dimethyl (3,4,5-tri-O-benzyl-1-deoxy-1-R-fluoro-α-L-rhamnoheptulopyranosyl)phosphonate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: dimethyl (3,4,5-tri-O-benzyl-1-deoxy-1-R-fluoro-α-L-rhamnoheptulopyranosyl)phosphonate
• 英文别名: (2S,3R,4R,5S,6S)-2-[(R)-dimethoxyphosphoryl(fluoro)methyl]-6-methyl-3,4,5-tris(phenylmethoxy)oxan-2-ol
• 化学式: C₃₀H₃₆FO₈P
• 分子量: 574.583
• InChiKey: VICCZZKYVWARNL-NIHYJRGRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  92.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  dimethyl (3,4,5-tri-O-benzyl-1-deoxy-1-R-fluoro-α-L-rhamnoheptulopyranosyl)phosphonate 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 甲醇 、 乙酸乙酯 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 18.0h， 生成 (2S,3R,4R,5R,6S)-2-[(R)-dimethoxyphosphoryl(fluoro)methyl]-6-methyloxane-2,3,4,5-tetrol
  参考文献：
  名称：

  鼠李糖1C-膦酸酯作为核苷二转移酶抑制剂的合成与评价

  摘要：

  我们报道了一系列具有不同氟化程度的1-鼠李糖支架的膦酸酯和酮糖膦酸酯的合成。这些化合物被评估为潜在的α - d-葡萄糖1-磷酸胸苷基转移酶（Cps2L）抑制剂，这是肺炎链球菌1-鼠李糖生物合成中的第一种酶，也是一种新型的抗生素靶标。酶-底物和酶-抑制剂结合实验是使用水-配体通过梯度光谱法（WaterLOGSY）NMR观察到的已知糖核苷酸底物和选定的膦酸酯类似物的结合而进行的。测量IC 50值并测定K i计算抑制剂的值。对原核生物l-鼠李糖生物合成途径（Cps2L，RmlB–D）中酶的结合混杂性以及该系列中最有效的抑制剂l-鼠李糖1C-膦酸酯的抑制机理有了新的认识。

  DOI：

  10.1021/jo401542s
• 作为产物：
  描述：

  2,3,4-三-O-苄基-L-吡喃鼠李糖 在 吡啶 、 正丁基锂 、 乙酸酐 、 二甲基亚砜 、 Selectfluor 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 23.75h， 生成 dimethyl (3,4,5-tri-O-benzyl-1-deoxy-1-R-fluoro-α-L-rhamnoheptulopyranosyl)phosphonate
  参考文献：
  名称：

  鼠李糖1C-膦酸酯作为核苷二转移酶抑制剂的合成与评价

  摘要：

  我们报道了一系列具有不同氟化程度的1-鼠李糖支架的膦酸酯和酮糖膦酸酯的合成。这些化合物被评估为潜在的α - d-葡萄糖1-磷酸胸苷基转移酶（Cps2L）抑制剂，这是肺炎链球菌1-鼠李糖生物合成中的第一种酶，也是一种新型的抗生素靶标。酶-底物和酶-抑制剂结合实验是使用水-配体通过梯度光谱法（WaterLOGSY）NMR观察到的已知糖核苷酸底物和选定的膦酸酯类似物的结合而进行的。测量IC 50值并测定K i计算抑制剂的值。对原核生物l-鼠李糖生物合成途径（Cps2L，RmlB–D）中酶的结合混杂性以及该系列中最有效的抑制剂l-鼠李糖1C-膦酸酯的抑制机理有了新的认识。

  DOI：

  10.1021/jo401542s

文献信息

• Synthesis and Evaluation of <scp>l</scp>-Rhamnose 1C-Phosphonates as Nucleotidylyltransferase Inhibitors
  作者：Matthew W. Loranger、Stephanie M. Forget、Nicole E. McCormick、Raymond T. Syvitski、David L. Jakeman

  DOI：10.1021/jo401542s

  日期：2013.10.4

  experiments were performed using water-ligand observed binding via gradient spectroscopy (WaterLOGSY) NMR for known sugar nucleotide substrates and selected phosphonate analogues. IC50 values were measured and Ki values were calculated for inhibitors. New insights were gained into the binding promiscuity of enzymes within the prokaryotic l-rhamnose biosynthetic pathway (Cps2L, RmlB–D) and into the mechanism

  我们报道了一系列具有不同氟化程度的1-鼠李糖支架的膦酸酯和酮糖膦酸酯的合成。这些化合物被评估为潜在的α - d-葡萄糖1-磷酸胸苷基转移酶（Cps2L）抑制剂，这是肺炎链球菌1-鼠李糖生物合成中的第一种酶，也是一种新型的抗生素靶标。酶-底物和酶-抑制剂结合实验是使用水-配体通过梯度光谱法（WaterLOGSY）NMR观察到的已知糖核苷酸底物和选定的膦酸酯类似物的结合而进行的。测量IC 50值并测定K i计算抑制剂的值。对原核生物l-鼠李糖生物合成途径（Cps2L，RmlB–D）中酶的结合混杂性以及该系列中最有效的抑制剂l-鼠李糖1C-膦酸酯的抑制机理有了新的认识。