N⁶-(1-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine | 239100-12-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N⁶-(1-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine
• 英文别名: N-((2R,3R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-(6-(naphthalen-1-ylmethylamino)-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-3-yl)-3-methoxybenzamide；N-[(2R,3R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-[6-(naphthalen-1-ylmethylamino)purin-9-yl]oxolan-3-yl]-3-methoxybenzamide
• CAS: 239100-12-0
• 化学式: C₂₉H₂₈N₆O₅
• 分子量: 540.579
• InChiKey: UMWAFTCCAGNLMN-BYHVZLFPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  144
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁶-(1-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine 在 叔丁基过氧化氢 、 ammonium hydroxide 、 5-(乙硫基)-1H-四唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙腈 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 33.83h， 生成 Morpholin-4-yl-phosphonic acid mono-((2R,3S,4R,5R)-3-hydroxy-4-(3-methoxy-benzoylamino)-5-{6-[(naphthalen-1-ylmethyl)-amino]-purin-9-yl}-tetrahydro-furan-2-ylmethyl) ester
  参考文献：
  名称：

  A disubstituted NAD + analogue is a nanomolar inhibitor of trypanosomal glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase

  摘要：

  N-6-Naphthalenemethyl-2'-methoxybenzamido-beta -NAD(+), a derivative of a low micromolar first-generation inhibitor of trypanosomal glyceraldehyde phosphate dehydrogenase (GAPDH), was synthesized, taking advantage of methodology for the selective phosphitylation of nucleosides. The compound was found to be a poor alternate cosubstrate for GAPDH, but an extremely potent inhibitor. Although intended for use in crystallization trials, the analogue presents possibilities for further drug design. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(00)00608-9
• 作为产物：
  描述：

  9-[2'-deoxy-2'-trifluoroacetamido-3',5'-O-(diacetyl)]-(1-β-D-ribofuranosyl)-6-chloropurine 在 ammonium hydroxide 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 43.0h， 生成 N⁶-(1-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine
  参考文献：
  名称：

  腺苷类似物通过基于结构的药物设计作为锥虫科甘油3-磷酸脱氢酶的选择性抑制剂。

  摘要：

  在我们继续进行基于抗锥虫病药物的结构设计时，寄生虫选择性腺苷类似物被确定为低甘油三磷酸甘油醛脱氢酶（GAPDH）的抑制剂。布鲁氏锥虫，克氏锥虫，墨西哥利什曼原虫和人类GAPDH的晶体结构提供了NAD（+）的腺苷部分如何与蛋白质相互作用的详细信息，这有助于理解一系列腺苷类似物对各种氨基酸的亲和力。 GAPDH。从对铅化合物的萘甲基和苯甲酰胺取代基进行修饰的探索中，N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6e），N（6）-（研究了取代的萘甲基）-2'-脱氧-2'-（取代的苯甲酰胺基）腺苷类似物。N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6m），N（6）-[1-（3-羟基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（7m），N（6）-[1-（3-甲氧基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（

  DOI：

  10.1021/jm000472o

文献信息

• Adenosine Analogues as Selective Inhibitors of Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase of <i>Trypanosomatidae</i> via Structure-Based Drug Design
  作者：Jerome C. Bressi、Christophe L. M. J. Verlinde、Alex M. Aronov、My Le Shaw、Sam S. Shin、Lisa N. Nguyen、Stephen Suresh、Frederick S. Buckner、Wesley C. Van Voorhis、Irwin D. Kuntz、Wim G. J. Hol、Michael H. Gelb

  DOI：10.1021/jm000472o

  日期：2001.6.1

  N(6)-[1-(3-hydroxynaphthalene)methyl]-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (7m), N(6)-[1-(3-methoxynaphthalene)methyl]-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (9m), N(6)-(2-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine (11e), and N(6)-(2-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (11m) demonstrated a 2- to 3-fold improvement over 6e and a 7100- to 25000-fold improvement

  在我们继续进行基于抗锥虫病药物的结构设计时，寄生虫选择性腺苷类似物被确定为低甘油三磷酸甘油醛脱氢酶（GAPDH）的抑制剂。布鲁氏锥虫，克氏锥虫，墨西哥利什曼原虫和人类GAPDH的晶体结构提供了NAD（+）的腺苷部分如何与蛋白质相互作用的详细信息，这有助于理解一系列腺苷类似物对各种氨基酸的亲和力。 GAPDH。从对铅化合物的萘甲基和苯甲酰胺取代基进行修饰的探索中，N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6e），N（6）-（研究了取代的萘甲基）-2'-脱氧-2'-（取代的苯甲酰胺基）腺苷类似物。N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6m），N（6）-[1-（3-羟基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（7m），N（6）-[1-（3-甲氧基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（
• A disubstituted NAD + analogue is a nanomolar inhibitor of trypanosomal glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
  作者：Kevin J Kennedy、Jerome C Bressi、Michael H Gelb

  DOI：10.1016/s0960-894x(00)00608-9

  日期：2001.1

  N-6-Naphthalenemethyl-2'-methoxybenzamido-beta -NAD(+), a derivative of a low micromolar first-generation inhibitor of trypanosomal glyceraldehyde phosphate dehydrogenase (GAPDH), was synthesized, taking advantage of methodology for the selective phosphitylation of nucleosides. The compound was found to be a poor alternate cosubstrate for GAPDH, but an extremely potent inhibitor. Although intended for use in crystallization trials, the analogue presents possibilities for further drug design. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.