作者:Yu Nakagawa、Takashi Doi、Takara Taketani、K. Takegoshi、Yasuhiro Igarashi、Yukishige Ito
DOI:10.1002/chem.201301368
日期:2013.8.5
solid‐state NMR spectroscopy revealed that the C2–C4 region of Man is in close contact with the primary binding site of PRM‐A, while the C1 and C6 positions of Man are relatively distant. The binding geometry was further validated by co‐precipitation experiments using deoxy‐Man derivatives, leading to the proposal that PRM‐A binds not only to terminal Man residues at the non‐reducing end of glycans, but
Pradimicins(PRMs)和benanomicins是唯一具有类凝集素特性的非肽类天然产物家族,也就是说,它们在存在Ca 2+的情况下识别D-甘露吡喃糖苷(Man)。离子。结合其独特的Man结合能力,它们通过与病原体的Man聚糖结合而具有抗真菌和抗HIV的活性。尽管PRM作为凝集素模拟物和治疗先导具有巨大潜力,但它们对Man识别的分子基础尚未建立。它们的聚集体形成倾向阻碍了溶液中的常规相互作用分析,并且由于PRM中存在两个Man结合位点,加剧了分析难度。在这项工作中,我们通过最近开发的分析策略,使用由PRM‐A和Man的1:1配合物组成的固体聚集体,研究了PRMs的原始成员PRM‐A的主要Man结合的几何形状。通过固态NMR光谱对分子间距离的评估表明,Man的C2-C4区与PRM-A的主要结合位点紧密接触,而Man的C1和C6位置相对较远。通过使用脱氧曼衍生物的共沉淀实验进一步验证