methyl (benzyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate | 57777-97-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: methyl (benzyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate
• 英文别名: methyl (2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-4-hydroxy-2-phenylmethoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylate
• CAS: 57777-97-6
• 化学式: C₁₉H₂₇NO₉
• 分子量: 413.425
• InChiKey: RBYASKWXZPHFPT-DWYCWXKBSA-N

物化性质

• 熔点：
  80-82°C
• 溶解度：
  可溶于氯仿、甲醇

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (benzyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate 在 N-碘代丁二酰亚胺 、 三氟甲磺酸 、 3 A molecular sieve 、 camphor-10-sulfonic acid 、 溶剂黄146 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 、 丙酮 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Enhanced Sialylating Activity of O-Chloroacetylated 2-Thioethyl Sialosides

  摘要：

  研究表明，O-氯乙酰保护基团显著提高了2-巯乙基唾液酸苷在α(2-8)-唾液酸化模型反应中的活性。乙基4,7,8,9-四-O-氯乙酰-3,5-二脱氧-2-硫-5-三氟乙酰胺基-d-甘油-α-d-半乳糖-壬-2-烯呋喃糖苷结合了吸电子的O-氯乙酰和N-三氟乙酰保护基团，展现出最佳的反应活性，并实现了Neu5Acα(2-8)Neu5Ac二聚体的最高效合成。通过使用这种唾液酸供体，以分步方式合成了GD3四糖，尽管其产率明显低于单糖受体的模型唾液酸化反应。

  DOI：

  10.1055/s-2005-868514
• 作为产物：
  描述：

  N-acetyl-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-2-chloro-2-deoxyneuraminic acid methyl ester 在 4 A molecular sieve 、 sodium methylate 、 silver perchlorate 、 silver carbonate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 methyl (benzyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate
  参考文献：
  名称：

  Enhanced Sialylating Activity of O-Chloroacetylated 2-Thioethyl Sialosides

  摘要：

  研究表明，O-氯乙酰保护基团显著提高了2-巯乙基唾液酸苷在α(2-8)-唾液酸化模型反应中的活性。乙基4,7,8,9-四-O-氯乙酰-3,5-二脱氧-2-硫-5-三氟乙酰胺基-d-甘油-α-d-半乳糖-壬-2-烯呋喃糖苷结合了吸电子的O-氯乙酰和N-三氟乙酰保护基团，展现出最佳的反应活性，并实现了Neu5Acα(2-8)Neu5Ac二聚体的最高效合成。通过使用这种唾液酸供体，以分步方式合成了GD3四糖，尽管其产率明显低于单糖受体的模型唾液酸化反应。

  DOI：

  10.1055/s-2005-868514

文献信息

• Synthesis of sialic acid derivatives as ligands for the myelin-associated glycoprotein (MAG)
  作者：Sachin V. Shelke、Gan-Pan Gao、Stefanie Mesch、Heiko Gäthje、Soerge Kelm、Oliver Schwardt、Beat Ernst

  DOI：10.1016/j.bmc.2007.04.038

  日期：2007.7

  The trisaccharide substructure 13 of the ganglioside GQ1b alpha shows a remarkable affinity for the myelin-associated glycoprotein (MAG). In the search for structurally simplified and pharmacokinetically improved mimics of 13, sialosides with modifications at the reducing and non-reducing end were synthesized. The biological evaluation of mimics 12a-o was performed in a competitive target-based assay. It was found that the relative inhibitory potency (rIP) of antagonist 12h was enhanced by more than 1000-fold in comparison to the reference trisaccharide 13, despite the former having a much simpler structure. In addition, the sialic acid derivatives, for example, 12h, have clearly improved pharmacokinetic properties due to the presence of aromatic moieties, a lower molecular weight, and a reduced number of polar hydroxy functions compared to the reference compound 13. (c) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Enhanced Sialylating Activity of O-Chloroacetylated 2-Thioethyl Sialosides
  作者：Yury E. Tsvetkov、Nikolay E. Nifantiev

  DOI：10.1055/s-2005-868514

  日期：——

  It has been shown that O-chloroacetyl protecting groups enhance significantly sialylating activity of 2-thioethyl sialosides in model reactions of α(2-8)-sialylation. Ethyl 4,7,8,9-tetra-O-chloroacetyl-3,5-dideoxy-2-thio-5-trifluoroacetamido-d-glycero-α-d-galacto-non-2-ulopyranoside that combines electron-withdrawing O-chloroacetyl and N-trifluoroacetyl protecting groups displayed the best reactivity and enabled the most efficient synthesis of the Neu5Acα(2-8)Neu5Ac dimer. The GD3 tetrasaccharide was synthesized in stepwise manner using this sialyl donor in the key (2-8)-coupling, albeit the yield was noticeably lower than in the model sialylation of monosaccharide acceptors.

  研究表明，O-氯乙酰保护基团显著提高了2-巯乙基唾液酸苷在α(2-8)-唾液酸化模型反应中的活性。乙基4,7,8,9-四-O-氯乙酰-3,5-二脱氧-2-硫-5-三氟乙酰胺基-d-甘油-α-d-半乳糖-壬-2-烯呋喃糖苷结合了吸电子的O-氯乙酰和N-三氟乙酰保护基团，展现出最佳的反应活性，并实现了Neu5Acα(2-8)Neu5Ac二聚体的最高效合成。通过使用这种唾液酸供体，以分步方式合成了GD3四糖，尽管其产率明显低于单糖受体的模型唾液酸化反应。