S-phenyl 4,6-O-benzylidene-β-D-thiomannopyranoside

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: S-phenyl 4,6-O-benzylidene-β-D-thiomannopyranoside
• 英文别名: phenyl 4,6-O-benzylidene-1-thio-β-D-mannopyranoside；(2R,4aR,6S,7S,8R,8aS)-2-phenyl-6-phenylsulfanyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxine-7,8-diol
• 化学式: C₁₉H₂₀O₅S
• 分子量: 360.431
• InChiKey: BDNIQCYVYFGHSI-RRQVMCLOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.34
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  3.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  68.15
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  S-phenyl 4,6-O-benzylidene-β-D-thiomannopyranoside 在 吡啶 、 三氟甲磺酸酐 、 二正丁基氧化锡 、 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 23.75h， 生成 phenyl 3-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-trichloroacetamido-1-thio-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  全合成荧光假单胞菌O特异多糖的三糖重复单元BIM B-582

  摘要：

  报道了荧光假单胞菌BIM B-582的O-特异性多糖的三糖重复单元的第一全合成。这种高效的合成涉及连续1,2-顺式的糖基化包括β-升-rhamnosylation和α选择性稀有4-脱氧的耦合d -木糖-hexose作为关键步骤。合成的三糖在还原端配有一个氨基丙基接头，以便与蛋白质和微阵列结合，以进行进一步的免疫学研究。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.8b02669
• 作为产物：
  描述：

  苯甲醛二甲缩醛 、 phenyl 1-thio-β-D-mannopyranoside 在 camphor-10-sulfonic acid 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以71%的产率得到S-phenyl 4,6-O-benzylidene-β-D-thiomannopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Disarming, non-participating 2-O-protecting groups in manno- and rhamnopyranosylation: scope and limitations of sulfonates, vinylogous esters, phosphates, cyanates, and nitrates

  摘要：

  A series of D-mannopyranosyl and L-rhamnopyranosyl thioglycosides; protected with electron-withdrawing non-participating protecting groups on O-2 have been prepared and investigated for their potential as beta-glycosyl donors. Both alpha- and beta-thioglycosides were investigated and the latter preferred on the grounds of enhanced stability at room temperature. A 2-O-nitro-L-rhamnosyl fluoride was also prepared and investigated. Moderate beta-selectivities were observed with some of these donors. With the more powerfully electron-withdrawing groups reduced donor reactivity leads to a requirement for higher reaction temperatures and reduced selectivities. Decomposition temperatures of the intermediate glycosyl triflates were determined by variable temperature NMR spectroscopy and generally correlate with the disarming propensity of the protecting group system. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tetasy.2004.11.032

文献信息

• A target oriented expeditious approach towards synthesis of certain bacterial rare sugar derivatives
  作者：Aritra Chaudhury、Rina Ghosh

  DOI：10.1039/c6ob02670b

  日期：——

  discovery and carbohydrate based vaccine development. The principal bacterial atypical sugar derivatives include 2-acetamido-4-amino-2,4,6-trideoxy-D-galactose (AAT), 2,4-diacetamido-2,4,6-trideoxy-D-galactose (DATDG) and N-acetylfucosamine (FucNAc). Herein, a highly streamlined protocol leading to the aforesaid derivatives is presented. The highlights of the method lie in radical mediated 6-deoxygenation along

  在多种致病细菌菌株的细胞表面多糖中发现了细菌稀有的氨基脱氧糖，但在人体代谢中却不存在。这有助于病原体和宿主细胞之间的分化，可用于靶标特异性药物发现和基于碳水化合物的疫苗开发。主要的细菌非典型糖衍生物包括2-乙酰氨基-4-氨基-2,4,6-三苯氧基-D-半乳糖（AAT），2,4-二乙酰氨基-2,4,6-三苯氧基-D-半乳糖（DATDG）和N-乙酰岩藻糖胺（FucNAc）。在此，提出了导致上述派生的高度精简的协议。该方法的亮点在于自由基介导的6-脱氧以及对适当衍生化的一锅式保护曲线操作D-葡萄糖胺或D-甘露糖基序，以获得重要的奎诺氨基葡糖苷或鼠李糖苷，由它们以多样性导向的方式合成了稀有的糖衍生物。
• Single‐Step Glycosylations with ¹³ C‐Labelled Sulfoxide Donors: A Low‐Temperature NMR Cartography of the Distinguishing Mechanistic Intermediates
  作者：Andrés G. Santana、Laura Montalvillo‐Jiménez、Laura Díaz‐Casado、Enrique Mann、Jesús Jiménez‐Barbero、Ana M. Gómez、Juan Luis Asensio

  DOI：10.1002/chem.202003850

  日期：2021.1.26

  of the reaction intermediates formed in this more complex scenario have comparatively received minimal attention. Herein, a systematic NMR‐based study employing both 13C‐labelled and unlabelled glycosyl sulfoxide donors for the detection and monitoring of marginally populated intermediates is reported. The results conclusively show that glycosyl triflates play a key role in these glycosylations despite

  糖基亚砜在复杂寡糖的全合成中得到了认可，并作为解剖相关机理的模型底物。这些供体的反应通常在预活化条件下进行，但据报道，实验上更方便的单步操作是在受体醇存在下进行活化。然而，在这种更复杂的情况下形成的反应中间体的性质和普遍程度受到的关注相对较少。在此，一项基于NMR的系统研究同时采用了13种方法据报道，有C标记和未标记的糖基亚砜供体可用于检测和监测边缘人群的中间体。结果最终表明，尽管存在受体醇，但是糖基三氟甲磺酸酯在这些糖基化中起关键作用。重要的是，共价供体/受体sulf加合物的形成被认为是主要的竞争反应，因此揭示了受体的非生产性消耗会限制反应产率。
• Exploring the Far Side of Glycosyl Sulfoxide Activation Process
  作者：Wei Chen、Pinru Wu、Jing Zeng、Jing Fang、Zhiwen Liao、Lei Cai、Hao Wang、Lingkui Meng、Qian Wan

  DOI：10.1002/cjoc.202200706

  日期：2023.2.15

  an extensive series of studies, the precise mechanism of this powerful glycosylation is still not fully understood. To address these 30-year puzzles, the far side of Kahne glycosylation is explored in this study. After a series of control and tracking experiments, a number of important intermediates including glycosyl oxo-sulfonium ion and sulfenic anhydride (Crich's intermediate) are suggested to be

  Kahne 糖基化的发现使碳水化合物化学向前迈进了一大步。尽管进行了一系列广泛的研究，但这种强大的糖基化作用的确切机制仍未完全了解。为了解决这些 30 年的难题，本研究探索了 Kahne 糖基化的另一面。经过一系列的控制和跟踪实验，一些重要的中间体包括糖基氧代硫离子和亚磺酸酐（Crich 中间体）被认为是复杂反应途径的原因。它还表明，除了传统的离子糖基化途径外，一种新的自由基途径很可能有助于产生各种副产物和副产物。这项研究提供了对 Kahne 糖基化的进一步了解，
• Anomeric Triflates versus Dioxanium Ions: Different Product-Forming Intermediates from 3-Acyl Benzylidene Mannosyl and Glucosyl Donors
  作者：Wouter A. Remmerswaal、Hidde Elferink、Kas J. Houthuijs、Thomas Hansen、Floor ter Braak、Giel Berden、Stefan van der Vorm、Jonathan Martens、Jos Oomens、Gijsbert A. van der Marel、Thomas J. Boltje、Jeroen D. C. Codée

  DOI：10.1021/acs.joc.3c02262

  日期：2024.2.2

  on their reactivity and the stereochemical outcome of their glycosylation reactions. Here, we used a combination of systematic glycosylation reactions, the characterization of potential reactive intermediates, and in-depth computational studies to study the disparate behavior of glycosylation systems involving benzylidene glucosyl and mannosyl donors. While these systems have been studied extensively

  糖基供体结构中的最小结构差异可能对其反应性和糖基化反应的立体化学结果产生巨大影响。在这里，我们结合了系统糖基化反应、潜在反应中间体的表征和深入的计算研究来研究涉及亚苄基葡萄糖基和甘露糖基供体的糖基化系统的不同行为。虽然这些系统已被广泛研究，但对于 3- O-苄基/苯甲酰甘露糖和葡萄糖供体系统之间观察到的差异，还没有令人满意的解释。这些供体可用的不同反应途径的势能表面为看似非常相似的系统的对比行为提供了解释。已提供证据证明亚苄基甘露糖基 1,3-二恶鎓离子的中介作用，而类似的 1,3-葡萄糖基二恶鎓离子的形成则受到 C-2-O-苄基与C-5质子向过渡态移动，其中葡萄糖环采用B 2,5 -构象。这项研究解释了 1,3-二恶鎓离子在甘露糖基系统中的中介作用，并回答了为什么这些离子不是由类似的葡萄糖基供体形成的。
• Total Synthesis of <i>Vibrio Cholerae</i> O43 Tetrasaccharide Repeating Unit
  作者：Kabita Pradhan、Ankita Paul、Diksha Rai、Amar Kumar Mishra、Preeti Balhara、Suvarn S. Kulkarni

  DOI：10.1021/acs.joc.3c02886

  日期：2024.3.15

  unit (RU) of V. cholerae O43 is decorated with less-explored rare deoxy amino sugars like d-quinosamine and d-viosamine, along with a rare amino acid, N-acetyl-l-allothreonine. Herein, we report a detailed account of the total synthesis of V. cholerae O43 tetrasaccharide RU. In our earlier attempt, while a one-pot assembly of trisaccharide was successful, the final coupling with a fully functionalized

  霍乱弧菌是导致致命流行病——霍乱的病原体。不同霍乱弧菌菌株表面存在的聚糖被认为是潜在的候选疫苗。霍乱弧菌O43 的四糖重复单元 (RU) 装饰有较少探索的稀有脱氧氨基糖，如d-奎诺胺和d-维维糖胺，以及稀有氨基酸N-乙酰基-l-别苏氨酸。在此，我们详细报道了霍乱弧菌O43 四糖 RU 的全合成。在我们早期的尝试中，虽然三糖的一锅组装是成功的，但与完全功能化的d-维奥胺供体的最终偶联产率较低。成功的路线涉及使用 Fmoc 保护的d-维糖胺结构单元作为供体以及四糖的后期酰胺键形成。