methyl (2S,4S)-N-tert-buthoxycarbonyl-4-trifluoromethylprolinate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (2S,4S)-N-tert-buthoxycarbonyl-4-trifluoromethylprolinate
• 英文别名: cis 1-(tert-butyl) 2-methyl (2S)-4-(trifluoromethyl)pyrrolidine-1,2-dicarboxylate；1-(tert-butyl) 2-methyl (2S,4S)-4-(trifluoromethyl)pyrrolidine-1,2-dicarboxylate；(2S,4S)-1-tert-butyl 2-methyl 4-(trifluoromethyl)pyrrolidine-1,2-dicarboxylate；1-O-tert-butyl 2-O-methyl (2S,4S)-4-(trifluoromethyl)pyrrolidine-1,2-dicarboxylate
• 化学式: C₁₂H₁₈F₃NO₄
• 分子量: 297.274
• InChiKey: BIBYRUVESDZUDY-YUMQZZPRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  55.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (2S,4S)-N-tert-buthoxycarbonyl-4-trifluoromethylprolinate 在 三氟乙酸 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 丙酮 为溶剂， 反应 33.0h， 生成 （2S，4S）-Fmoc-4-三氟甲基吡咯烷-2-羧酸
  参考文献：
  名称：

  γ-（S）-三氟甲基脯氨酸：评估为脯氨酸在固态（19）F-NMR肽研究中的结构替代物。

  摘要：

  γ-（4S）-三氟甲基脯氨酸是根据改良的文献方法合成的，具有改进的产率（以克为单位）。使用N-乙酰基甲基酯模型表征了由氨基酸形成的酰胺键的构象性质。发现异构化的酰胺族（s-反式对s-顺式）和热力学参数与完整脯氨酸的相应值相似。因此，对于通过（19）F-NMR进行结构研究，γ-三氟甲基脯氨酸被认为是肽中结构上低干扰的脯氨酸取代。确实，在肽抗生素短杆菌肽S中天然脯氨酸换成γ-三氟甲基脯氨酸被证明保留了整个两亲性肽结构。

  DOI：

  10.1039/c5ob00034c
• 作为产物：
  描述：

  N-Boc-反式-4-羟基-L-脯氨酸甲酯 在 吡啶 、 氯化亚砜 、 5%-palladium/activated carbon 、 四丁基氟化铵 、 氢气 、 三氧化硫吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 46.33h， 生成 methyl (2S,4S)-N-tert-buthoxycarbonyl-4-trifluoromethylprolinate
  参考文献：
  名称：

  γ-（S）-三氟甲基脯氨酸：评估为脯氨酸在固态（19）F-NMR肽研究中的结构替代物。

  摘要：

  γ-（4S）-三氟甲基脯氨酸是根据改良的文献方法合成的，具有改进的产率（以克为单位）。使用N-乙酰基甲基酯模型表征了由氨基酸形成的酰胺键的构象性质。发现异构化的酰胺族（s-反式对s-顺式）和热力学参数与完整脯氨酸的相应值相似。因此，对于通过（19）F-NMR进行结构研究，γ-三氟甲基脯氨酸被认为是肽中结构上低干扰的脯氨酸取代。确实，在肽抗生素短杆菌肽S中天然脯氨酸换成γ-三氟甲基脯氨酸被证明保留了整个两亲性肽结构。

  DOI：

  10.1039/c5ob00034c

文献信息

• Trifluoromethylation of Alkyl Radicals in Aqueous Solution
  作者：Haigen Shen、Zhonglin Liu、Pei Zhang、Xinqiang Tan、Zhenzhen Zhang、Chaozhong Li

  DOI：10.1021/jacs.7b06044

  日期：2017.7.26

  The copper-mediated trifluoromethylation of alkyl radicals is described. The combination of Et3SiH and K2S2O8 initiates the radical reactions of alkyl bromides or iodides with BPyCu(CF3)3 (BPy = 2,2'-bipyridine) in aqueous acetone at room temperature to afford the corresponding trifluoromethylation products in good yield. The protocol is applicable to various primary and secondary alkyl halides and

  描述了铜介导的烷基三氟甲基化。Et3SiH 和 K2S2O8 的组合在室温下在丙酮水溶液中引发烷基溴化物或碘化物与 BPyCu(CF3)3（BPy = 2,2'-联吡啶）的自由基反应，以良好的收率提供相应的三氟甲基化产物。该协议适用于各种一级和二级烷基卤化物，并具有广泛的官能团兼容性。提出了一种涉及三氟甲基从 Cu(II)-CF3 中间体转移到烷基自由基的机制。
• Polarity effects in 4-fluoro- and 4-(trifluoromethyl)prolines
  作者：Vladimir Kubyshkin

  DOI：10.3762/bjoc.16.151

  日期：——

  engineering and NMR spectroscopic studies of peptides and proteins. Their use relies on the fundamental understanding of the interplay between the substituents and the main chain groups of the amino acid residue. This study aims to showcase the polarity-related effects that arise from the interaction between the functional groups in molecular models. Properties such as conformation, acid–base transition

  脯氨酸的含氟类似物是肽和蛋白质的工程和核磁共振光谱研究的宝贵工具。它们的使用依赖于对氨基酸残基的取代基和主链基团之间相互作用的基本理解。本研究旨在展示分子模型中官能团之间相互作用产生的极性相关效应。对非对映体 4-氟脯氨酸、4-(三氟甲基)脯氨酸和 1,1-二氟-5-氮杂螺[2.4]庚烷-6-羧酸酯的构象、酸碱转变和酰胺键异构等性质进行了检查。脯氨酸环上的优选构象源自单个氟原子的优先轴向定位以及三氟甲基或二氟亚甲基的赤道定位。取代基的这种方向解释了观察到的pKa值、亲脂性和酰胺键旋转动力学的趋势。该研究还提供了一系列证据，表明肽基-脯氨酰中酰胺键旋转的过渡态有利于吡咯烷环的C 4 - exo构象。
• [EN] COMPOUNDS, COMPOSITIONS, AND METHODS<br/>[FR] COMPOSÉS, COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS
  申请人：[en]DENALI THERAPEUTICS INC.

  公开号：WO2023168298A2

  公开（公告）日：2023-09-07

  The present disclosure relates generally to small molecule inhibitors of Sterile Alpha and TIR Motif containing 1 (SARM1) protein, or a pharmaceutically acceptable salt, isotopically enriched analog, stereoisomer, mixture of stereoisomers, or prodrug thereof, methods of making and intermediates thereof, and methods of using thereof.
• γ-(S)-Trifluoromethyl proline: evaluation as a structural substitute of proline for solid state ¹⁹F-NMR peptide studies
  作者：Vladimir Kubyshkin、Sergii Afonin、Sezgin Kara、Nediljko Budisa、Pavel K. Mykhailiuk、Anne S. Ulrich

  DOI：10.1039/c5ob00034c

  日期：——

  values for intact proline. Therefore, the gamma-trifluoromethyl proline was suggested as a structurally low-disturbing proline substitution in peptides for their structural studies by (19)F-NMR. Indeed, the exchange of native proline for gamma-trifluoromethyl proline in the peptide antibiotic gramicidin S was shown to preserve the overall amphipathic peptide structure. The utility of the amino acid as

  γ-（4S）-三氟甲基脯氨酸是根据改良的文献方法合成的，具有改进的产率（以克为单位）。使用N-乙酰基甲基酯模型表征了由氨基酸形成的酰胺键的构象性质。发现异构化的酰胺族（s-反式对s-顺式）和热力学参数与完整脯氨酸的相应值相似。因此，对于通过（19）F-NMR进行结构研究，γ-三氟甲基脯氨酸被认为是肽中结构上低干扰的脯氨酸取代。确实，在肽抗生素短杆菌肽S中天然脯氨酸换成γ-三氟甲基脯氨酸被证明保留了整个两亲性肽结构。