methyl (8S)-8-(chloromethyl)-6-[5,7-dimethoxy-6-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1H-indole-2-carbonyl]-4-hydroxy-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate | 1451984-29-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: methyl (8S)-8-(chloromethyl)-6-[5,7-dimethoxy-6-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1H-indole-2-carbonyl]-4-hydroxy-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
• CAS: 1451984-29-4
• 化学式: C₂₉H₃₂ClN₃O₉
• 分子量: 602.041
• InChiKey: ZMOIYHFXIRFCQQ-MRXNPFEDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  145
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  二乙二醇单甲醚 在 水 、 sodium methylate 、 caesium carbonate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 sodium hydroxide 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 5,5-dimethyl-1,3-cyclohexadiene 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 56.33h， 生成 methyl (8S)-8-(chloromethyl)-6-[5,7-dimethoxy-6-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1H-indole-2-carbonyl]-4-hydroxy-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Duocarmycin 类 DNA 烷基化抗肿瘤药物的疏水特性与生物活性之间的基本关系：疏水结合驱动的结合

  摘要：

  Duocarmycin SA 的两个系统系列越来越亲水，其特征是将乙二醇单元（n = 1-5）并入三甲氧基吲哚亚基的甲氧基取代基中。随着乙二醇单元掺入的增加，这些衍生物表现出逐渐增加的水溶性以及细胞生长抑制活性和 DNA 烷基化效率的逐渐降低。观察到 cLogP 与细胞生长抑制的-log IC 50和 -log AE（AE = 无细胞 DNA 烷基化效率）的线性关系，cLogP值跨越 2.5–0.49 的生产范围，-log IC 50值跨越11.2-6.4的范围，代表IC 50值相差 10 5 (0.008 到 370 nM)。结果量化了化合物的疏水特性在表达此类成员的生物活性（驱动本质上可逆的 DNA 烷基化反应）中所起的基本作用，并定义了其影响的惊人程度。

  DOI：

  10.1021/jm400665c
• 作为试剂：
  描述：

  二乙二醇单甲醚 在 methyl (8S)-8-(chloromethyl)-6-[5,7-dimethoxy-6-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1H-indole-2-carbonyl]-4-hydroxy-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate 、 水 、 sodium methylate 、 potassium carbonate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 5,5-dimethyl-1,3-cyclohexadiene 、 水 、 丙酮 为溶剂， 反应 74.0h， 生成 5,6,7-tris(2-(2-methoxyethoxy)ethoxy)-1H-indole-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  Duocarmycin 类 DNA 烷基化抗肿瘤药物的疏水特性与生物活性之间的基本关系：疏水结合驱动的结合

  摘要：

  Duocarmycin SA 的两个系统系列越来越亲水，其特征是将乙二醇单元（n = 1-5）并入三甲氧基吲哚亚基的甲氧基取代基中。随着乙二醇单元掺入的增加，这些衍生物表现出逐渐增加的水溶性以及细胞生长抑制活性和 DNA 烷基化效率的逐渐降低。观察到 cLogP 与细胞生长抑制的-log IC 50和 -log AE（AE = 无细胞 DNA 烷基化效率）的线性关系，cLogP值跨越 2.5–0.49 的生产范围，-log IC 50值跨越11.2-6.4的范围，代表IC 50值相差 10 5 (0.008 到 370 nM)。结果量化了化合物的疏水特性在表达此类成员的生物活性（驱动本质上可逆的 DNA 烷基化反应）中所起的基本作用，并定义了其影响的惊人程度。

  DOI：

  10.1021/jm400665c

文献信息

• A Fundamental Relationship between Hydrophobic Properties and Biological Activity for the Duocarmycin Class of DNA-Alkylating Antitumor Drugs: Hydrophobic-Binding-Driven Bonding
  作者：Amanda L. Wolfe、Katharine K. Duncan、James P. Lajiness、Kaicheng Zhu、Adam S. Duerfeldt、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/jm400665c

  日期：2013.9.12

  series of increasingly hydrophilic derivatives of duocarmycin SA that feature the incorporation of ethylene glycol units (n = 1–5) into the methoxy substituents of the trimethoxyindole subunit are described. These derivatives exhibit progressively increasing water solubility along with progressive decreases in cell growth inhibitory activity and DNA alkylation efficiency with the incremental ethylene glycol

  Duocarmycin SA 的两个系统系列越来越亲水，其特征是将乙二醇单元（n = 1-5）并入三甲氧基吲哚亚基的甲氧基取代基中。随着乙二醇单元掺入的增加，这些衍生物表现出逐渐增加的水溶性以及细胞生长抑制活性和 DNA 烷基化效率的逐渐降低。观察到 cLogP 与细胞生长抑制的-log IC 50和 -log AE（AE = 无细胞 DNA 烷基化效率）的线性关系，cLogP值跨越 2.5–0.49 的生产范围，-log IC 50值跨越11.2-6.4的范围，代表IC 50值相差 10 5 (0.008 到 370 nM)。结果量化了化合物的疏水特性在表达此类成员的生物活性（驱动本质上可逆的 DNA 烷基化反应）中所起的基本作用，并定义了其影响的惊人程度。