope imaging techniques and associated optical probes that provide high-contrast and high-resolution images of specific proteins and their complexes. Auto-fluorescence however, can severely compromise image contrast and represents a fundamental limitation for imaging proteins within living cells. We have previously shown that optical switch probes and optical lock-in detection (OLID) image microscopy improve image contrast in high background environments. Here, we present the design, synthesis, and characterization of amino-reactive and cell permeable optical switches that integrate the highly fluorescent fluorophore, tetramethylrhodamine (TMR) and spironaphthoxazine (NISO), a highly efficient optical switch. The NISO moiety in TMR-NISO undergoes rapid and reversible, excited-state driven transitions between a colorless Spiro (SP)-state and a colored merocyanine (MC)-state in response to irradiation with 365 and >530 nm light. In the MC-state, the TMR (donor) emission is almost completely extinguished by Forster resonance energy transfer (FRET) to the MC probe (acceptor), whereas in the colorless SP-state, the quantum yield for TMR fluorescence is maximal. Irradiation of TMR-NISO with a defined sequence of 365 and 546 nm manipulates the levels of SP and MC with concomitant modulation of FRET efficiency and the TMR fluorescence signal. High fidelity optical switching of TMR fluorescence is shown for TMR-NISO probes in vitro and for membrane permeable TMR-NISO within living cells. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2010.07.015
• 作为产物：
  描述：

  3-甲基-2-丁酮 、 4-hydrazinophenethyl alcohol 在 potassium acetate 、 溶剂黄146 作用下， 反应 2.5h， 以8%的产率得到5-(2-hydroxyethyl)-2,3,3-trimethyl-3H-indole
  参考文献：
  名称：

  Rigidized trimethine cyanine dyes

  摘要：

  揭示了对目标材料赋予荧光特性有用的三亚甲基青霉素染料的类似物，通过共价和非共价结合。这些化合物具有以下一般公式：1可选地由基团R2-R9取代其中基团R6、R7、R8和R9附着在含有X和Y的环上，或者可选地附着在Za和Zb结构的原子上，基团R1-R9被选择以为荧光化合物提供所需的溶解性、反应性和光谱特性；A从O、S和NR11中选择，其中R11是取代氨基自由基：2其中R′从氢、C1-4烷基和芳基中选择，R″从C1-18烷基、芳基、杂环芳基、具有2-7个碳原子的酰基自由基和硫代氨基自由基中选择；Za和Zb各自代表一个键或完成一个、两个融合或三个融合的芳香环所需的原子，每个环有五个或六个原子，选自碳原子，并且可选地不超过两个氧、氮和硫原子。

  公开号：

  US20030224391A1

文献信息

• METHODS TO INCREASE THE PHOTOSTABILITY OF DYES
  申请人：Hahn Klaus

  公开号：US20110046000A1

  公开（公告）日：2011-02-24

  The presently disclosed subject matter provides dyes having an improved photostability, biosensors comprising such dyes, and methods of use thereof, including methods for detecting target molecules in a sample under test and for live-cell imaging. The dyes can include a binding member, including a biomolecule or fragments thereof, which can interact with target molecules of interest and can be specific to a given conformational state or covalent modification, e.g., phosphorylation, of the target molecule. The presently disclosed dyes can be used for detecting changes in the binding, conformational change, or posttranslational modification of the target molecule.

  所述主题提供了具有改善光稳定性的染料、包括此类染料的生物传感器以及其使用方法，包括用于检测样品中的靶分子和用于活细胞成像的方法。该染料可以包括结合成员，包括生物分子或其片段，其可以与感兴趣的靶分子相互作用，并且可以特定于给定的构象状态或靶分子的共价修饰，例如磷酸化。目前披露的染料可用于检测靶分子的结合、构象变化或后翻译修饰的变化。
• RIGIDIZED TRIMETHINE CYANINE DYES
  申请人：CARNEGIE MELLON UNIVERSITY

  公开号：EP1042407B1

  公开（公告）日：2001-09-12
• US6133445A
  申请人：——

  公开号：US6133445A

  公开（公告）日：2000-10-17
• US6686145B1
  申请人：——

  公开号：US6686145B1

  公开（公告）日：2004-02-03
• US7408062B2
  申请人：——

  公开号：US7408062B2

  公开（公告）日：2008-08-05