(2S)-5-(环己氧基)-2-[[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]氨基]-5-氧代戊酸 | 150047-85-1

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - FMOC-氨基酸
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: (2S)-5-(环己氧基)-2-[[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]氨基]-5-氧代戊酸
• 英文名称: Fmoc-Glu(cHex)-OH
• 英文别名: Fmoc-Glu(OcHx)-OH；Fmoc-γ-cyclohexyl-L-glutamate；Fmoc-Glu(OChx)；Fmoc-L-Glu(Chx)-OH；Fmoc-Glu(OcHex)-OH；(2S)-5-cyclohexyloxy-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-5-oxopentanoic acid
• CAS: 150047-85-1
• 化学式: C₂₆H₂₉NO₆
• 分子量: 451.519
• InChiKey: ODIPEUXZAYGDMU-QHCPKHFHSA-N

物化性质

• 沸点：
  679.5±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.29±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-5-(环己氧基)-2-[[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]氨基]-5-氧代戊酸 在 N-乙基吗啉 、 1-羟基苯并三唑 、 4-氨甲基哌啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.17h， 生成 (S)-4-((S)-1-tert-Butoxycarbonyl-ethylcarbamoyl)-4-[(S)-3-cyclohexyloxycarbonyl-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-propionylamino]-butyric acid cyclohexyl ester
  参考文献：
  名称：

  从白细胞介素-1α切除的约束Ω环的设计，合成和三维结构表征

  摘要：

  包含2,7-二取代萘间隔基的环状肽1被设计为模拟白细胞介素1α中存在的暴露Ω环，白细胞介素1α是免疫和炎症反应的重要介体。该环状肽的合成通过溶液相片段缩合方法完成。使用2D-NMR技术进行的三维表征显示，它是白介素-1α中Ω环序列41-48的出色模拟。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)90219-4

文献信息

• Selective Substrates and Activity-Based Probes for Imaging of the Human Constitutive 20S Proteasome in Cells and Blood Samples
  作者：Wioletta Rut、Marcin Poręba、Paulina Kasperkiewicz、Scott J. Snipas、Marcin Drąg

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b00026

  日期：2018.6.28

  the HyCoSuL approach, we designed and synthesized novel and selective fluorogenic substrates for each of these three constitutive 20S proteasome activities and applied them to assess inhibition of proteasome subunits by MG-132 and a clinically used inhibitor bortezomib. Our results confirm the utility of designed substrates in biochemical assays. Furthermore, selective peptide sequences obtained in this

  蛋白酶体是维持蛋白质稳态的关键酶复合物。蛋白酶体功能紊乱导致包括癌症，自身免疫和神经退行性疾病在内的病理。因此，蛋白酶体构成药物开发的极好的分子靶标。在这里，我们使用HyCoSuL方法为这三个20S组成型蛋白酶体活性中的每一个设计和合成了新颖的选择性荧光底物，并将它们应用于评估MG-132和临床使用的硼替佐米对蛋白酶体亚基的抑制作用。我们的结果证实了设计的底物在生化分析中的实用性。此外，以此方式获得的选择性肽序列用于构建荧光团标记的基于活性的探针，然后用于同时检测HEK-293F细胞和红细胞裂解液中的每个20S组成型蛋白酶体亚基。总体而言，我们描述了一种简单而快速的方法，可用于测量全血样本中20S组成型蛋白酶体的活性，该方法可以早期诊断与异常上调的蛋白酶体活性有关的病理状态。
• Selection of DNA‐Encoded Dynamic Chemical Libraries for Direct Inhibitor Discovery
  作者：Yuqing Deng、Jianzhao Peng、Feng Xiong、Yinan Song、Yu Zhou、Jianfu Zhang、Fong Sang Lam、Chao Xie、Wenyin Shen、Yiran Huang、Ling Meng、Xiaoyu Li

  DOI：10.1002/anie.202005070

  日期：2020.8.24

  that can identify full ligand structures from large‐scale DEDLs. This method is also able to convert unbiased libraries into focused ones targeting specific protein classes. We demonstrated this method by selecting DEDLs against five proteins, and novel inhibitors were identified for all targets. Notably, several selective BD1/BD2 inhibitors were identified from the selections against bromodomain 4 (BRD4)

  动态组合库（DCL）是生物医学研究中配体发现的强大工具。但是，DCL的低多样性阻碍了它们的应用。最近，DCL中已经采用了DNA编码的概念来创建DNA编码的动态库（DEDL）。但是，当前所有的DEDL都仅限于片段识别，并且在选择后需要一个具有挑战性的片段链接过程。我们报告了一种锚定的DEDL方法，该方法可以从大规模DEDL中识别出完整的配体结构。这种方法还能够将无偏文库转换为针对特定蛋白质类别的集中文库。我们通过选择针对五种蛋白质的DEDLs证明了这种方法，并为所有靶标确定了新型抑制剂。值得注意的是 从针对重要的抗癌药物靶标bromodomain 4（BRD4）的选择中鉴定出了几种选择性的BD1 / BD2抑制剂。这项工作可以为抑制剂发现提供广泛适用的方法。
• Design and Synthesis of a Biologically Active Antibody Mimic Based on an Antibody-Antigen Crystal Structure
  作者：M. L. Smythe、M. von Itzstein

  DOI：10.1021/ja00086a005

  日期：1994.4

  (antigen)-NC41 (antibody) complex to design a low molecular weight compound that mimics the binding function of the macromolecular antibody. The components of recognition between the antibody and the protein antigen have been analyzed from the energy-refined crystal complex. From this analysis, four amino acid residues on the antibody binding surface, which make direct contact with the active-site loop 368-370

  我们使用 N9 唾液酸酶（抗原）-NC41（抗体）复合物的晶体结构设计了一种模拟大分子抗体结合功能的低分子量化合物。已经从能量精制的晶体复合物中分析了抗体和蛋白质抗原之间的识别成分。根据该分析，与抗原的活性位点环 368-370 直接接触的抗体结合表面上的四个氨基酸残基已被鉴定为贡献了蛋白质的大部分结合能。设计的目标化合物是一种受约束的环肽，模拟这些氨基酸的受体结合构象，已合成并发现可抑制 N9 唾液酸酶活性，Ki 为 1 x 10(-4) M。
• Distance Dependence of Photoinduced Electron Transfer along α-Helical Polypeptides
  作者：Masahiko Sisido、Satoshi Hoshino、Hajime Kusano、Masahiro Kuragaki、Maki Makino、Hiroshi Sasaki、Trevor A. Smith、Kenneth P. Ghiggino

  DOI：10.1021/jp011180h

  日期：2001.10.1

  with increasing the number of spacer amino acids from 1 to 2 and from 5 to 6 were found. The ET rate constants, however, exhibited a simple exponential dependence on the edge-to-edge distance between the two chromophores, with a distance decay factor β = 0.66 ± 0.1 (A-1). The ET data on the α-helical polypeptides were analyzed on the basis of the tunneling pathway model. The optimum ET pathways from the

  合成了含有一对L-1-芘基丙氨酸和Lp-硝基苯丙氨酸的α-螺旋多肽，它们由0-8个氨基酸单元隔开。从芘基到硝基苯基的光致电子转移 (ET) 速率通过在 -58 至 +30°C 的不同温度下记录的芘荧光衰减曲线进行评估。速率常数显示出对间隔氨基酸数量的复杂依赖性。特别是，发现随着间隔氨基酸数量从 1 个增加到 2 个和从 5 个增加到 6 个，ET 率的恢复。然而，ET 速率常数表现出对两个发色团之间边缘到边缘距离的简单指数依赖性，距离衰减因子 β = 0.66 ± 0.1 (A-1)。基于隧道通路模型分析α-螺旋多肽的ET数据。寻找从芘基到硝基苯基的最佳ET途径，并评估ET基质元素的相对值...
• Prodrugs to enhance central nervous system effects of the TRH-like peptide pGlu-Glu-Pro-NH2
  作者：Katalin Prokai-Tatrai、Vien Nguyen、Alevtina D. Zharikova、April C. Braddy、Stanley M. Stevens、Laszlo Prokai

  DOI：10.1016/s0960-894x(03)00081-7

  日期：2003.3

  Potential prodrugs for the TRH-like tripeptide pGlu-Glu-Pro-NH2 were synthesized either by esterifying the Glu side-chain of the parent peptide in solution with alcohols in the presence of resin-bound dicyclohexylcarbodiimide or by solid-phase peptide chemistry. Affinities of these ester prodrugs to lipid membranes as predictors of the transport across the blood-brain barrier were compared by immobilized artificial membrane chromatography, and prodrug activation was tested in the brain tissue of experimental animals. Esters of pGlu-Glu-Pro-NH2 with long-chain primary alcohols emerged as potentially useful prodrugs to improve the central nervous system activity of pGlu-Glu-Pro-NH2 upon systemic administration, as revealed by the enhancement of analeptic activity in mice. (C) 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.