(S)-5-叠氮-2-(芴甲氧羰基-氨基)戊酸 | 1097192-04-5

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 其他氨基酸衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: (S)-5-叠氮-2-(芴甲氧羰基-氨基)戊酸
• 中文别名: (2S)-N-Fmoc-5-叠氮基戊烯酸
• 英文名称: Fmoc-L-Orn(N3)-OH
• 英文别名: Fmoc-Orn(N₃)-OH；Fmoc-5-azido-Nva-OH；(S)-5-Azido-2-(Fmoc-amino)pentanoic acid；(2S)-5-azido-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)pentanoic acid
• CAS: 1097192-04-5
• 化学式: C₂₀H₂₀N₄O₄
• 分子量: 380.403
• InChiKey: TVPIDQLSARDIPX-SFHVURJKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  90
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险品标志：
  Xi
• 安全说明：
  S26
• 危险类别码：
  R36/37/38
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2929 90 00
• 储存条件：
  2-8°C

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-5-叠氮-2-(芴甲氧羰基-氨基)戊酸 在 三异丙基硅烷 、 1,2-乙二硫醇 、 三氟乙酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以39%的产率得到(S)-5-Amino-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-pentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  从固相支持物裂解肽过程中叠氮化物的减少-硫清除剂的选择？

  摘要：

  叠氮化物肽由于通过“点击化学”或施陶丁格（Staudinger）连接在生物结合中的应用而获得越来越大的影响。此外，在有机合成中建立了许多方法来解决将叠氮化物还原为胺的问题，但是尚未见到在SPPS裂解过程中观察到肽叠氮化物还原转化的观察。在本研究中，研究了根据SPPS裂解过程中叠氮化物的还原情况，具体取决于硫清除剂的选择，作为还原剂进行反应。首次观察到短的PNA /肽共轭物，也证实了所应用的叠氮化物氨基酸结构单元中发生的广泛副反应，并通过将不同的裂解混合物应用于一系列疏水性和叠氮部分中位置不同的肽进行了进一步研究。寡聚物序列。

  DOI：

  10.1002/psc.1202
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl (S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-5-hydroxypentanoate 在 盐酸 、 sodium azide 、 三乙胺 作用下， 以 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 17.0h， 生成 (S)-5-叠氮-2-(芴甲氧羰基-氨基)戊酸
  参考文献：
  名称：

  Identification of a new p53/MDM2 inhibitor motif inspired by studies of chlorofusin

  摘要：

  Previous studies on the natural product chlorofusin have shown that the full peptide and azaphilone structure are required for inhibition of the interaction between MDM2 and p53. In the current work, we utilized the cyclic peptide as a template and introduced an azidonorvaline amino acid in place of the ornithine/azaphilone of the natural product and carried out click chemistry with the resulting peptide. From this small library the first ever non-azaphilone containing chlorofusin analog with MDM2/p53 activity was identified. Further studies then suggested that the simple structure of the Fmoc-norvaline amino acid that had undergone a click reaction was also able to inhibit MDM2/p53 interaction. This is an example where studies of a natural product have led to the serendipitous identification of a new small molecule inhibitor of a protein-protein interaction. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2015.06.014

文献信息

• Controlling Antibacterial Activity Exclusively with Visible Light: Introducing a Tetra‐ <i>ortho</i> ‐Chloro‐Azobenzene Amino Acid
  作者：Xavier Just‐Baringo、Alejandro Yeste‐Vázquez、Javier Moreno‐Morales、Clara Ballesté‐Delpierre、Jordi Vila、Ernest Giralt

  DOI：10.1002/chem.202102370

  日期：2021.9.9

  tetra-ortho-chloroazobenzene amino acid (CEBA) has enabled photoswitching of the antimicrobial activity of tyrocidine A analogues by using exclusively visible light, granting spatiotemporal control under benign conditions. Compounds bearing this photoswitchable amino acid become active upon irradiation with red light, but quickly turn-off upon exposure to other visible light wavelengths. Critically, sunlight

  新型四邻氯偶氮苯氨基酸 (CEBA)的引入，通过仅使用可见光实现了 tyrocidine A 类似物的抗菌活性的光开关，从而在良性条件下实现时空控制。带有这种光可切换氨基酸的化合物在红光照射下变得活跃，但在暴露于其他可见光波长时很快关闭。至关重要的是，阳光快速触发红光激活化合物异构化为其原始反式形式，为释放到环境中后的自失活提供了理想的平台。人们发现 Tyrocidine A 的线性类似物可对其抗菌活性提供最佳的光控制，从而在异构化时产生对鲍曼不动杆菌具有活性的化合物。对它们的N端和C端的探索提供了对其结构关键元素的深入了解，并使得获得具有优异菌株选择性和光控制性的新型抗菌剂成为可能。
• [EN] BIOMOLECULE CONJUGATES<br/>[FR] CONJUGUÉS DE BIOMOLÉCULE
  申请人：CELGENE CORP

  公开号：WO2016090157A1

  公开（公告）日：2016-06-09

  The present invention relates to biomolecule conjugates which comprise a biomolecule wherein at least one non-natural amino acid (NNAA) is integral to the structure of the biomolecule and wherein the NNAA is a point of attachment of a linker to which a payload, particularly a cytotoxic agent, is attached. More specifically, this invention relates to conjugates of cell-binding agents and active release products comprising cytotoxic agents wherein the conjugates are produced by means of a cycloaddition reaction. Methods of production, pharmaceutical compositions and methods of use are provided.

  本发明涉及生物分子共轭物，其包括一种生物分子，其中至少有一种非天然氨基酸（NNAA）构成生物分子的结构，并且NNAA是连接物的附着点，连接物上附着有一种荷载物，特别是细胞毒性药剂。更具体地说，本发明涉及细胞结合剂和活性释放产物的共轭物，其中共轭物是通过环加成反应制备的。提供了生产方法、药物组合物和使用方法。
• Optimized syntheses of Fmoc azido amino acids for the preparation of azidopeptides
  作者：Jan Pícha、Miloš Buděšínský、Kateřina Macháčková、Michaela Collinsová、Jiří Jiráček

  DOI：10.1002/psc.2968

  日期：2017.3

  initiated an increased demand for azido and alkyne derivatives of amino acid as precursors for the synthesis of clicked peptides. However, the use of azido and alkyne amino acids in peptide chemistry is complicated by their high cost. For this reason, we investigated the possibility of the in‐house preparation of a set of five Fmoc azido amino acids: β‐azido l‐alanine and d‐alanine, γ‐azido l‐homoalanine, δ‐azido

  CuI 催化点击化学的兴起引发了对氨基酸的叠氮基和炔烃衍生物作为点击肽合成前体的需求增加。然而，叠氮基和炔氨基酸在肽化学中的使用因其高成本而变得复杂。为此，我们研究了内部制备一组五种 Fmoc 叠氮基氨基酸的可能性：β-叠氮基l-丙氨酸和d-丙氨酸、γ-叠氮基l-高丙氨酸、δ-叠氮基l-鸟氨酸和ω叠氮升-赖氨酸。我们研究了文献中描述的几种反应途径，提出了一些改进建议，并提出了几种合成高纯度化合物的替代途径。在这里，我们证明可以在一两周内以用户友好的成本制备多克数量的这些 Fmoc 叠氮基氨基酸。我们还将这些叠氮基氨基酸并入几种模型三肽中，我们观察到在与 2-(1 H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲六氟磷酸盐/DIPEA。我们希望我们详细的合成方案能激励一些肽化学家在他们的实验室中制备这些 Fmoc 叠氮酸，并帮助他们避免叠氮肽合成过于庞大的成本。
• Diarylethene moiety as an enthalpy-entropy switch: photoisomerizable stapled peptides for modulating p53/MDM2 interaction
  作者：Alexander V. Strizhak、Oleg Babii、Sergii Afonin、Iuliia Bakanovich、Teodors Pantelejevs、Wenshu Xu、Elaine Fowler、Rohan Eapen、Krishna Sharma、Maxim O. Platonov、Vasyl V. Hurmach、Laura Itzhaki、Marko Hyvönen、Anne S. Ulrich、David R. Spring、Igor V. Komarov

  DOI：10.1039/d0ob00831a

  日期：——

  Photoisomerization of diarylethene-modified peptides changes the thermodynamics of their binding to MDM2: the “closed” photoisomers bind largely due to a high negative enthalpy, whereas the “open” forms bind better due to a more favourable entropy.

  二芳基乙烯修饰的肽的光异构化改变了它们与MDM2结合的热力学特性：由于高负熵，"闭合"光异构体主要是由于高负焓而结合，而"开放"形式由于更有利的熵而结合更好。
• Conformational stabilization of a β-hairpin through a triazole–tryptophan interaction
  作者：Donatella Diana、Claudia Di Salvo、Veronica Celentano、Lucia De Rosa、Alessandra Romanelli、Roberto Fattorusso、Luca D. D'Andrea

  DOI：10.1039/c7ob02815f

  日期：——

  stabilize the β-hairpin conformation are needed as β-hairpin peptides are useful molecules for pharmaceutical, biological and materials applications. We explored the use of a “triazole bridge”, a covalent link between two β-hairpin strands obtained through Cu-catalyzed alkyne–azide cycloaddition, combined with an aromatic–aromatic interaction. Highly conformationally stable peptides were identified

  需要稳定β-发夹结构的分子工具，因为β-发夹肽是用于药物，生物学和材料应用的有用分子。我们探索了“三唑桥”的使用，该三唑桥是通过Cu催化的炔-叠氮化物环加成反应与芳香族-芳族相互作用结合而获得的两个β-发夹链之间的共价连接。通过NMR筛选基于Trpzip2支架的少量环状肽，可以鉴定出高度构象稳定的肽。Trpzip2的特征性Trp-Trp相互作用被可变长度的对角三唑桥所取代。NMR和CD分析表明，三唑和吲哚环可以有利地相互作用以稳定β-发夹构象。构象稳定取决于三唑桥的长度和芳环之间的相对位置。结合芳族相互作用和共价链间三唑桥是获得具有高β-发夹含量的肽的有用策略。