Fmoc-Asn(βAc3GlcNAc-βAc2GlcNAc)-OH | 154395-62-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Fmoc-Asn(βAc3GlcNAc-βAc2GlcNAc)-OH
• 英文别名: (2S)-4-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-acetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]amino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-4-oxobutanoic acid
• CAS: 154395-62-7
• 化学式: C₄₅H₅₄N₄O₂₀
• 分子量: 970.939
• InChiKey: UTPOLIOEHCSOBG-QQKVYTORSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  69
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.51
• 拓扑面积：
  322
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-芴甲氧羰基-L-丙氨酸五氟苯酯 、 N-芴甲氧羰基-L-苯丙氨酸五氟苯酯 、 Fmoc-L-Glu-OPfp-OH 、 Fmoc-Asn(βAc3GlcNAc-βAc2GlcNAc)-OH 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 生成 (2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-4-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]amino]-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2S)-2-amino-3-methylbutanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-3-hydroxybutanoyl]amino]propanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-oxobutanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]acetyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-6-aminohexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Novel sequential solid-phase synthesis of N-linked glycopeptides from natural sources

  摘要：

  本报告展示了一种从天然来源固相合成 N-连接糖肽的实用且多功能的方法。该方法基于温和的肼解程序，以完整的未还原形式从天然糖蛋白（如胎盘素和核糖核酸酶 B）中释放出 N-连接寡糖，随后形成相应的糖基胺。用碳酸氢铵在水或二甲基亚砜（DMSO）中的饱和溶液处理还原糖 1-7，几乎可以得到定量的糖基胺 8-14。将未受保护的糖基胺 8-14 与侧链激活的天冬氨酸衍生物 Fmoc-Asp(ODhbt)-OBut 16 偶联，可得到 N-糖基化的天冬酰胺衍生物 17-23。随后通过三氟乙酸（TFA）处理对碳水化合物羟基进行乙酰化并裂解叔丁酯，可得到糖基化的 N-连接构筑模块 31-37。然后，将这些结构单元 31-37 加入小鼠血红蛋白衍生的十肽 Hb（67-76）VITAFNEGLK 的糖肽 T 细胞表位类似物 40-46 的多柱肽合成方案中。十肽序列 VITAFNEGLK 与 MHC II 类 Ek 分子结合良好，对 CBA/J 小鼠无免疫原性。本文介绍了在十肽 Hb（67-76）上进行几种天然和非天然糖基化，如 N-乙酰葡糖胺、N,N′-二乙酰壳寡糖、葡萄糖、麦芽三糖、麦芽庚糖以及二元和三元泛酰复合寡糖，从而得到 N-连接的糖肽 40-46。通过 1D- 和 2D-1H 和 13C NMR 光谱以及 ES-MS 对 N-连接的糖肽 40-46 进行了全面鉴定。

  DOI：

  10.1039/a705528e
• 作为产物：
  描述：

  2-acetamido-4-O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-3,6-di-O-acetyl-2-deoxy-α-D-glucopyranosyl chloride 在 四(三苯基膦)钯 、 镍 sodium azide 、 氢气 、 甲基三辛基氯化铵 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 sodium 4-methylbenzenesulfinate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 86.17h， 生成 Fmoc-Asn(βAc3GlcNAc-βAc2GlcNAc)-OH
  参考文献：
  名称：

  （2-苯基-2-三甲基甲硅烷基）乙基-（PTMSEL）-接头在复杂细胞表面糖蛋白糖肽部分结构的合成中。

  摘要：

  （2-苯基-2-三甲基甲硅烷基）乙基-（PTMSEL）接头代表一种新型的氟化物敏感锚，用于固相合成受保护的肽和糖肽。使用二氯甲烷中的三水合四丁基氟化铵在几乎中性的条件下进行裂解，因此可以构建对碱性和酸性介质敏感的复杂分子，而碱性和酸性介质通常是裂解标准接头系统所需的。PTMSEL接头的优势在肝肠（LI）-钙粘着蛋白和粘蛋白MUC1的糖肽合成中得到了证明，这些糖肽带有碳水化合物部分，例如N-连接的壳二糖或O-连接的唾液酸-T（N）-残基。这些类型的糖肽的合成是困难的，因为它们在固相上以及在完全脱保护的形式下易于形成二级结构。使用PTMSEL接头，可以根据Fmoc策略通过自动合成来访问这些分子，而无需经常观察到副反应，例如天冬酰胺或二酮哌嗪的形成。

  DOI：

  10.1002/chem.200305304