hyaluronan tetrasaccharide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: hyaluronan tetrasaccharide
• 英文别名: Hyaluronic acid tetrasaccharide；(2S,3S,4S,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid
• 化学式: C₂₈H₄₄N₂O₂₃
• 分子量: 776.657
• InChiKey: KIUKXJAPPMFGSW-XZLGHBIVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7.4
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  400
• 氢给体数：
  14
• 氢受体数：
  23

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  hyaluronan tetrasaccharide 在 2-氯-1,3-二甲基氯化咪唑啉 、 三乙胺 作用下， 以 重水 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 2-methyl[3-O-[4-O-[3-O-(β-D-glucuronopyranosyl)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl]-β-D-glucuronopyranosyl]-1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano][2,1-d]-2-oxazoline
  参考文献：
  名称：

  METHOD FOR PRODUCTION OF SUGAR OXAZOLINE DERIVATIVE

  摘要：

  公开号：

  EP2123663B1
• 作为产物：
  描述：

  hyaluronic acid 在 盐酸 、 二甲基亚砜 作用下， 生成 hyaluronan tetrasaccharide
  参考文献：
  名称：

  REMEDY FOR NERVE DAMAGE

  摘要：

  公开号：

  EP1611893B1

文献信息

• Impact of donor binding on polymerization catalyzed by KfoC by regulating the affinity of enzyme for acceptor
  作者：Jiajun Xue、Lan Jin、Xinke Zhang、Fengshan Wang、Peixue Ling、Juzheng Sheng

  DOI：10.1016/j.bbagen.2016.01.018

  日期：2016.4

  chondroitin sulfate isolated from animal sources and structurally quite heterogeneous. Synthesis of structurally defined chondroitin sulfate is highly desired. The capsular polysaccharide from Escherichia coli strain K4 is similar to chondroitin, and its biosynthesis requires a chondroitin polymerase (KfoC). The essential step toward de novo enzymatic synthesis of chondroitin sulfate, synthesis of chondroitin

  背景技术当前市售的硫酸软骨素分离自动物来源并且在结构上非常异质。高度期望合成结构确定的硫酸软骨素。大肠杆菌K4菌株的荚膜多糖类似于软骨素，其生物合成需要软骨素聚合酶（KfoC）。硫酸软骨素的从头酶促合成的关键步骤，即软骨素的合成，可以通过使用这种酶来实现。方法采用化学酶法制备结构明确的受体和供体糖。另外，采用表面等离子体激元共振来确定单个底物和供体-受体对KfoC的结合亲和力。结果KfoC具有广泛的供体底物特异性和受体混杂性，使其成为一种有吸引力的工具酶，可用于体外结构确定的嵌合糖胺聚糖寡糖合成。另外，供体底物分子的结合调节了KfoC对受体的亲和力，然后影响了由该软骨素聚合酶催化的糖基转移酶反应。结论和一般意义这些结果有助于开发针对嵌合糖胺聚糖寡糖的酶促合成方法，并设计用于KfoC定向进化的未来策略，以创建朝着用户定义目标的突变体。然后影响了这种软骨素聚合酶催化的糖基转移酶反应。结论和一般
• One-Pot Synthesis of Unprotected Anomeric Glycosyl Thiols in Water for Glycan Ligation Reactions with Highly Functionalized Sugars
  作者：Sebastian Köhling、Matthias P. Exner、Saba Nojoumi、Jürgen Schiller、Nediljko Budisa、Jörg Rademann

  DOI：10.1002/anie.201607228

  日期：2016.12.12

  Chemical synthesis of oligosaccharide conjugates is essential for studying the functional relevance of carbohydrates, and this task would be facilitated considerably if reliable methods for the anomeric ligation of unprotected sugars in water were available. Here, a method for the preparation of anomeric glycosyl thiols from complex unprotected mono‐, di‐, and oligosaccharides is presented. By exploiting

  寡糖缀合物的化学合成对于研究碳水化合物的功能相关性至关重要，如果可以使用可靠的方法将水中未保护的糖进行异头连接，则将大大简化此任务。本文介绍了一种从复杂的未保护的单糖，二糖和寡糖制备异头糖基硫醇的方法。通过利用2-乙酰氨基基团的邻近基团效应，可以生成1,2-恶唑啉，并通过用1-硫代酸处理将其转化为1-糖基硫代酯。原位释放的未保护的异头糖基硫醇盐与迈克尔受体，脂族卤化物和氮丙啶偶联，以提供通用的糖偶联物。氨基酸和蛋白质的缀合是通过硫醇与末端烯烃的反应完成的。
• Syntheses of defined sulfated oligohyaluronans reveal structural effects, diversity and thermodynamics of GAG–protein binding
  作者：Sebastian Köhling、Joanna Blaszkiewicz、Gloria Ruiz-Gómez、María Isabel Fernández-Bachiller、Katharina Lemmnitzer、Nydia Panitz、Annette G. Beck-Sickinger、Jürgen Schiller、M. Teresa Pisabarro、Jörg Rademann

  DOI：10.1039/c8sc03649g

  日期：——

  of sulfates. Affinities strongly depend on the anomeric modification of the GAG. Highest binding affinities are effected by anomeric functionalization with large fluorophores and by GAG dimerization. Our experimental and theoretical results suggest that the diversity of GAG binding sites and modes is responsible for the observed high affinities and other binding features. The presented new insights into

  硫酸化糖胺聚糖（GAG）与多种细胞外调节蛋白的结合对于诸如细胞生长，迁移，组织稳态和修复等生理过程至关重要。因此，GAG衍生物在用于组织再生疗法的创新生物材料的开发中显示出极大的相关性。我们提出了一种合成的策略，用于定义硫酸化的寡聚透明质酸聚糖库，其模型GAG的长度，硫酸化模式和异头取代系统地变化，以阐明这些参数对调节蛋白对GAG识别的影响。通过使用荧光偏振ITC的实验和计算方法，对接和分子动力学模拟，我们研究了这些功能化的GAG衍生物与十种代表性调节蛋白的结合，包括IL-8，IL-10，BMP-2，硬化蛋白，TIMP-3，CXCL-12，TGF-β，FGF-1， FGF-2和AT-III，我们建立了GAG识别的构效关系。绑定主要是由焓驱动的，而熵的贡献很小。在某些情况下，结合是由GAG的长度决定的，在所有情况下都是由硫酸盐的位置和数量决定的。亲和力很大程度上取决于GAG的端基修饰。最高的
• Design and syntheses of hyaluronan oligosaccharide conjugates as inhibitors of CD44-Hyaluronan binding
  作者：Xiaowei Lu、Xuefei Huang

  DOI：10.1007/s10719-015-9597-3

  日期：2015.10

  Hyaluronan (HA) is an integral component of the extracellular matrix. Its interactions with a cell surface receptor CD44 has been shown to play important roles in a variety of biological events including cell proliferation and metastasis. As multivalent CD44-HA binding is critical for downstream signaling, compounds that can selectively disrupt the complex formation of HA polysaccharide with CD44 can serve as useful probes of CD44 mediated cellular events as well as potential leads for novel therapeutics. Herein, we report the synthesis of several series of HA conjugates to target the HA binding pocket of CD44. As a small library of HA disaccharide derivatives failed to exhibit any inhibitory activities, we focused on HA tetrasaccharide based analogs. Traditional synthetic strategies towards HA oligosaccharides involve the construction of backbone from the corresponding monosaccharide building blocks, which can be quite tedious. In order to expedite the synthesis, we designed a new synthetic route taking advantage of the ability of hyaluronidase to generate large quantities of HA tetrasaccharide through digestion of HA polysaccharides. The HA tetrasaccharide obtained was utilized to prepare multiple S-linked HA analogs bearing aromatic groups at the reducing end glycan. One such compound containing an m-benzyl phenyl moiety exhibited significant inhibition of CD44-HA binding. Our approach provides a new direction towards the design of HA based CD44 antagonists.

  透明质酸 (HA) 是细胞外基质的组成部分。它与细胞表面受体 CD44 的相互作用已被证明在包括细胞增殖和转移在内的多种生物事件中发挥重要作用。由于多价 CD44-HA 结合对于下游信号转导至关重要，因此能够选择性破坏 HA 多糖与 CD44 复合物形成的化合物可以作为 CD44 介导的细胞事件的有用探针以及新型疗法的潜在先导物。在此，我们报告了几个系列的 HA 缀合物的合成，以靶向 CD44 的 HA 结合袋。由于HA二糖衍生物的小型文库未能表现出任何抑制活性，因此我们专注于基于HA四糖的类似物。 HA 寡糖的传统合成策略涉及从相应的单糖结构单元构建主链，这可能非常繁琐。为了加快合成速度，我们利用透明质酸酶消化HA多糖产生大量HA四糖的能力，设计了一条新的合成路线。获得的HA四糖用于制备多种在还原端聚糖上带有芳香基团的S-连接HA类似物。一种含有间苄基苯基部分的此类化合物表现出对CD44-HA结合的显着抑制。我们的方法为基于 HA 的 CD44 拮抗剂的设计提供了新的方向。
• NMR studies of oligosaccharides derived from hyaluronate: complete assignment of 1H and 13C NMR spectra of aqueous di- and tetra-saccharides, and comparison of chemical shifts for oligosaccharides of increasing degree of polymerisation
  作者：Renato Toffanin、Bjarne J. Kvam、Antonella Flaibani、Marco Atzori、Filippo Biviano、Sergio Paoletti

  DOI：10.1016/0008-6215(93)80064-l

  日期：1993.7

  A series of oligosaccharides was prepared from hyaluronate by depolymerisation with bovine testicular hyaluronidase. Complete assignment of the 1H and 13C NMR spectra was obtained for the disaccharide, the tetrasaccharide, and the NaBH4-treated tetrasaccharide, by using various 1D and 2D NMR methods. The 1H assignments for the tetrasaccharide differ from the incomplete data reported recently (ref.

  通过与牛睾丸透明质酸酶解聚，从透明质酸盐制备一系列寡糖。通过使用各种1D和2D NMR方法，对二糖，四糖和NaBH4处理的四糖获得了1H和13C NMR光谱的完全分配。四糖的1H赋值与最近报道的不完全数据不同（参考文献11）。该系列的二糖，四糖，六糖和八糖的含水13C NMR光谱表明，除那些明显的最终作用外，所有共振的化学位移均与透明质酸在体内的相应共振相当。 D2O。观察到的13 C化学位移表明，合作分子内氢键可能在确定透明质酸在水中的构象中起次要作用。