N-γ-[2-acetamido-3,6-di-O-acetyl-2-deoxy-4-O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-β-D-glucopyranosyl]-N-α-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-L-asparagine allyl ester | 553681-61-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: N-γ-[2-acetamido-3,6-di-O-acetyl-2-deoxy-4-O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-β-D-glucopyranosyl]-N-α-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-L-asparagine allyl ester
• 英文别名: Fmoc-Asn(βAc3GlcNAc-βAc2GlcNAc)-OAll；prop-2-enyl (2S)-4-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-acetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]amino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-4-oxobutanoate
• CAS: 553681-61-1
• 化学式: C₄₈H₅₈N₄O₂₀
• 分子量: 1011.0
• InChiKey: XACSFGQHVQPDMR-WJIPIHOUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  72
• 可旋转键数：
  27
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  311
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-γ-[2-acetamido-3,6-di-O-acetyl-2-deoxy-4-O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-β-D-glucopyranosyl]-N-α-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-L-asparagine allyl ester 在 四(三苯基膦)钯 sodium 4-methylbenzenesulfinate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 1.17h， 以57%的产率得到Fmoc-Asn(βAc3GlcNAc-βAc2GlcNAc)-OH
  参考文献：
  名称：

  （2-苯基-2-三甲基甲硅烷基）乙基-（PTMSEL）-接头在复杂细胞表面糖蛋白糖肽部分结构的合成中。

  摘要：

  （2-苯基-2-三甲基甲硅烷基）乙基-（PTMSEL）接头代表一种新型的氟化物敏感锚，用于固相合成受保护的肽和糖肽。使用二氯甲烷中的三水合四丁基氟化铵在几乎中性的条件下进行裂解，因此可以构建对碱性和酸性介质敏感的复杂分子，而碱性和酸性介质通常是裂解标准接头系统所需的。PTMSEL接头的优势在肝肠（LI）-钙粘着蛋白和粘蛋白MUC1的糖肽合成中得到了证明，这些糖肽带有碳水化合物部分，例如N-连接的壳二糖或O-连接的唾液酸-T（N）-残基。这些类型的糖肽的合成是困难的，因为它们在固相上以及在完全脱保护的形式下易于形成二级结构。使用PTMSEL接头，可以根据Fmoc策略通过自动合成来访问这些分子，而无需经常观察到副反应，例如天冬酰胺或二酮哌嗪的形成。

  DOI：

  10.1002/chem.200305304
• 作为产物：
  描述：

  (S)-3-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-4-(allyloxy)-4-oxobutanoic acid 在 氯化亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲苯 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 N-γ-[2-acetamido-3,6-di-O-acetyl-2-deoxy-4-O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-β-D-glucopyranosyl]-N-α-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-L-asparagine allyl ester
  参考文献：
  名称：

  通过光诱导的光反应性氨基酸与糖胺和1-C-氨基甲基糖苷的偶联来合成糖基氨基酸。

  摘要：

  O-乙酰基保护的GlcNAc和壳二糖的糖基胺，以及两个部分未保护的1-C-氨基甲基葡糖苷，与正交保护的N-天冬氨酰5-溴7-硝基二氢吲哚衍生物光化学偶联。反应在中性条件下用近紫外光照射进行。具有N-或C-糖基键的糖基天冬酰胺以10-70mg的规模以60-85％的产率提供。此外，测试了高度光反应性的N-谷氨酰基-4-甲氧基-7-硝基吲哚啉衍生物酰化氨基糖的能力。在二聚的1-C-氨基甲基糖苷或糖基胺存在下照射后，分别以50％和30％的产率获得相应的糖基谷氨酰胺。还描述了光反应性天冬氨酸和1-C-氨基甲基糖苷的制备。

  DOI：

  10.1016/j.carres.2004.12.023

文献信息

• Phototransamidation as a Method for the Synthesis of<i>N</i>-Glycosyl Asparagines
  作者：Kristóf Vízvárdi、Christian Kreutz、Alexander S. Davis、Vincent P. Lee、Benjamin J. Philmus、Ondrej Simo、Katja Michael

  DOI：10.1246/cl.2003.348

  日期：2003.4

  N-Glycosyl asparagines were synthesized by a mild photochemical coupling method in which a photoreactive amide of an aspartic acid’s β-carboxyl group is condensed with an aminosaccharide. Upon excitation, the γ-carbon becomes susceptible to nucleophilic attack and the obtained N-glycosyl asparagines, which may be useful building blocks for the synthesis of N-glycopeptides and neoglycopeptides, are generated in good yields.

  N-糖苷天冬氨酸是通过一种温和的光化学耦合方法合成的，该方法中，天冬氨酸的β-羧基的光反应酰胺与氨基糖发生缩合。在激发后，γ-碳变得易于受到亲核攻击，所得的N-糖苷天冬氨酸可以作为合成N-糖肽和新糖肽的有用构件，并且产率良好。