β-4,6-O-isopropylidene-2-acetamido-2-deoxyglucopyranose

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡喃二恶英
• 英文名称: β-4,6-O-isopropylidene-2-acetamido-2-deoxyglucopyranose
• 英文别名: N-[(4aR,6R,7R,8R,8aS)-6,8-dihydroxy-2,2-dimethyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl]acetamide
• 化学式: C₁₁H₁₉NO₆
• 分子量: 261.275
• InChiKey: KHSNVBRWHNOPEI-VVULQXIFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.91
• 拓扑面积：
  97.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  D-GlcNAc 、 2,2-二甲氧基丙烷 在 对甲苯磺酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以66.667%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  通过消除加成机制对蛋白质 S-糖基进行修饰

  摘要：

  含有生物正交基团的全-O-乙酰化非天然单糖已被广泛用于活细胞中的代谢聚糖标记 (MGL) 二十年，但直到最近我们才发现蛋白质半胱氨酸之间存在人工“S-糖基化”和过氧乙酰化糖。虽然正在努力避免 MGL 中的这种非特异性反应，但反应机制仍然未知。在这里，我们提出了一项详细的机制研究，揭示了一种称为蛋白质 S-糖修饰的非典型糖基化。在碱性蛋白质微环境中，过氧乙酰化单糖经过碱促进的 β-消除形成硫醇反应性 α,β-不饱和醛，然后通过迈克尔加成与半胱氨酸残基反应。这种 S-糖基修饰产生半缩醛形式的 3-硫醇化糖，而不是典型的糖苷。消除加成机制指导我们开发 1,6-二-O-丙酰化 N-叠氮基乙酰半乳糖胺 (1,6-Pr2GalNAz) 作为改进的 MGL 非天然单糖。

  DOI：

  10.1021/jacs.0c02110

文献信息

• Protein S-Glyco-Modification through an Elimination–Addition Mechanism
  作者：Ke Qin、Hao Zhang、Zhenqi Zhao、Xing Chen

  DOI：10.1021/jacs.0c02110

  日期：2020.5.20

  S-glyco-modification. In alkaline protein microenvironments, per-O-acetylated monosaccharides undergo base-promoted β-elimination to form thiol-reactive α,β-unsaturated aldehydes, which then react with cysteine residues via Michael addition. This S-glyco-modification produces 3-thiolated sugars in the hemiacetal form, rather than typical glycosides. The elimination-addition mechanism guides us to develop

  含有生物正交基团的全-O-乙酰化非天然单糖已被广泛用于活细胞中的代谢聚糖标记 (MGL) 二十年，但直到最近我们才发现蛋白质半胱氨酸之间存在人工“S-糖基化”和过氧乙酰化糖。虽然正在努力避免 MGL 中的这种非特异性反应，但反应机制仍然未知。在这里，我们提出了一项详细的机制研究，揭示了一种称为蛋白质 S-糖修饰的非典型糖基化。在碱性蛋白质微环境中，过氧乙酰化单糖经过碱促进的 β-消除形成硫醇反应性 α,β-不饱和醛，然后通过迈克尔加成与半胱氨酸残基反应。这种 S-糖基修饰产生半缩醛形式的 3-硫醇化糖，而不是典型的糖苷。消除加成机制指导我们开发 1,6-二-O-丙酰化 N-叠氮基乙酰半乳糖胺 (1,6-Pr2GalNAz) 作为改进的 MGL 非天然单糖。