methyl (2S)-1-[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(3S,4S)-4-acetamido-3-hydroxy-5-phenylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]propanoyl]-methylamino]-3-phenylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxylate | 1415033-95-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: methyl (2S)-1-[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(3S,4S)-4-acetamido-3-hydroxy-5-phenylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]propanoyl]-methylamino]-3-phenylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxylate
• CAS: 1415033-95-2
• 化学式: C₃₈H₅₃N₅O₈
• 分子量: 707.868
• InChiKey: RMYLRTHTIYLUCB-NLPVQCNXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  51
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  174
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  L-脯氨酸甲酯盐酸盐 在 盐酸 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 palladium on activated charcoal 、 水 、 氢气 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 methyl (2S)-1-[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(3S,4S)-4-acetamido-3-hydroxy-5-phenylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]propanoyl]-methylamino]-3-phenylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  蓝藻肽作为有效的β-分泌酶抑制剂设计的原型以及其他天冬氨酸蛋白酶的选择性化学探针的开发

  摘要：

  受海洋蓝藻天然产物的启发，我们合成了具有中央他汀核心单元的修饰肽，该肽具有天冬氨酸蛋白酶抑制的特征。一系列他西酰胺B类似物抑制了BACE1，BACE1是阿尔茨海默氏病的治疗靶标。我们探查了靶标参与的立体特异性，并确定了与BACE1和相关天冬氨酸蛋白酶，组织蛋白酶D和E相关的其他结构-活性关系。我们将选定的抑制剂与BACE1共结晶，以揭示该活性的结构基础。结合了他西酰胺B和含有间苯二甲酸部分的磺酰胺特性的杂化分子显示出纳摩尔的细胞活性。在一系列严格的基于互补细胞的测定中筛选化合物。我们测量了分泌的APP胞外域（sAPPβ），膜结合的羧基末端片段（CTF），β-淀粉样蛋白（Aβ）肽的水平以及对β-分泌酶（BACE1）的选择性高于γ-分泌酶。优先化合物在体外和体内均显示出合理的稳定性，而我们最有效的抑制剂在降低啮齿动物大脑中的Aβ水平方面显示出功效。

  DOI：

  10.1021/jm301630s

文献信息

• Cyanobacterial Peptides as a Prototype for the Design of Potent β-Secretase Inhibitors and the Development of Selective Chemical Probes for Other Aspartic Proteases
  作者：Yanxia Liu、Wei Zhang、Li Li、Lilibeth A. Salvador、Tiantian Chen、Wuyan Chen、Kevin M. Felsenstein、Thomas B. Ladd、Ashleigh R. Price、Todd E. Golde、Jianhua He、Yechun Xu、Yingxia Li、Hendrik Luesch

  DOI：10.1021/jm301630s

  日期：2012.12.13

  and related aspartic proteases, cathepsins D and E. We cocrystallized selected inhibitors with BACE1 to reveal the structural basis for the activity. Hybrid molecules that combine features of tasiamide B and an isophthalic acid moiety-containing sulfonamide showed nanomolar cellular activity. Compounds were screened in a series of rigorous complementary cell-based assays. We measured secreted APP ectodomain

  受海洋蓝藻天然产物的启发，我们合成了具有中央他汀核心单元的修饰肽，该肽具有天冬氨酸蛋白酶抑制的特征。一系列他西酰胺B类似物抑制了BACE1，BACE1是阿尔茨海默氏病的治疗靶标。我们探查了靶标参与的立体特异性，并确定了与BACE1和相关天冬氨酸蛋白酶，组织蛋白酶D和E相关的其他结构-活性关系。我们将选定的抑制剂与BACE1共结晶，以揭示该活性的结构基础。结合了他西酰胺B和含有间苯二甲酸部分的磺酰胺特性的杂化分子显示出纳摩尔的细胞活性。在一系列严格的基于互补细胞的测定中筛选化合物。我们测量了分泌的APP胞外域（sAPPβ），膜结合的羧基末端片段（CTF），β-淀粉样蛋白（Aβ）肽的水平以及对β-分泌酶（BACE1）的选择性高于γ-分泌酶。优先化合物在体外和体内均显示出合理的稳定性，而我们最有效的抑制剂在降低啮齿动物大脑中的Aβ水平方面显示出功效。