(6-azidomethyl-3,4,5-trihydroxy-tetrahydro-pyran-2-yl)-tert-butoxycarbonylamino-acetic acid | 934349-48-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (6-azidomethyl-3,4,5-trihydroxy-tetrahydro-pyran-2-yl)-tert-butoxycarbonylamino-acetic acid
• CAS: 934349-48-1
• 化学式: C₁₃H₂₂N₄O₈
• 分子量: 362.34
• InChiKey: QDSQWRYYYUYXMS-JQRWTQJCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.88
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.85
• 拓扑面积：
  194.31
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (6-azidomethyl-3,4,5-trihydroxy-tetrahydro-pyran-2-yl)-tert-butoxycarbonylamino-acetic acid 在 palladium carbon (20 wt%) 氢气 、 碳酸氢钠 、 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 8.33h， 生成 tert-butyl 3-((S)-2-((R)-2-((2S,3R,4S,5S,6R)-6-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)-3,4,5-trihydroxytetrahydro-2H-pyran-2-yl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)acetamido)-3-(benzylamino)-3-oxopropyl)-1H-indole-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Carbohydrate-Templated Amino Acids and Methods of Using Same

  摘要：

  这项发明通常涉及四氢吡喃基衍生的氨基酸，它们的合成以及它们被纳入肽和肽类似物中。四氢吡喃基约束氨基酸的侧链，从而提供一种可能作为糖或氨基酸类似物的分子，同时也作为组合合成的支架。

  公开号：

  US20080275213A1
• 作为产物：
  描述：

  (2R)-methyl 2-(t-butoxycarbonylamino)-2-(6-azido-6-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-ethanoate 在 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以58 mg的产率得到(6-azidomethyl-3,4,5-trihydroxy-tetrahydro-pyran-2-yl)-tert-butoxycarbonylamino-acetic acid
  参考文献：
  名称：

  葡萄糖为模板的赖氨酸类似物的合成，并结合到抗菌二肽序列kW-OBn中

  摘要：

  描述了两个葡萄糖模板化的（GlcT）赖氨酸类似物GlcTK和GlcTk的合成，其中D-和L-赖氨酸（k和K）的侧链通过掺入D-葡萄糖支架而在构象上受到约束。合成中的关键步骤是高产量的环外葡萄糖衍生的环氧化物的还原环开环反应，以形成可转化为GlcTK和GlcTk的α-羟基酯。为了证明在肽合成中使用这些构件，我们在抗菌二肽序列kW-OBn（W = L-色氨酸）中替换了D-赖氨酸，并确定了对各种革兰氏阳性和革兰氏阴性生物的抗菌活性。我们的结果表明，二肽kW-OBn中未保护的GlcTk取代D-赖氨酸会导致抗菌活性降低。

  DOI：

  10.1016/j.carres.2008.04.018

文献信息

• Synthesis of Sugar-Lysine Chimera with Integrated <i>gluco</i>-Configured 1,3-Hydroxyamine Motif
  作者：Frank Schweizer、Kaidong Zhang、Jialiang Wang、Zhizhi Sun、Dung-Huang Nguyen

  DOI：10.1055/s-2007-968002

  日期：2007.2

  The paper describes the synthesis of glucose-configured sugar-lysine chimeras in which the side chain of lysine is conformationally constrained via incorporation into a d-glucose scaffold. Key step in the synthesis is a high-yielding, reductive ring opening of an exocyclic glucose-derived epoxide to form an α-hydroxyester that can be converted into chimeric sugar-lysine analogues. To demonstrate the use of these novel chimeric sugar-lysine building blocks in peptide coupling, we replaced d-lysine in the antimicro­bial dipeptide sequence kW by a d-glucose-d-lysine chimera.

  论文描述了葡萄糖配置的糖-赖氨酸嵌合体的合成，其中赖氨酸的侧链通过整合到葡萄糖骨架中而具有构象约束。合成中的关键步骤是高产率的环外葡萄糖衍生的环氧乙烷的还原开环，形成α-羟基酯，可转化为嵌合体糖-赖氨酸类似物。为了展示这些新型嵌合体糖-赖氨酸构建块在肽偶联中的应用，我们用葡萄糖-赖氨酸嵌合体替换了抗微生物二肽序列kW中的D-赖氨酸。