Fmoc-N-(2,4-二甲氧基苄基)-Gly-OH | 166881-42-1

• 物质功能分类: 有机原料
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: Fmoc-N-(2,4-二甲氧基苄基)-Gly-OH
• 中文别名: FMOC-N-(2,4-二甲氧基苄基)-GLY-OH；2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)(2,4-二甲氧苄基)氨基)乙酸；FMOC-N-(2,4-二甲氧基苄基)-甘氨酸
• 英文名称: Fmoc-(Dmb)Gly-OH
• 英文别名: Fmoc-N-(2,4-dimethoxybenzyl)-Gly-OH；2-[(2,4-dimethoxyphenyl)methyl-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)amino]acetic acid
• CAS: 166881-42-1
• 化学式: C₂₆H₂₅NO₆
• 分子量: 447.488
• InChiKey: UIDQSTVPYKMCEY-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  653.2±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.280±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  85.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  | 存储条件 | 温度: 2-8℃，环境: 惰性气体 | | --- | --- |

制备方法与用途

N-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-N-(2,4-二甲氧基苄基)甘氨酸是一种甘氨酸（HY-Y0966）的衍生物。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-羟基苯并三唑 、 Fmoc-N-(2,4-二甲氧基苄基)-Gly-OH 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N-甲基吡咯烷酮 为溶剂， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  2,2'-二吡啶基二硫化物介导的噻唑烷开环反应在糖蛋白合成中的应用：evasin-3的全化学合成

  摘要：

  噻唑烷开环反应是通过顺序天然化学连接策略进行蛋白质化学合成的关键步骤之一。我们最近开发了一种新的噻唑烷与 2,2'-二吡啶基二硫化物 (DPDS) 的开环反应。为了研究该反应对糖蛋白合成的适用性，我们合成了 evasin-3，这是一种富含半胱氨酸的糖蛋白，具有最初在蜱唾液中发现的趋化因子结合能力。evasin-3的序列分为三个片段，这些片段分别用普通固相肽合成方法合成。在第一次连接中间和 C 端片段后，用作中间片段 N 端 Cys 残基保护基的噻唑烷用 DPDS 转化为 Cys。在这个噻唑烷开环反应中，N-连接的聚糖部分。在与 N 端片段的第二次连接和重折叠反应后，可以以良好的收率获得 evasin-3。合成的 evasin-3 显示出对 CXCL 趋化因子的特异性结合能力。这些结果清楚地表明这种 DPDS 方法可用于糖蛋白合成。

  DOI：

  10.1002/psc.3290
• 作为产物：
  描述：

  2,4-二甲氧基苯甲醛 在 三乙酰氧基硼氢化钠 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 18.5h， 生成 Fmoc-N-(2,4-二甲氧基苄基)-Gly-OH
  参考文献：
  名称：

  A combined solid- and solution-phase approach provides convenient access to analogues of the calcium-dependent lipopeptide antibiotics

  摘要：

  一种将固相和溶液相技术结合的合成路线可以快速制备达托霉素类似物。

  DOI：

  10.1039/c3ob42238k

文献信息

• Synthesis of ‘difficult’ peptides free of aspartimide and related products, using peptoid methodology
  作者：Sotir Zahariev、Corrado Guarnaccia、Csaba I. Pongor、Luca Quaroni、Maša Čemažar、Sándor Pongor

  DOI：10.1016/j.tetlet.2006.04.074

  日期：2006.6

  We developed an efficient, cost effective strategy for Fmoc-based solid phase synthesis of ‘difficult’ peptides and/or peptides containing Asp/Asn-Gly sequences, free of aspartimide and related products, using a peptoid methodology for the preparation of N-substituted glycines.

  我们开发了一种基于Fmoc的固相合成高效，低成本的策略，使用拟肽方法制备N-取代的“困难”肽和/或含有Asp / Asn-Gly序列的肽，且不含天冬酰胺和相关产物。甘氨酸。
• Protection of .PSI.(CH2NH) Peptide Bond with 2,4-Dimethoxybenzyl Group in Solid-Phase Peptide Synthesis.
  作者：Yusuke SASAKI、Junko ABE

  DOI：10.1248/cpb.45.13

  日期：——

  The reductive alkylation of a resin-bound amine by the Boc-amino aldehyde/NaBH3CN method is accompanied with undesirable double alkylation at Xaaψ(CH2NH)Gly sequences. To prevent the double alkylation, the utility of the 2, 4-dimethoxybenzyl (Dmb) group for secondary amine protection was investigated. By using this group, Leu-enkephalin and dynorphin (1-8) analogs containing the ψ(CH2NH) peptide bond between residues Tyr1/Gly2 or Gly2/Gly3 were synthesized in high yields.

  树脂结合胺的还原烷基化通过Boc-氨基醛/NaBH3CN方法进行时，伴随有不希望的双烷基化发生在Xaaψ(CH2NH)Gly序列上。为了防止双烷基化，研究了2,4-二甲氧基苯基（Dmb）基团在保护二级胺中的应用。使用该基团合成了包含ψ(CH2NH)肽键的Leu-内啡肽和dynorphin（1-8）类似物，其残基为Tyr1/Gly2或Gly2/Gly3，并且产率很高。
• Synthesis of N-linked glycopeptides via solid-phase aspartylation
  作者：Trent Conroy、Katrina A. Jolliffe、Richard J. Payne

  DOI：10.1039/c003673k

  日期：——

  An efficient strategy for the preparation of N-linked glycopeptides is described. The method relies on the use of side chain protecting groups on aspartic acid residues, namely the allyl and Dmab esters, which are orthogonal to those utilised in Fmoc-strategy SPPS. After peptide assembly these protecting groups were selectively removed and the resulting free side chains derivatised with a glycosylamine to afford a resin bound glycopeptide bearing a native N-linkage. Initially, N-linked glycopeptides were successfully synthesised according to this strategy, however, yields varied substantially depending on the nature of the amino acid residue situated adjacent (C-terminal) to the putative glycosylation site. This was due to generation of substantial quantities of aspartimide by-products. Aspartimide formation was overcome by incorporation of a 2,4-dimethoxybenzyl (Dmb) backbone amide protecting group on the residue adjacent to an allyl- or Dmab-protected aspartic acid residue. N-linked glycopeptides were prepared in excellent yield after the solid-phase aspartylation reactions. The utility and orthogonality of the allyl and Dmab ester solid-phase approaches were exploited in the preparation of an N-linked glycodecapeptide bearing two different carbohydrate moieties. This exemplified the efficiency of the solid-phase methodology for the preparation of glycopeptides bearing various combinations of N-linked glycans.

  描述了一种高效的制备N-连接糖肽的策略。该方法依赖于在天冬氨酸残基上使用侧链保护基团，具体为丙烯基和Dmab酯，这些保护基团与Fmoc策略固相合成中使用的保护基团是正交的。在肽组装后，这些保护基团被选择性去除，并将得到的自由侧链与糖苷胺衍生化，以获得带有天然N-连接的树脂结合糖肽。最初，N-连接糖肽根据该策略成功合成，然而，产率因位于假定糖基化位点相邻（C末端）的氨基酸残基的性质而有显著变化。这是由于生成了大量天冬酰亚胺副产物。通过在靠近丙烯基或Dmab保护的天冬氨酸残基的残基上引入2,4-二甲氧基苄基（Dmb）主链酰胺保护基团，可以克服天冬酰亚胺的形成。在固相天冬酰化反应后，N-连接糖肽的产量极为优秀。利用丙烯基和Dmab酯固相方法的实用性和正交性，制备了带有两种不同碳水化合物基团的N-连接糖肽。这 exemplified了固相方法在制备带有各种N-连接糖组合的糖肽方面的高效性。
• Efficient Chemical Protein Synthesis using Fmoc‐Masked N‐Terminal Cysteine in Peptide Thioester Segments
  作者：Abhisek Kar、Jamsad Mannuthodikayil、Sameer Singh、Anamika Biswas、Puneet Dubey、Amit Das、Kalyaneswar Mandal

  DOI：10.1002/anie.202000491

  日期：2020.8.24

  protein synthesis by fully convergent and one‐pot native chemical ligations utilizing the fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) moiety as an N‐masking group of the N‐terminal cysteine of the middle peptide thioester segment(s). The Fmoc group is stable to the harsh oxidative conditions frequently used to generate peptide thioesters from peptide hydrazide or o‐aminoanilide. The ready availability of Fmoc‐Cys(Trt)‐OH

  我们报告了一种操作简单的方法，通过利用芴甲氧羰基（Fmoc）部分作为中间肽硫酯片段的N末端半胱氨酸的N掩蔽基团，通过完全会聚和一锅法天然化学连接来促进化学蛋白质合成。 Fmoc 基团对常用于从肽酰肼或邻氨基苯胺生成肽硫酯的严酷氧化条件保持稳定。 Fmoc-Cys(Trt)-OH 常用于 Fmoc 固相肽合成，其中 Fmoc 基团预先安装在半胱氨酸残基上，可随时使用，最大限度地减少临时保护 N 末端所需的额外步骤半胱氨酰肽。连接后，在室温水性条件下，短时间暴露于 pH 11 的 20% 哌啶（<7 分钟），即可轻松去除 Fmoc 基团。随后的天然化学连接反应可以在哌啶存在下在 pH 7 的同一溶液中进行。
• [EN] SYNTHETIC METHOD OF BIVALIRUNDIN<br/>[FR] PROCÉDÉ DE SYNTHÈSE DE BIVALIRUNDINE
  申请人：SHANGHAI SPACE PEPTIDES PHARMACEUTICAL CO LTD

  公开号：WO2019241903A1

  公开（公告）日：2019-12-26

  The Active Pharmaceutical Ingredient (API), Bivalirudin, is a 20 amino acid peptide containing one basic and 5 amino acid residues. With a chemical formula of C98H138N24O33 and a molecular weight of 2180.3 g/mol. Bivalirudin is also known as Angiomax. It is a direct thrombin inhibitor indicated for use as an anticoagulant. It provides a method for synthesizing bivalirudin and in particular to the synthetic method of bivalirudin by solid phase peptide synthesis using Fmoc-Leu-Wang resin as a carrier. The method has the advantages of high yield, less by-product and simple separation and purification, and it's time gaining than the prior art, and is suitable for pilot and industrial production.

  活性药用成分（API）比瓦利鲁丁（Bivalirudin）是一种含有20个氨基酸的肽，其中包含一个碱性和5个氨基酸残基。其化学式为C98H138N24O33，分子量为2180.3克/摩尔。比瓦利鲁丁也被称为Angiomax。它是一种直接凝血酶抑制剂，用于作为抗凝剂。它提供了一种合成比瓦利鲁丁的方法，特别是通过使用Fmoc-Leu-Wang树脂作为载体的固相肽合成方法。该方法具有高产率、少副产物、简单分离和纯化的优点，比先前的技术节省时间，并适用于试验和工业生产。