2-溴-3-环戊基-1-甲基吲哚-6-羧酸甲酯 | 494799-35-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: 2-溴-3-环戊基-1-甲基吲哚-6-羧酸甲酯
• 英文名称: 2-bromo-3-cyclopentyl-1-methylindole-6-carboxylic acid methyl ester
• 英文别名: 2-bromo-3-cyclopentyl-1-methyl-1H-indole-carboxylic acid methyl ester；methyl 2-bromo-3-cyclopentyl-1-methyl-1H-indole-6-carboxylate；methyl 2-bromo-3-cyclopentyl-1-methylindole-6-carboxylate
• CAS: 494799-35-8
• 化学式: C₁₆H₁₈BrNO₂
• 分子量: 336.228
• InChiKey: MAINHSJYWMIERU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  31.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-溴-3-环戊基-1-甲基吲哚-6-羧酸甲酯 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 水 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 21.33h， 生成 1h-Indole-6-carboxylic acid,2-[2-(acetylamino)-4-thiazolyl]-3-cyclopentyl-1-methyl-
  参考文献：
  名称：

  Discovery of the First Thumb Pocket 1 NS5B Polymerase Inhibitor (BILB 1941) with Demonstrated Antiviral Activity in Patients Chronically Infected with Genotype 1 Hepatitis C Virus (HCV)

  摘要：

  Combinations of direct acting antivirals (DAAs) that have the potential to suppress emergence of resistant virus and that can be used in interferon-sparing regimens represent a preferred option for the treatment of chronic HCV infection. We have discovered allosteric (thumb pocket 1) non-nucleoside inhibitors of HCV NS5B polymerase that inhibit replication in replicon systems. Herein, we report the late-stage optimization of indole-based inhibitors, which began with the identification of a metabolic liability common to many previously reported inhibitors in this series. By use of parallel synthesis techniques, a sparse matrix of inhibitors was generated that provided a collection of inhibitors satisfying potency criteria and displaying improved in vitro ADME profiles. "Cassette" screening for oral absorption in rat provided a short list of potential development candidates. Further evaluation led to the discovery of the first thumb pocket 1 NS5B inhibitor (BILB 1941) that demonstrated antiviral activity in patients chronically infected with genotype 1 HCV.

  DOI：

  10.1021/jm3006788
• 作为产物：
  描述：

  6-吲哚甲酸 在 palladium dihydroxide 氢氧化钾 、 氯化亚砜 、 氢气 、 溴 、 sodium acetate 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 醋酸异丙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 13.0~75.0 ℃ 、379.21 kPa 条件下， 反应 46.42h， 生成 2-溴-3-环戊基-1-甲基吲哚-6-羧酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  改善 HCV NS5B 聚合酶非核苷变构抑制剂的复制子细胞活性：从苯并咪唑到吲哚支架。

  摘要：

  基于苯并咪唑的丙型肝炎病毒 (HCV) NS5B 聚合酶变构抑制剂被多样化用于各种拓扑相关的支架。用亲脂性吲哚取代极性苯并咪唑核心导致抑制剂在基于细胞的亚基因组 HCV 复制子系统中具有更高的效力。将吲哚支架转移到先前描述的一系列苯并咪唑-色氨酸酰胺中产生了迄今为止在该系列中报告的细胞培养物中最有效的 HCV RNA 复制抑制剂（EC(50) 约 50 nM）。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2006.07.074

文献信息

• Improved replicon cellular activity of non-nucleoside allosteric inhibitors of HCV NS5B polymerase: From benzimidazole to indole scaffolds
  作者：Pierre L. Beaulieu、James Gillard、Darren Bykowski、Christian Brochu、Nathalie Dansereau、Jean-Simon Duceppe、Bruno Haché、Araz Jakalian、Lisette Lagacé、Steven LaPlante、Ginette McKercher、Elaine Moreau、Stéphane Perreault、Timothy Stammers、Louise Thauvette、Jeff Warrington、George Kukolj

  DOI：10.1016/j.bmcl.2006.07.074

  日期：2006.10

  Benzimidazole-based allosteric inhibitors of the hepatitis C virus (HCV) NS5B polymerase were diversified to a variety of topologically related scaffolds. Replacement of the polar benzimidazole core by lipophilic indoles led to inhibitors with improved potency in the cell-based subgenomic HCV replicon system. Transposing the indole scaffold into a previously described series of benzimidazole-tryptophan

  基于苯并咪唑的丙型肝炎病毒 (HCV) NS5B 聚合酶变构抑制剂被多样化用于各种拓扑相关的支架。用亲脂性吲哚取代极性苯并咪唑核心导致抑制剂在基于细胞的亚基因组 HCV 复制子系统中具有更高的效力。将吲哚支架转移到先前描述的一系列苯并咪唑-色氨酸酰胺中产生了迄今为止在该系列中报告的细胞培养物中最有效的 HCV RNA 复制抑制剂（EC(50) 约 50 nM）。
• Viral polymerase inhibitors
  申请人：Boehringer Ingelheim (Canada) Ltd.

  公开号：US20030176433A1

  公开（公告）日：2003-09-18

  An isomer, enantiomer, diastereoisomer, or tautomer of a compound, represented by formula I: 1 wherein: A is O, S, NR 1 , or CR 1 , wherein R 1 is defined herein; ---- represents either a single or a double bond; R 2 is selected from: H, halogen, R 21 , OR 21 , SR 21 , COOR 21 , SO 2 N(R 22 ) 2 , N(R 22 ) 2 , CON(R 22 ) 2 , NR 22 C(O)R 22 or NR 22 C(O)NR 22 wherein R 21 and each R 22 is defined herein; B is NR 3 or CR 3 , with the proviso that one of A or B is either CR 1 or CR 3 , wherein R 3 is defined herein; K is N or CR 4 , wherein R 4 is defined herein; L is N or CR 5 , wherein R 5 has the same definition as R 4 defined above; M is N or CR 7 , wherein R 7 has the same definition as R 4 defined above; Y 1 is O or S; Z is N(R 6a )R 6 or OR 6 , wherein R 6a is H or alkyl or NR 61 R 62 wherein R 61 and R 62 are defined herein; a salt or a derivative thereof, as an inhibitor of HCV NS5B polymerase.

  化合物的异构体，对映异构体，顺反异构体或互变异构体，由以下式I表示： 1 其中： A为O，S，NR 1 或CR 1 ，其中R 1 在此处定义； ----表示单键或双键之一； R 2 从以下选取：H，卤素，R 21 ，OR 21 ，SR 21 ，COOR 21 ，SO 2 N(R 22 ) 2 ，N(R 22 ) 2 ，CON(R 22 ) 2 ，NR 22 C(O)R 22 或NR 22 C(O)NR 22 其中R 21 和每个R 22 在此处定义； B为NR 3 或CR 3 ，但A或B中的一个为CR 1 或CR 3 ， 其中R 3 在此处定义； K为N或CR 4 ，其中R 4 在此处定义； L为N或CR 5 ，其中R 5 的定义与上述定义的R 4 相同； M为N或CR 7 ，其中R 7 的定义与上述定义的R 4 相同； Y 1 为O或S； Z为N(R 6a )R 6 或OR 6 ，其中R 6a 为H或烷基或NR 61 R 62 其中R 61 和R 62 在此处定义； 作为HCV NS5B聚合酶的抑制剂的盐或其衍生物。
• Process for preparing 2, 3-disubstituted indoles
  申请人：Khodabocus Ahmad

  公开号：US20060183752A1

  公开（公告）日：2006-08-17

  Disclosed are processes for making 2,3 disubstituted indole compounds such as compounds of general formula I comprised of the steps of a) reacting a bromoindole compound (i) with a dialkoxyl C 1-5 borane in the presence of a ligand, a palladium catalyst and a base to make a compound of general formula (ii); or alternatively reacting compound (i) with a trialkyl magnesiate reagent, followed by treatment with a borate; b) reacting the product of step a with a R2-Hal where R2-Hal is defined herein.

  披露了制备2,3-二取代吲哚化合物的方法，例如通式I所示的化合物，包括以下步骤： a) 在存在配体、钯催化剂和碱的情况下，将溴吲哚化合物(i)与二烷氧基C1-5硼烷反应，制备通式(ii)化合物；或者将化合物(i)与三烷基镁试剂反应，然后用硼酸盐处理；b) 将步骤a的产物与R2-Hal反应，其中R2-Hal在此处定义。
• [EN] VIRAL POLYMERASE INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS DE LA POLYMERASE VIRALE
  申请人：BOEHRINGER INGELHEIM INT

  公开号：WO2005080388A1

  公开（公告）日：2005-09-01

  An enantiomer, diastereoisomer or tautomer of a compound, represented by formula (I): wherein either A or B is nitrogen and the other B or A is C, and the radicals R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, and R10 are as defined herein, or a salt or ester thereof as viral polymerase inhibitors. The compound is used as an inhibitor of RNA dependent RNA polymerases, particularly those viral polymerases within the Flaviviridae family, more particularly to HCV polymerase.

  一个化合物的对映异构体、顺反异构体或互变异构体，由式(I)表示：其中A或B为氮，另一个为B或A为C，基团R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9和R10如本文所定义，或其盐或酯作为病毒聚合酶抑制剂。该化合物用作RNA依赖性RNA聚合酶的抑制剂，特别是用于Flaviviridae家族内的病毒聚合酶，更具体地用于HCV聚合酶。
• [EN] PROCESS FOR CROSS COUPLING INDOLES<br/>[FR] PROCEDE DE COUPLAGE CROISE D'INDOLES
  申请人：BOEHRINGER INGELHEIM PHARMA

  公开号：WO2005092855A1

  公开（公告）日：2005-10-06

  The present invention provides a process for making a compound of general formula (I) wherein: R = H or C1-8 alkyl X = C3 -C8 cycloalkyl, C3 -C8 aryl or C3 -C8 alkyl; Y = heteroaryl or aryl; Z = H, HO2C-, C1-8 alkyl O2C-, C1-6 alkyl HNC(O)- and as described herein.

  本发明提供了一种制备通式(I)化合物的方法，其中：R = H或C1-8烷基；X = C3-C8环烷基，C3-C8芳基或C3-C8烷基；Y = 杂芳基或芳基；Z = H，HO2C-，C1-8烷基O2C-，C1-6烷基HNC(O)-，以及如本文所述。