tert-butyl N-[9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl]carbamate | 1028383-06-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: tert-butyl N-[9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl]carbamate
• CAS: 1028383-06-3
• 化学式: C₂₇H₄₉N₅O₅Si₂
• 分子量: 579.888
• InChiKey: JVUCLEVDXAZDCV-XUVXKRRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.87
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl N-[9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl]carbamate 在 四(三苯基膦)钯 copper(l) iodide 、 四丁基氟化铵 、 silica gel 、 sodium hydride 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 磷酸三甲酯 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 57.08h， 生成 6-FAM labeled N6-[4-(3-amino-1-propyl)benzyl]-2'-deoxyadenosine-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  3′-OH unblocked nucleotides and nucleosides base modified with non-cleavable, terminating groups and methods for their use in DNA sequencing

  摘要：

  提供的是本文描述的新型核苷酸、核苷和它们的衍生物，可用于DNA测序技术和其他类型的DNA分析。在一个实施例中，未保护的3'-OH基团的核苷酸或核苷在核碱基上被衍生，包括通过连接剂连接到不可切断终止基团的荧光染料。不可切断的荧光基团被设计为终止DNA合成，以便DNA寡聚体可以以并行格式高效测序。这些试剂和方法将导致对多态性和其他有价值的遗传信息更准确的识别。

  公开号：

  US07893227B2
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧腺苷 在 咪唑 、 magnesium(II) perchlorate 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 tert-butyl N-[9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  光可断裂的荧光标记化合物及用途

  摘要：

  本发明提供了一种光可断裂的荧光标记可逆终端化合物及其在DNA或RNA测序中的用途。本发明采用光可断裂基团作为抑制基团，在一定波长的照射下，抑制基团与碱基断开；该离去过程不需要特殊的催化剂或还原剂等的辅助，不会存在辅助试剂与DNA聚合酶、碱基的副反应，从而在温和的条件下实现可逆终止；此外，该离去过程对测序过程本身没有任何干扰，有利于长片段单分子测序。

  公开号：

  CN106188197A

文献信息

• 3′-OH unblocked nucleotides and nucleosides base modified with non-cleavable, terminating groups and methods for their use in DNA sequencing
  申请人：LaserGen, Inc.

  公开号：US07893227B2

  公开（公告）日：2011-02-22

  Provided are novel nucleotides, nucleoside, and their derivatives described herein, that can be used in DNA sequencing technology and other types of DNA analysis. In one embodiment, the nucleotide or nucleoside with an unprotected 3′-OH group is derivatized at the nucleobase to include a fluorescent dye attached via a linker to a non-cleavable terminating group. The non-cleavable-fluorescent group is designed to terminate DNA synthesis so that DNA oligomers can be sequenced efficiently in a parallel format. These reagents and methods will lead to more accurate identification of polymorphisms and other valuable genetic information.

  提供的是本文描述的新型核苷酸、核苷和它们的衍生物，可用于DNA测序技术和其他类型的DNA分析。在一个实施例中，未保护的3'-OH基团的核苷酸或核苷在核碱基上被衍生，包括通过连接剂连接到不可切断终止基团的荧光染料。不可切断的荧光基团被设计为终止DNA合成，以便DNA寡聚体可以以并行格式高效测序。这些试剂和方法将导致对多态性和其他有价值的遗传信息更准确的识别。
• 光可断裂的荧光标记化合物及用途
  申请人：深圳市瀚海基因生物科技有限公司

  公开号：CN106188197A

  公开（公告）日：2016-12-07

  本发明提供了一种光可断裂的荧光标记可逆终端化合物及其在DNA或RNA测序中的用途。本发明采用光可断裂基团作为抑制基团，在一定波长的照射下，抑制基团与碱基断开；该离去过程不需要特殊的催化剂或还原剂等的辅助，不会存在辅助试剂与DNA聚合酶、碱基的副反应，从而在温和的条件下实现可逆终止；此外，该离去过程对测序过程本身没有任何干扰，有利于长片段单分子测序。