9-cis-Retinoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: 9-cis-Retinoate
• 英文别名: (2E,4E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-9-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)nona-2,4,6,8-tetraenoate
• 化学式: C20H27O2-
• 分子量: 299.4
• InChiKey: SHGAZHPCJJPHSC-ZVCIMWCZSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.9
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  40.1
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  9-顺式视黄醛 、 水 、 nicotinamide adenine dinucleotide 生成 9-cis-Retinoate 、 氢(+1)阳离子 、 NADH
  参考文献：
  名称：

  具有9-顺-视网膜活性的人醛脱氢酶（ALDH）的cDNA克隆和表达以及大鼠直向同源物ALDH12的鉴定。

  摘要：

  该报道描述了从大鼠肾脏中分离出具有视网膜脱氢酶活性的迄今未表征的醛脱氢酶（ALDH），以及编码和表达其人直向同源物的cDNA的克隆和表达，以前未知的ALDH12。人ALDH12 cDNA预测有487个残基的蛋白质，具有23个不变氨基酸，四个保守区，辅因子结合基序（G（209）XGX（3）G）和代表成员的活性位点半胱氨酸残基（Cys（287））的ALDH超家族。在将9-顺式视网膜转化为类视色素X受体配体9-顺式视黄酸方面，ALDH12似乎至少与两个先前鉴定的具有9-顺式视网膜脱氢酶活性的ALDH一样有效（V（m）/ K（m）），大鼠视网膜脱氢酶（RALDH）1和RALDH2。但是，ALDH12在9-顺式视网膜上的活性比全反式视网膜高40倍，而RALDH1和RALDH2的等效效率分别是9-顺式视网膜和全反式视网膜的4倍左右，并且效率要低约4倍。因此，ALDH12是第一个相对于全反式视网膜优先显

  DOI：

  10.1074/jbc.m008027200

文献信息

• A novel isoenzyme of aldehyde dehydrogenase specifically involved in the biosynthesis of 9-<i>cis</i> and all-<i>trans</i> retinoic acid
  作者：J Labrecque、F Dumas、A Lacroix、P V Bhat

  DOI：10.1042/bj3050681

  日期：1995.1.15

  The pleiotropic effects of retinoids are mediated by two families of nuclear receptors: RAR (retinoic acid receptors) and RXR (retinoid X receptors). 9-cis-Retinoic acid is a specific ligand for RXR receptors, whereas either 9-cis- or all-trans-retinoic acid activates the RAR receptor family. The existence of RXRs suggests a new role for isomerization in the biology of retinoic acid. We report here the identification of an aldehyde dehydrogenase in the rat kidney that catalysed the oxidation of 9-cis- and all-trans-retinal to corresponding retinoic acids with high efficiency, 9-cis-retinal being 2-fold more active than all-trans-retinal. Based on several criteria, such as amino acid sequence, pH optimum, and inhibition by chloral hydrate, this enzyme was found to be a novel isoenzyme of aldehyde dehydrogenase. 9-cis-Retinol, the precursor for the biosynthesis of 9-cis-retinal was identified in the rat kidney. The occurrence of endogenous 9-cis-retinol and the existence of specific dehydrogenase which participates in the catalysis of 9-cis-retinal suggest that all-trans-retinoi(d) isomerization to 9-cis-retinoi(d) occurs at the retinol level, analogous to all-trans-retinol isomerization to 11-cis-retinol in the visual cycle.

  维甲酸的多效性作用是通过两个家族的核受体介导的：RAR（维甲酸受体）和RXR（维甲酸X受体）。9-顺-维甲酸是RXR受体的特异性配体，而9-顺-或全反-维甲酸则激活RAR受体家族。RXR的存在表明异构化在维甲酸生物学中有新的作用。我们在这里报道了在大鼠肾脏中鉴定的一种醛脱氢酶，它以高效率催化9-顺-和全反-视黄醛的氧化为相应的维甲酸，其中9-顺-视黄醛的活性比全反-视黄醛高2倍。根据多种标准，例如氨基酸序列，pH最适值和氯醛的抑制，发现这种酶是一种新的醛脱氢酶同工酶。在大鼠肾脏中鉴定了9-顺-视黄醇，它是9-顺-视黄醛生物合成的前体。存在内源性的9-顺-视黄醇和特异的脱氢酶参与9-顺-视黄醛的催化，表明全反-维甲酸异构化为9-顺-维甲酸发生在视黄醇水平上，类似于全反-视黄醇异构化为11-顺-视黄醇在视觉循环中发生的情况。
• Characterization of the Cytochrome P450 CYP2J4: Expression in Rat Small Intestine and Role in Retinoic Acid Biotransformation from Retinal
  作者：Qing-Yu Zhang、Gregory Raner、Xinxin Ding、Deborah Dunbar、Minor J. Coon、Laurence S. Kaminsky

  DOI：10.1006/abbi.1998.0654

  日期：1998.5

  The sites of expression in the small intestine and the function of CYP2J4, a recently identified rat cytochrome (P450) isoform found to be predominantly expressed in the small intestine, were characterized. Immunoblot analysis with a polyclonal antibody to heterologously expressed CYP2J4 revealed that expression of CYP2J4 was at the highest level in the distal duodenum and jejunum and decreased toward

  表征了小肠中的表达位点和CYP2J4的功能，CYP2J4是一种最近发现的大鼠细胞色素（P450）同种型，被发现主要在小肠中表达。用针对异源表达的CYP2J4的多克隆抗体进行的免疫印迹分析表明，CYP2J4的表达在十二指肠远端和空肠中最高，并向回肠降低。绒毛细胞表达的CYP2J4水平高于隐窝细胞。亚型特异性RNA聚合酶链反应表明，相关的P450亚型CYP2J3在大鼠小肠中只是次要形式。由于肠粘膜暴露于高水平的饮食营养中，我们假设CYP2J4可能对饮食衍生的因子有活性。我们确定是纯净的 异源表达的CYP2J4在重构系统中对全反式和9-顺式视网膜具有活性，产生相应的视黄酸作为主要产物。视黄酸形成的表观K（m）值分别为54和49 microM，表观Vmax值分别为20和21 nmol / min / nmol P450。这些活性容易被多克隆抗CYP2J4抗体抑制。在NADPH存在的情况下，大鼠肠上
• cDNA Cloning and Expression of a Human Aldehyde Dehydrogenase (ALDH) Active with 9-cis-Retinal and Identification of a Rat Ortholog, ALDH12
  作者：Min Lin、Joseph L. Napoli

  DOI：10.1074/jbc.m008027200

  日期：2000.12

  heretofore uncharacterized aldehyde dehydrogenase (ALDH) with retinal dehydrogenase activity from rat kidney and the cloning and expression of a cDNA that encodes its human ortholog, the previously unknown ALDH12. The human ALDH12 cDNA predicts a 487-residue protein with the 23 invariant amino acids, four conserved regions, cofactor binding motif (G(209)XGX(3)G), and active site cysteine residue (Cys(287))

  该报道描述了从大鼠肾脏中分离出具有视网膜脱氢酶活性的迄今未表征的醛脱氢酶（ALDH），以及编码和表达其人直向同源物的cDNA的克隆和表达，以前未知的ALDH12。人ALDH12 cDNA预测有487个残基的蛋白质，具有23个不变氨基酸，四个保守区，辅因子结合基序（G（209）XGX（3）G）和代表成员的活性位点半胱氨酸残基（Cys（287））的ALDH超家族。在将9-顺式视网膜转化为类视色素X受体配体9-顺式视黄酸方面，ALDH12似乎至少与两个先前鉴定的具有9-顺式视网膜脱氢酶活性的ALDH一样有效（V（m）/ K（m）），大鼠视网膜脱氢酶（RALDH）1和RALDH2。但是，ALDH12在9-顺式视网膜上的活性比全反式视网膜高40倍，而RALDH1和RALDH2的等效效率分别是9-顺式视网膜和全反式视网膜的4倍左右，并且效率要低约4倍。因此，ALDH12是第一个相对于全反式视网膜优先显
• Cloning of monkey RALDH1 and characterization of retinoid metabolism in monkey kidney proximal tubule cells
  作者：Helene Brodeur、Isabelle Gagnon、Sylvie Mader、Pangala V. Bhat

  DOI：10.1194/jlr.m200359-jlr200

  日期：2003.2

  the oxidation of all-trans, 9-cis, and 13-cis retinal. Northern blot analysis of JTC12 RNAs and cloning by reverse transcription-polymerase chain reaction demonstrated expression of a monkey homolog of RALDH1. Bacterially expressed JTC12 RALDH1 catalyzed conversion of all three retinal isomers, with a higher catalytic efficiency for 9-cis retinal than for all-trans and 13-cis retinal. Accordingly, live

  全反式和9-顺式视黄酸充当视黄酸受体（RAR和RXR）的配体，它们是依赖配体的转录因子，在发育和细胞分化中起重要作用。几种视网膜脱氢酶可能有助于体内全反式和9-顺式RA的产生，但是它们在不同组织中的各自作用仍然很差。我们先前已经从肾脏组织中鉴定并克隆了大鼠视网膜脱氢酶1型（RALDH1），该酶可高效氧化全反式和9-顺式视网膜，但对13-顺式视网膜无效。在这里，我们表征了猴子JTC12细胞中的视网膜氧化活性，这些细胞来自肾脏近端小管。细胞裂解物的体外测定揭示了NAD +依赖性脱氢酶的存在，该酶催化全反式，9-顺式和13-顺式视网膜的氧化。JTC12 RNA的Northern印迹分析和通过逆转录-聚合酶链反应的克隆显示了RALDH1猴同源物的表达。细菌表达的JTC12 RALDH1催化了所有三种视网膜异构体的转化，其中9-顺式视网膜的催化效率高于全反式和13-顺式视网膜。因此，活的JTC12比