1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione | 179178-45-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 179178-45-1
• 化学式: C₂₃H₄₄N₂O₆Si₂
• 分子量: 500.783
• InChiKey: ZRFLPQYOFGOZFC-YZZKKUAISA-N

物化性质

• 密度：
  1.09±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.91
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  97.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione 在 吡啶 、 氨 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 96.5h， 生成 N-[(2R,3S,5R)-3-(tert-Butyl-dimethyl-silanyloxy)-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-2-ylmethyl]-2,2,2-trifluoro-acetamide
  参考文献：
  名称：

  含4'- C-取代胸苷的寡脱氧核苷酸的合成与评价

  摘要：

  将4'- C-羟基甲基胸苷转化为4'- C-甲氧基甲基胸苷和4'- C-氨基甲基胸苷，通过亚磷酰胺化学将其掺入寡脱氧核苷酸中。修饰的寡核苷酸表现出优异的杂交性，并且对蛇毒磷酸二酯酶的稳定性显着提高。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)01432-3
• 作为产物：
  描述：

  5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)胸苷 在 吡啶 、 咪唑 、 sodium hydroxide 、 甲基溴化镁 、 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 、 二甲基亚砜 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 水 为溶剂， 反应 99.0h， 生成 1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  含4'- C-取代胸苷的寡脱氧核苷酸的合成与评价

  摘要：

  将4'- C-羟基甲基胸苷转化为4'- C-甲氧基甲基胸苷和4'- C-氨基甲基胸苷，通过亚磷酰胺化学将其掺入寡脱氧核苷酸中。修饰的寡核苷酸表现出优异的杂交性，并且对蛇毒磷酸二酯酶的稳定性显着提高。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)01432-3

文献信息

• Dinucleotides of 4′-C-vinyl- and 5′-C-allylthymidine as substrates for ring-closing metathesis reactions
  作者：Claus Kirchhoff、Poul Nielsen

  DOI：10.1016/s0040-4039(03)01584-3

  日期：2003.8

  Thymidine derivatives containing a 4'-C-vinyl group or a 5'-C-allyl group are synthesized and used as building blocks for three different dinucleotides. These are evaluated as substrates for ring-closing metathesis cyclisations, and a protected 5'-C-allylthymidine homo-dimer is found to be the most reactive. A protected precursor for a conformationally restricted cyclic dinucleotide with a four carbon 5'-C to 5'-C connection is hereby efficiently obtained, whereas a corresponding three carbon 4'-C to 5'-C connection is obtained in a lower yield. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Synthesis and evaluation of oligodeoxynucleotides containing 4′-C-substituted thymidines
  作者：Guangyi Wang、Wilfried E. Seifert

  DOI：10.1016/0040-4039(96)01432-3

  日期：1996.9

  4′-C-Hydroxymethylthymidine was converted to 4′-C-methoxymethylthymidine and 4′-C-aminomethylthymidine, which were incorporated into oligodeoxynucleotides by phosphoramidite chemistry. The modified oligonucleotides exhibit excellent hybridization and significant improvement in stability to snake venom phosphodiesterase.

  将4'- C-羟基甲基胸苷转化为4'- C-甲氧基甲基胸苷和4'- C-氨基甲基胸苷，通过亚磷酰胺化学将其掺入寡脱氧核苷酸中。修饰的寡核苷酸表现出优异的杂交性，并且对蛇毒磷酸二酯酶的稳定性显着提高。