6-O-benzyl-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl azide | 1542130-69-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 6-O-benzyl-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl azide
• 英文别名: N-[(2R,3R,4R,5S,6R)-2-azido-4,5-dihydroxy-6-(phenylmethoxymethyl)oxan-3-yl]acetamide
• CAS: 1542130-69-7
• 化学式: C₁₅H₂₀N₄O₅
• 分子量: 336.348
• InChiKey: DRWPHANEIRSSQZ-KJWHEZOQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.46
• 重原子数：
  24.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  136.78
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-O-benzyl-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl azide 、 Nα-fluorenylmethoxycarbonyl-L-aspartic acid α-tert-butyl-β-pentafluorophenyl ester 在 1-羟基苯并三唑 、 二甲基苯基磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以453 mg的产率得到N²-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-N⁴-(2-acetamido-6-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-L-asparagine tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  Endo-β-N-Acetylglucosaminidase catalysed glycosylation: tolerance of enzymes to structural variation of the glycosyl amino acid acceptor

  摘要：

  内转β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶（ENGases）是一类非常有用的生物催化剂，可以以汇聚的方式合成各种定义明确的均相N-连接糖 conjugates。我们研究了几种GH85家族ENGases的合成效率，并改变了受体底物的结构。合成了几种不同的GlcNAc-天冬氨酸受体，并与五糖和十糖的噁唑啉供体结合使用。不同的酶对GlcNAc受体的修改有不同的耐受性。尽管没有一种酶能耐受4-或6-羟基的修饰，但Endo M和Endo D都能耐受OH-3的修饰。对于Endo D，通过使用3-O-苄基保护的受体，提高了可实现的合成效率，增加了三倍。任何被检测的酶都不能耐受在3位的岩藻糖存在。

  DOI：

  10.1039/c3ob42104j
• 作为产物：
  描述：

  D-GlcNAc 在 吡啶 、 盐酸 、 甲醇 、 sodium azide 、 2-chloro-1,3-dimethyl imidazolium chloride 、 sodium 、 sodium cyanoborohydride 、 对甲苯磺酸 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 50.0 ℃ 、24.0 kPa 条件下， 反应 33.0h， 生成 6-O-benzyl-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl azide
  参考文献：
  名称：

  Endo-β-N-Acetylglucosaminidase catalysed glycosylation: tolerance of enzymes to structural variation of the glycosyl amino acid acceptor

  摘要：

  内转β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶（ENGases）是一类非常有用的生物催化剂，可以以汇聚的方式合成各种定义明确的均相N-连接糖 conjugates。我们研究了几种GH85家族ENGases的合成效率，并改变了受体底物的结构。合成了几种不同的GlcNAc-天冬氨酸受体，并与五糖和十糖的噁唑啉供体结合使用。不同的酶对GlcNAc受体的修改有不同的耐受性。尽管没有一种酶能耐受4-或6-羟基的修饰，但Endo M和Endo D都能耐受OH-3的修饰。对于Endo D，通过使用3-O-苄基保护的受体，提高了可实现的合成效率，增加了三倍。任何被检测的酶都不能耐受在3位的岩藻糖存在。

  DOI：

  10.1039/c3ob42104j

文献信息

• Endo-β-N-Acetylglucosaminidase catalysed glycosylation: tolerance of enzymes to structural variation of the glycosyl amino acid acceptor
  作者：Yusuke Tomabechi、Marie A. Squire、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1039/c3ob42104j

  日期：——

  Endo-β-N-Acetylglucosaminidases (ENGases) are highly useful biocatalysts that can be used to synthetically access a wide variety of defined homogenous N-linked glycoconjugates in a convergent manner. The synthetic efficiency of a selection of family GH85 ENGases was investigated as the structure of the acceptor substrate was varied. Several different GlcNAc-asparagine acceptors were synthesised, and used in conjunction with penta- and decasaccharide oxazoline donors. Different enzymes showed different tolerances of modification of the GlcNAc acceptor. Whilst none tolerated modification of either the 4- or 6-hydroxyl, both Endo M and Endo D tolerated modification of OH-3. For Endo D the achievable synthetic efficiency was increased by a factor of three by the use a 3-O-benzyl protected acceptor. The presence of a fucose at position-3 was not tolerated by any of the enzymes assayed.

  内转β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶（ENGases）是一类非常有用的生物催化剂，可以以汇聚的方式合成各种定义明确的均相N-连接糖 conjugates。我们研究了几种GH85家族ENGases的合成效率，并改变了受体底物的结构。合成了几种不同的GlcNAc-天冬氨酸受体，并与五糖和十糖的噁唑啉供体结合使用。不同的酶对GlcNAc受体的修改有不同的耐受性。尽管没有一种酶能耐受4-或6-羟基的修饰，但Endo M和Endo D都能耐受OH-3的修饰。对于Endo D，通过使用3-O-苄基保护的受体，提高了可实现的合成效率，增加了三倍。任何被检测的酶都不能耐受在3位的岩藻糖存在。