2-(exo-3,5-dioxo-4-aza-tricyclo[5.2.1.02,6]dec-4-yl)-N-((1R,9R,10S)-10-hydroxy-12-oxa-8-aza-tricyclo[7.3.1.02,7]trideca-2(7),3,5-trien-4-ylmethyl)acetamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 2-(exo-3,5-dioxo-4-aza-tricyclo[5.2.1.02,6]dec-4-yl)-N-((1R,9R,10S)-10-hydroxy-12-oxa-8-aza-tricyclo[7.3.1.02,7]trideca-2(7),3,5-trien-4-ylmethyl)acetamide
• 英文别名: 2-(exo-3,5-Dioxo-4-aza-tricyclo[5.2.1.02,6]dec-4-yl)-N-((1R,9R,10S)-10-hydroxy-12-oxa-8-aza-tricyclo[7.3.1.02,7]trideca-2(7),3,5-trien-4-ylmethyl)-acetamide；2-[(1S,2R,6S,7R)-3,5-dioxo-4-azatricyclo[5.2.1.02,6]decan-4-yl]-N-[[(1R,9R,10S)-10-hydroxy-12-oxa-8-azatricyclo[7.3.1.02,7]trideca-2(7),3,5-trien-4-yl]methyl]acetamide
• 化学式: C₂₃H₂₇N₃O₅
• 分子量: 425.484
• InChiKey: BOGJVTQQRCPUBE-MZBUVPGESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.61
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (3AR,4S,7R,7AS) 4,7-亚甲基-1H-异吲哚-1,3(2H)-二酮 在 2-羟基吡啶-N-氧化物 、 lithium hydroxide monohydrate 、 四丁基氟化铵 、 四丁基溴化铵 、 potassium carbonate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 62.34h， 生成 2-(exo-3,5-dioxo-4-aza-tricyclo[5.2.1.02,6]dec-4-yl)-N-((1R,9R,10S)-10-hydroxy-12-oxa-8-aza-tricyclo[7.3.1.02,7]trideca-2(7),3,5-trien-4-ylmethyl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  从具有毫摩尔效力的三维片段开始发现新型亲环素D抑制剂。

  摘要：

  通过SPR进行基于片段的筛选，可以发现与肽基-脯氨酰异构酶亲环蛋白D（CypD）具有毫摩尔结合亲和力的化学多样性片段。6个片段命中的CypD蛋白质晶体结构通过片段合并和连接产生了三个不同的化学序列，其中尿素，草酰或酰胺连接体连接了S1'和S2口袋中的毫摩尔片段，为随后的药物化学优化提供了基础。对于某些片段衍生物，我们成功地将生化FP和PPIase分析以及生物物理SPR结合分析中的体外CypD效能从毫摩尔向低微摩尔和亚微摩尔范围提高了1000倍以上。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2019.126717

文献信息

• COMPOUNDS FOR THE INHIBITION OF CYCLOPHILINS AND USES THEREOF
  申请人：Merck Patent GmbH

  公开号：US20170283427A1

  公开（公告）日：2017-10-05

  The present invention relates to compounds, and pharmaceutically acceptable compositions thereof, useful as inhibitors of cyclophilins, and for the treatment of cyclophilin-related disorders.

  本发明涉及化合物及其药用可接受的组合物，用作环肽酶的抑制剂，并用于治疗与环肽酶相关的疾病。