ethyl N-[2,4-dioxo-6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidin-5-yl]carbamate | 388086-29-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: ethyl N-[2,4-dioxo-6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidin-5-yl]carbamate
• CAS: 388086-29-1
• 化学式: C₁₂H₂₀N₄O₈
• 分子量: 348.313
• InChiKey: JEKYOPKQCXNTEA-BBVRLYRLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  190
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl N-[2,4-dioxo-6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidin-5-yl]carbamate 在 sodium ethanolate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 24.0h， 以70%的产率得到9-(D-1-deoxyribit-1-yl)-1,3,7-trihydropurine-2,6,8-trione
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和评估9-D-ribityl-1,3,7-三氢-2,6,8-嘌呤三酮（一种核黄素合酶和lumazine合酶的有效抑制剂）。

  摘要：

  还原5-硝基-6-D-核糖基氨基尿嘧啶（9），得到5-氨基-6-D-核糖基氨基尿嘧啶（1），其与氯甲酸乙酯反应生成5-乙基氨基甲酰基-6-D-核糖基氨基尿嘧啶（12）。将后者化合物环化成9-D-ribityl-1,3,7-三氢嘌呤-2,6,8-三酮（13），发现它是两种大肠杆菌核黄素合酶（K（i ）0.61 microM）和枯草芽孢杆菌lumazine合酶（K（i）46 microM）。LUM嗪合酶-抑制剂复合物的分子模型表明该酶的Lys135ε-氨基与配体的8-酮基和4'-羟基均存在氢键结合的可能性。核黄素合酶催化反应的双底物类似物1,4-双[1-（9-D-ribityl-1,3,7-三氢嘌呤-2,6,8-三酰基）]丁烷（18），

  DOI：

  10.1021/jo010706r
• 作为产物：
  描述：

  D-Ribamin 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 sodium nitrite 作用下， 以 水 、 乙二醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 ethyl N-[2,4-dioxo-6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidin-5-yl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  在回收内体中访问MR1的MAIT细胞前药激动剂的化学合成，稳定性和活性。

  摘要：

  粘膜相关不变性T（MAIT）细胞是抗菌效应T细胞，可与源自单态分子MR1的细菌核黄素合成的嘧啶反应。MAIT细胞研究中的主要挑战是常用的MAIT激动剂前体5-氨基-6-d-核糖胺基尿嘧啶（5-A-RU）对自氧化不稳定，导致生物活性丧失。在这里，我们通过LCMS描述了两个独立的自氧化过程。为了克服明显的不稳定性，我们报道了通过用可裂解的缬氨酸-瓜氨酸-对氨基苯甲酸氨基甲酸酯修饰5-氨基而生成的5-A-RU前药的合成。该化合物以前药形式稳定，只有在酶促裂解后才释放母体胺（即5-A-RU）。与5-A-RU相比，对前药的体外和体内分析显示MAIT细胞活化特性增强，这与循环内体中的优先加载有关，这是某些天然激动剂使用的途径。因此，该前药设计克服了生物学研究中与5-A-RU相关的难题，并为探索不同的呈递途径提供了机会。

  DOI：

  10.1021/acschembio.9b00902

文献信息

• Design, Synthesis, and Evaluation of 9-<scp>d</scp>-Ribityl-1,3,7-trihydro-2,6,8-purinetrione, a Potent Inhibitor of Riboflavin Synthase and Lumazine Synthase
  作者：Mark Cushman、Donglai Yang、Klaus Kis、Adelbert Bacher

  DOI：10.1021/jo010706r

  日期：2001.12.1

  compound was cyclized to 9-D-ribityl-1,3,7-trihydropurine-2,6,8-trione (13), which was found to be a relatively potent inhibitor of both Escherichia coli riboflavin synthase (K(i) 0.61 microM) and Bacillus subtilis lumazine synthase (K(i) 46 microM). Molecular modeling of the lumazine synthase-inhibitor complex indicated the possibility for hydrogen bonding between the Lys135 epsilon-amino group of the

  还原5-硝基-6-D-核糖基氨基尿嘧啶（9），得到5-氨基-6-D-核糖基氨基尿嘧啶（1），其与氯甲酸乙酯反应生成5-乙基氨基甲酰基-6-D-核糖基氨基尿嘧啶（12）。将后者化合物环化成9-D-ribityl-1,3,7-三氢嘌呤-2,6,8-三酮（13），发现它是两种大肠杆菌核黄素合酶（K（i ）0.61 microM）和枯草芽孢杆菌lumazine合酶（K（i）46 microM）。LUM嗪合酶-抑制剂复合物的分子模型表明该酶的Lys135ε-氨基与配体的8-酮基和4'-羟基均存在氢键结合的可能性。核黄素合酶催化反应的双底物类似物1,4-双[1-（9-D-ribityl-1,3,7-三氢嘌呤-2,6,8-三酰基）]丁烷（18），
• The Chemical Synthesis, Stability, and Activity of MAIT Cell Prodrug Agonists That Access MR1 in Recycling Endosomes
  作者：Joshua Lange、Regan J. Anderson、Andrew J. Marshall、Susanna T. S. Chan、Timothy S. Bilbrough、Olivier Gasser、Claudia Gonzalez-Lopez、Mariolina Salio、Vincenzo Cerundolo、Ian F. Hermans、Gavin F. Painter

  DOI：10.1021/acschembio.9b00902

  日期：2020.2.21

  invariant T (MAIT) cells are antibacterial effector T cells that react to pyrimidines derived from bacterial riboflavin synthesis presented by the monomorphic molecule MR1. A major challenge in MAIT cell research is that the commonly used MAIT agonist precursor, 5-amino-6-d-ribitylaminouracil (5-A-RU), is labile to autoxidation, resulting in a loss of biological activity. Here, we characterize two

  粘膜相关不变性T（MAIT）细胞是抗菌效应T细胞，可与源自单态分子MR1的细菌核黄素合成的嘧啶反应。MAIT细胞研究中的主要挑战是常用的MAIT激动剂前体5-氨基-6-d-核糖胺基尿嘧啶（5-A-RU）对自氧化不稳定，导致生物活性丧失。在这里，我们通过LCMS描述了两个独立的自氧化过程。为了克服明显的不稳定性，我们报道了通过用可裂解的缬氨酸-瓜氨酸-对氨基苯甲酸氨基甲酸酯修饰5-氨基而生成的5-A-RU前药的合成。该化合物以前药形式稳定，只有在酶促裂解后才释放母体胺（即5-A-RU）。与5-A-RU相比，对前药的体外和体内分析显示MAIT细胞活化特性增强，这与循环内体中的优先加载有关，这是某些天然激动剂使用的途径。因此，该前药设计克服了生物学研究中与5-A-RU相关的难题，并为探索不同的呈递途径提供了机会。