O6-苄基鸟苷 | 4552-61-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: O6-苄基鸟苷
• 英文名称: 6-O-benzylguanosine
• 英文别名: 2-amino-6-benzyloxy-9-β-D-ribofuranosylpurine；O⁶-benzylguanosine；O6-Benzyl Guanosine；(2R,3R,4S,5R)-2-(2-amino-6-phenylmethoxypurin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 4552-61-8
• 化学式: C₁₇H₁₉N₅O₅
• 分子量: 373.368
• InChiKey: LWYXQHQQWVZSOQ-XNIJJKJLSA-N

物化性质

• 熔点：
  135-141°C
• 沸点：
  762.3±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.70±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于DMSO、甲醇（少量）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O6-苄基鸟苷 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 sodium acetate 、 溶剂黄146 、 potassium iodide 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 25.0~40.0 ℃ 、202.65 kPa 条件下， 反应 78.0h， 生成 N²,3-Ethenoguanosine
  参考文献：
  名称：

  N2,3-etheno-2'-deoxyguanosine [8,9-dihydro-9-oxo-2'-deoxy-3-.beta.-D-ribofuranosylimidazo[2,1-b]purine]: a practical synthesis and characterization

  摘要：

  The literature methods for the syntheses of N2,3-etheno-2'-deoxyguanosine (1a) and its 5'-O-phosphate are associated with very low overall yields. We now describe a route starting in the riboside series that permits the production of 1a in practical quantities and has allowed its complete chemical characterization for the first time. O6-Benzylguanosine (6b) when treated with bromoacetaldehyde under conditions of continuous buffering gives the N2,3-etheno derivative 7b in 48% yield. The 3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxa-1,3-diyl) derivative (8b, 89 % yield) of 7b when allowed to react with phenyl chlorothionoformate led to the corresponding 2' ester (10,50%). 2'-Deoxygenation of 10 by the Barton procedure then afforded 65% of 11, and deprotection of the latter (Bu4N+F-) gave 12 quantitatively. Catalytic hydrogenation of 12 then produced pure la in 86% yield. Stability studies on la have confirmed its exquisite sensitivity to acid and demonstrated its relative stability to alkali and the other reagents used in automated DNA synthesis (phosphoramidate method).

  DOI：

  10.1021/jo00061a033
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 在 4-二甲氨基吡啶 、 四乙基氯化铵 、 氨 、 N,N-二甲基苯胺 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 、 苯甲醇 为溶剂， 生成 O6-苄基鸟苷
  参考文献：
  名称：

  Reaction of arylnitrenium ions with guanine derivatives: N¹-methylguanosine and N²,N²-dimethylguanosine

  摘要：

  一项先前的闪光光解研究表明，芳基亚硝基离子与2'-脱氧鸟苷直接反应时产生了第二个中间体，随着瞬态亚硝基离子与核苷反应，这个中间体逐渐增加。这个中间体被确定为亚硝基离子加成到鸟嘌呤的C-8位置形成的产物，在失去C-8质子之前形成的C-8中间体。C-8中间体的一个特征是它存在酸碱形式。这种行为在光谱分析和速率-pH曲线中都很明显，速率-pH曲线显示在pH 4左右出现了从pH无关反应到首级H⁺反应的转变。本研究旨在确定共轭碱形式的结构。这涉及对由2-芴亚硝基离子与N¹-甲基鸟嘌呤和N²,N²-二甲基鸟嘌呤反应产生的C-8中间体衰减的动力学研究。其理论基础是前者无法失去N-1质子，而后者无法在NH₂基团上去质子。速率-pH曲线清楚地显示N-1质子是酸性的。N²,N²-二甲基鸟嘌呤的C-8中间体的速率常数显示与2'-脱氧鸟嘌呤和鸟嘌呤相关的向共轭碱形式转变的下降变化。相比之下，N¹-甲基鸟嘌呤中间体的速率常数与pH无关。还报告了形成C-8中间体的反应速率常数。这些结果表明，芳基亚硝基离子与N²,N²-二甲基鸟嘌呤衍生物的反应速度明显更快（除非反应受扩散控制）。这与芳基亚硝基离子和鸟嘌呤的反应的初始步骤发生在C-8位置的直接加成一致。在这种反应中产生的正电荷可以共轭到C-2位置，π给体如NH₂和NMe₂可以发挥稳定作用。关键词：亚硝基、芳基亚硝基、鸟苷、DNA加合物。

  DOI：

  10.1139/v01-179

文献信息

• <i>O</i>⁶-(Alkyl/aralkyl)guanosine and 2‘-Deoxyguanosine Derivatives:  Synthesis and Ability To Enhance Chloroethylnitrosourea Antitumor Action
  作者：Emmanuelle Mounetou、Eric Debiton、Catherine Buchdahl、Daniel Gardette、Jean-Claude Gramain、Jean-Claude Maurizis、Annie Veyre、Jean-Claude Madelmont

  DOI：10.1021/jm960881d

  日期：1997.8.1

  A series of O6-(alkyl/aralkyl)guanosines and 2'-deoxyguanosine analogs extended to peracetyl and N2-acetyl derivatives, potentially water soluble, was synthesized. Each was associated with N'-(2-chloroethyl)-N-[2-(methylsulfonyl)ethyl]-N'-nitrosourea for in vitro evaluation on M4Beu melanoma cells of their ability to enhance the cytotoxic effect of this chloroethylnitrosourea, which is frequently reduced

  合成了一系列O6-（烷基/芳烷基）鸟苷和2'-脱氧鸟苷类似物，它们扩展到可能具有水溶性的全乙酰基和N2-乙酰基衍生物。每个都与N'-（2-氯乙基）-N- [2-（甲基磺酰基）乙基] -N'-亚硝基脲相关，以体外评估M4Beu黑色素瘤细胞增强该氯代乙基亚硝基脲的细胞毒性作用的能力。通常通过O6-烷基鸟嘌呤-DNA-烷基转移酶进行的修复而减少。结构活性分析表明，（i）苄基和4-卤代苄基是提供显着活性所需的O6-取代基，（ii）2'-脱氧鸟苷衍生物比鸟苷类似物具有更高的效力，（iii）乙酰化，尤其是在N2上位置，通常会产生具有中等能力的化合物，但可能会阻止此类核苷掺入DNA。因此，O6-（4-碘苄基）-N2-乙酰鸟苷（3b）和O6-苄基过乙酰基-2'-脱氧鸟苷（2a）以及O6-苄基-N2-乙酰鸟苷（1b）和O6-苄基-N2-乙酰基到目前为止，水溶性最高的-2'-脱氧鸟苷（2b）具有良好的特性，可用于通过静脉途径进行的进一步体内试验。
• pH-Sensitive O6-Benzylguanosine Polymer Modified Magnetic Nanoparticles for Treatment of Glioblastomas
  作者：Zachary R. Stephen、Rachel N. Gebhart、Mike Jeon、Allison A. Blair、Richard G. Ellenbogen、John R. Silber、Miqin Zhang

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.6b00545

  日期：2017.1.18

  delivery of chemotherapeutics has demonstrated potential in improving anticancer efficacy by increasing serum half-life and providing tissue specificity and controlled drug release to improve biodistribution of hydrophobic chemotherapeutics. However, suboptimal drug loading, particularly for solid core nanoparticles (NPs), remains a challenge that limits their clinical application. In this study we formulated

  纳米粒子介导的化学疗法的递送已显示出通过增加血清半衰期并提供组织特异性和受控的药物释放以改善疏水性化学疗法的生物分布来改善抗癌功效的潜力。然而，特别是对于固体核心纳米颗粒（NP）而言，次优的药物负载仍然是限制其临床应用的挑战。在这项研究中，我们配制了一个用pH敏感的O 6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶（MGMT）抑制剂类似物，二醛修饰的O 6聚合物包裹的NP。-苄基鸟苷（DABGS）可实现高载药量，而聚乙二醇（PEG）可改善水溶性并保持NP稳定性。基本的纳米载体由涂有酰肼官能化PEG（IOPH）的氧化铁核（9 nm）组成。DABGS和PEG-二酰肼通过快速不稳定的冻融催化方法通过酸不稳定的zone键在氧化铁纳米颗粒表面（IOPH-pBGS）上聚合。DABGS聚合反应已通过FTIR进行了确认，并通过UV-vis光谱进行了定量。IOPH-pBGS表现出出色的载药量，为33.4±5.1重量％，同时保持了小尺寸（36
• Chemically modified single-stranded RNA-editing oligonucleotides
  申请人：ProQR Therapeutics II B.V.

  公开号：US10941402B2

  公开（公告）日：2021-03-09

  The invention relates to antisense oligonucleotides that are capable of bringing about specific editing of a target nucleotide (adenosine) in a target RNA sequence in a eukaryotic cell, wherein said oligonucleotide does not, in itself, form an intramolecular hairpin or stem-loop structure, and wherein said oligonucleotide comprises a non-complementary nucleotide in a position opposite to the nucleotide to be edited in the target RNA sequence.

  本发明涉及能够对真核细胞中靶 RNA 序列中的靶核苷酸（腺苷）进行特异性编辑的反义寡核苷酸，其中所述寡核苷酸本身不形成分子内发夹结构或茎环结构，并且所述寡核苷酸包括位于与靶 RNA 序列中待编辑核苷酸相对位置的非互补核苷酸。
• Syntheses of 5‘-Deoxy-5‘-<i>N</i>-hydroxylaminopyrimidine and Purine Nucleosides:  Building Blocks for Novel Antisense Oligonucleosides with Hydroxamate Linkages
  作者：Hui Li、Marvin J. Miller

  DOI：10.1021/jo991153b

  日期：1999.12.1
• Synthesis and properties of N2,3-ethenoguanosine and N2,3-ethenoguanosine 5'-diphosphate
  作者：Jaroslaw T. Kusmierek、David E. Jensen、Sylvia J. Spengler、Ryszard Stolarski、B. Singer

  DOI：10.1021/jo00388a007

  日期：1987.6