6-D-ribitylaminouracil | 33106-48-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 6-D-ribitylaminouracil
• 英文别名: 6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 33106-48-8
• 化学式: C₉H₁₅N₃O₆
• 分子量: 261.235
• InChiKey: ASYLEBGSYXHDOO-UUEMRFSQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.61±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.8
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  151
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-D-ribitylaminouracil 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 sodium nitrite 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 ethyl N-[2,4-dioxo-6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidin-5-yl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  在回收内体中访问MR1的MAIT细胞前药激动剂的化学合成，稳定性和活性。

  摘要：

  粘膜相关不变性T（MAIT）细胞是抗菌效应T细胞，可与源自单态分子MR1的细菌核黄素合成的嘧啶反应。MAIT细胞研究中的主要挑战是常用的MAIT激动剂前体5-氨基-6-d-核糖胺基尿嘧啶（5-A-RU）对自氧化不稳定，导致生物活性丧失。在这里，我们通过LCMS描述了两个独立的自氧化过程。为了克服明显的不稳定性，我们报道了通过用可裂解的缬氨酸-瓜氨酸-对氨基苯甲酸氨基甲酸酯修饰5-氨基而生成的5-A-RU前药的合成。该化合物以前药形式稳定，只有在酶促裂解后才释放母体胺（即5-A-RU）。与5-A-RU相比，对前药的体外和体内分析显示MAIT细胞活化特性增强，这与循环内体中的优先加载有关，这是某些天然激动剂使用的途径。因此，该前药设计克服了生物学研究中与5-A-RU相关的难题，并为探索不同的呈递途径提供了机会。

  DOI：

  10.1021/acschembio.9b00902
• 作为产物：
  描述：

  在 lithium aluminium tetrahydride 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 9.5h， 生成 6-D-ribitylaminouracil
  参考文献：
  名称：

  A robust synthesis of 7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin

  摘要：

  红氧化还原辅因子F420的生物合成前体7,8-二去甲基-8-羟基-5-去氮核黄素，从6-氯尿嘧啶、2-氯-4-羟基苯甲醛和双异丙基保护的D-核糖经过四个步骤制备而成。后一种醛经过肟转化为相应的保护核黄糖胺，然后通过LiAlH4还原。与先前合成方法相比的关键优势在于利用了多元醇保护基，使得可以通过色谱纯化一个关键中间产物，从而提供高纯度的目标化合物。

  DOI：

  10.3762/bjoc.12.89

文献信息

• First total synthesis of redox coenzyme factor 420
  作者：Kiyoshi Tanaka、Tetsutaro Kimachi、Masahiro Kawase、Fumio Yoneda

  DOI：10.1039/c39880000524

  日期：——

  The first total synthesis of Methanobacterium redox coenzyme Factor 420 (F420) has been achieved by the formation of a phosphotriester bond between a protected 10-D-ribityl-8-hydroxy-5-deazaisoalloxazine moiety and a peptide moiety, (L-lactate-γ-L-glutamyl)-L-glutamic acid tribenzyl ester, by the phosphite triester approach using β,β,β-trichloroethyl phosphorodichloridite, followed by successive deprotection

  甲烷氧化还原酶辅酶因子420（F 420）的第一个全合成是通过在受保护的10- D -ribityl-8-羟基-5-deazaisoalloxazine部分和一个肽部分之间形成一个磷酸三酯键来实现的（L-乳酸-γ- L-谷氨酰基）-L-谷氨酸三苄基酯，通过亚磷酸三酯方法，使用β，β，β-三氯乙基二氯亚磷酸酯，随后连续脱保护。
• Synthesis, stabilization, and characterization of the MR1 ligand precursor 5-amino-6-D-ribitylaminouracil (5-A-RU)
  作者：Kelin Li、Charles K. Vorkas、Ashutosh Chaudhry、Donielle L. Bell、Richard A. Willis、Alexander Rudensky、John D. Altman、Michael S. Glickman、Jeffrey Aubé

  DOI：10.1371/journal.pone.0191837

  日期：——

  Mucosal-associated invariant T (MAIT) cells are an abundant class of innate T cells restricted by the MHC I-related molecule MR1. MAIT cells can recognize bacterially-derived metabolic intermediates from the riboflavin pathway presented by MR1 and are postulated to play a role in innate antibacterial immunity through production of cytokines and direct bacterial killing. MR1 tetramers, typically stabilized by the adduct of 5-amino-6-D-ribitylaminouracil (5-A-RU) and methylglyoxal (MeG), are important tools for the study of MAIT cells. A long-standing problem with 5-A-RU is that it is unstable upon storage. Herein we report an efficient synthetic approach to the HCl salt of this ligand, which has improved stability during storage. We also show that synthetic 5-A-RU•HCl produced by this method may be used in protocols for the stimulation of human MAIT cells and production of both human and mouse MR1 tetramers for MAIT cell identification.

  粘膜相关不变 T (MAIT) 细胞是一类丰富的先天 T 细胞，受 MHC I 相关分子 MR1 的限制。 MAIT 细胞可以识别 MR1 呈现的核黄素途径中细菌衍生的代谢中间体，并被认为通过产生细胞因子和直接杀灭细菌，在先天抗菌免疫中发挥作用。 MR1 四聚体通常由 5-氨基-6-D-核糖氨基尿嘧啶 (5-A-RU) 和甲基乙二醛 (MeG) 的加合物稳定，是研究 MAIT 细胞的重要工具。 5-A-RU 的一个长期存在的问题是它在存储时不稳定。在此，我们报告了一种该配体 HCl 盐的有效合成方法，该方法提高了储存期间的稳定性。我们还表明，通过这种方法产生的合成 5-A-RU·HCl 可用于刺激人类 MAIT 细胞以及生产人类和小鼠 MR1 四聚体以进行 MAIT 细胞鉴定的方案。
• IMMUNOLOGICAL REAGENTS AND USES THEREFOR
  申请人：THE UNIVERSITY OF MELBOURNE

  公开号：US20150166542A1

  公开（公告）日：2015-06-18

  The present invention provides a ligand which binds to MR1 wherein said binding results in binding of the MR1 to MAIT cells.

  本发明提供了一种能够与MR1结合的配体，其中该结合导致MR1与MAIT细胞的结合。
• Immunological reagents and uses therefor
  申请人：THE UNIVERSITY OF MELBOURNE

  公开号：US10011602B2

  公开（公告）日：2018-07-03

  The present invention provides a ligand which binds to MR1 wherein said binding results in binding of the MR1 to MAIT cells.

  本发明提供了一种能与 MR1 结合的配体，其中所述的结合能使 MR1 与 MAIT 细胞结合。
• Al-Hassan, Saieba S.; Kulick, Russell J.; Livingstone, Daniel B., Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1980, p. 2645 - 2656
  作者：Al-Hassan, Saieba S.、Kulick, Russell J.、Livingstone, Daniel B.、Suckling, Colin J.、Wood, Hamish C. S.、Wrigglesworth, Roger、Ferone, Robert

  DOI：——

  日期：——