methyl 1-{[5-{[(tert-butoxycarbonyl)amino]methyl}-2-methyl-4-(4-methylphenyl)-6-(2-methylpropyl)pyridin-3-yl]-acetyl}-L-prolinate | 851586-54-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl 1-{[5-{[(tert-butoxycarbonyl)amino]methyl}-2-methyl-4-(4-methylphenyl)-6-(2-methylpropyl)pyridin-3-yl]-acetyl}-L-prolinate
• 英文别名: methyl (2S)-1-[2-[2-methyl-4-(4-methylphenyl)-5-[[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methyl]-6-(2-methylpropyl)pyridin-3-yl]acetyl]pyrrolidine-2-carboxylate
• CAS: 851586-54-4
• 化学式: C₃₁H₄₃N₃O₅
• 分子量: 537.7
• InChiKey: SRTKIYGRNBXYTK-SANMLTNESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  97.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 1-{[5-{[(tert-butoxycarbonyl)amino]methyl}-2-methyl-4-(4-methylphenyl)-6-(2-methylpropyl)pyridin-3-yl]-acetyl}-L-prolinate 在 甲醇 、 sodium hydroxide 、 盐酸 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 以99%的产率得到1-{[5-{[(tert-butoxycarbonyl)amino]methyl}-2-methyl-4-(4-methylphenyl)-6-(2-methylpropyl)pyridin-3-yl]acetyl}-L-proline
  参考文献：
  名称：

  设计和合成靶向二齿酸与Arg125的二肽基肽酶IV（DPP-4）抑制剂的3-吡啶基乙酰胺衍生物

  摘要：

  我们以前已经发现烟酸衍生物1作为结构上新颖的二肽基肽酶IV（DPP-4）抑制剂。在这项研究中，我们获得了烟酸衍生物1之间的X射线共晶体结构和DPP-4。根据这些X射线共晶体学结果，为了获得更强的抑制活性，我们将Arg125定位为潜在的氨基酸残基，因为它位于吡啶核附近，并且据报道一些已知的DPP-4抑制剂与该残基相互作用。我们假设Arg125的胍基可以双齿方式与两个氢键受体相互作用。因此，我们设计了一系列3-吡啶基乙酰胺衍生物，它们具有一个额外的氢键受体，可以与Arg125发生所需的二齿相互作用。我们发现了1-{[5-（氨基甲基）-2-甲基-4-（4-甲基苯基）-6-（2-甲基丙基）吡啶-3-基]乙酰基} -1-脯氨酰胺的二盐酸盐（13j）是一种有效且选择性的DPP-4抑制剂，可以以独特的双齿方式与Arg125的胍基相互作用。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2010.11.038
• 作为产物：
  描述：

  异戊酸甲酯 在 哌啶 、 盐酸 、 四丁基氟化铵 、 氨 、 水 、 氢气 、 硝酸 、 sodium hydride 、 二异丁基氢化铝 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 、 甲苯 、 乙腈 、 mineral oil 为溶剂， -78.0~90.0 ℃ 、500.01 kPa 条件下， 反应 52.75h， 生成 methyl 1-{[5-{[(tert-butoxycarbonyl)amino]methyl}-2-methyl-4-(4-methylphenyl)-6-(2-methylpropyl)pyridin-3-yl]-acetyl}-L-prolinate
  参考文献：
  名称：

  设计和合成靶向二齿酸与Arg125的二肽基肽酶IV（DPP-4）抑制剂的3-吡啶基乙酰胺衍生物

  摘要：

  我们以前已经发现烟酸衍生物1作为结构上新颖的二肽基肽酶IV（DPP-4）抑制剂。在这项研究中，我们获得了烟酸衍生物1之间的X射线共晶体结构和DPP-4。根据这些X射线共晶体学结果，为了获得更强的抑制活性，我们将Arg125定位为潜在的氨基酸残基，因为它位于吡啶核附近，并且据报道一些已知的DPP-4抑制剂与该残基相互作用。我们假设Arg125的胍基可以双齿方式与两个氢键受体相互作用。因此，我们设计了一系列3-吡啶基乙酰胺衍生物，它们具有一个额外的氢键受体，可以与Arg125发生所需的二齿相互作用。我们发现了1-{[5-（氨基甲基）-2-甲基-4-（4-甲基苯基）-6-（2-甲基丙基）吡啶-3-基]乙酰基} -1-脯氨酰胺的二盐酸盐（13j）是一种有效且选择性的DPP-4抑制剂，可以以独特的双齿方式与Arg125的胍基相互作用。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2010.11.038

文献信息

• Pyridine compounds as inhibitors of dipeptidyl peptidase IV
  申请人：Oi Satoru

  公开号：US20070037807A1

  公开（公告）日：2007-02-15

  A compound represented by the formula wherein R 1 and R 2 are the same or different and each is an optionally substituted hydrocarbon group or an optionally substituted hydroxy group; R 3 is an optionally substituted aromatic group; R 4 is an optionally substituted amino group; L is a divalent chain hydrocarbon group; Q is a bond or a divalent chain hydrocarbon group; and X is a hydrogen atom, a cyano group, a nitro group, an acyl group, a substituted hydroxy group, an optionally substituted thiol group, an optionally substituted amino group or an optionally substituted cyclic group; provided that when X is an ethoxycarbonyl group, then Q is a divalent chain hydrocarbon group. The compound has a peptidase inhibitory action, is useful as an agent for the prophylaxis or treatment of diabetes and the like, and is superior in efficacy, duration of action, specificity, lower toxicity and the like.

  该化合物的化学式为其中R1和R2是相同或不同的可选择取代的烃基或可选择取代的羟基；R3是可选择取代的芳香基；R4是可选择取代的氨基；L是二价链烃基；Q是键或二价链烃基；X是氢原子、氰基、硝基、酰基、可选择取代的羟基、可选择取代的硫醇基、可选择取代的氨基或可选择取代的环状基；但当X是乙氧羰基时，Q是二价链烃基。该化合物具有肽酶抑制作用，可用作预防或治疗糖尿病等药物，具有优异的疗效、持续时间、特异性、低毒性等特点。
• Design and synthesis of 3-pyridylacetamide derivatives as dipeptidyl peptidase IV (DPP-4) inhibitors targeting a bidentate interaction with Arg125
  作者：Yasufumi Miyamoto、Yoshihiro Banno、Tohru Yamashita、Tatsuhiko Fujimoto、Satoru Oi、Yusuke Moritoh、Tomoko Asakawa、Osamu Kataoka、Koji Takeuchi、Nobuhiro Suzuki、Koji Ikedo、Takuo Kosaka、Shigetoshi Tsubotani、Akiyoshi Tani、Miyuki Funami、Michiko Amano、Yoshio Yamamoto、Kathleen Aertgeerts、Jason Yano、Hironobu Maezaki

  DOI：10.1016/j.bmc.2010.11.038

  日期：2011.1

  structurally novel dipeptidyl peptidase IV (DPP-4) inhibitor. In this study, we obtained the X-ray co-crystal structure between nicotinic acid derivative 1 and DPP-4. From these X-ray co-crystallography results, to achieve more potent inhibitory activity, we targeted Arg125 as a potential amino acid residue because it was located near the pyridine core, and some known DPP-4 inhibitors were reported to

  我们以前已经发现烟酸衍生物1作为结构上新颖的二肽基肽酶IV（DPP-4）抑制剂。在这项研究中，我们获得了烟酸衍生物1之间的X射线共晶体结构和DPP-4。根据这些X射线共晶体学结果，为了获得更强的抑制活性，我们将Arg125定位为潜在的氨基酸残基，因为它位于吡啶核附近，并且据报道一些已知的DPP-4抑制剂与该残基相互作用。我们假设Arg125的胍基可以双齿方式与两个氢键受体相互作用。因此，我们设计了一系列3-吡啶基乙酰胺衍生物，它们具有一个额外的氢键受体，可以与Arg125发生所需的二齿相互作用。我们发现了1-[5-（氨基甲基）-2-甲基-4-（4-甲基苯基）-6-（2-甲基丙基）吡啶-3-基]乙酰基} -1-脯氨酰胺的二盐酸盐（13j）是一种有效且选择性的DPP-4抑制剂，可以以独特的双齿方式与Arg125的胍基相互作用。