4-(((1r,4r)-4-(((2-(6-amino-2-(methylamino)-8-oxo-7,8-dihydro-1H-imidazo[4,5-g]quinazolin-4-yl)ethyl)amino)methyl)cyclohexyl)ethynyl)benzoic acid | 1436408-33-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 4-(((1r,4r)-4-(((2-(6-amino-2-(methylamino)-8-oxo-7,8-dihydro-1H-imidazo[4,5-g]quinazolin-4-yl)ethyl)amino)methyl)cyclohexyl)ethynyl)benzoic acid
• CAS: 1436408-33-1
• 化学式: C₂₈H₃₁N₇O₃
• 分子量: 513.599
• InChiKey: XDNNMNLXSSMBQP-SAABIXHNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.11
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  161.81
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  TRANS-1,4-CYCLOHEXANEDIMETHANOL 在 chloroformamidinium chloride 、 4-二甲氨基吡啶 、 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 tetra-n-propylammonium perruthenate. 、 四丁基氟化铵 、 水 、 三乙酰氧基硼氢化钠 、 N-甲基吗啉氧化物 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.5h， 生成 4-(((1r,4r)-4-(((2-(6-amino-2-(methylamino)-8-oxo-7,8-dihydro-1H-imidazo[4,5-g]quinazolin-4-yl)ethyl)amino)methyl)cyclohexyl)ethynyl)benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  将掺加的配体发射到蛋白质-蛋白质界面中：稳定和破坏tRNA修饰酶中界面形成的有前途的策略

  摘要：

  除了对蛋白质功能的竞争性活性位点抑制外，寡结构域酶中小分子对蛋白质间相互作用的干扰为创新治疗方法开辟了新的前景。tRNA-鸟嘌呤转糖基酶（TGT）是治疗志贺菌病的潜在靶标，仅作为同型二聚体起作用。因此，小分子破坏二聚体界面提供了一种新颖的抑制模式。该酶的一个特殊特征是二聚体界面的活性位点和边缘之间的距离很短。这表明设计了带有刚性，针状取代基的扩展活性位点抑制剂，以突入相互作用界面的潜在热点。合成了带有乙炔基取代基的配体，并用K d表征测量，晶体学，非共价质谱和计算机模拟。与先前确定的具有未扩展活性位点抑制剂的晶体结构相比，参与二聚体界面多次接触的明确定义的环-螺旋基序破裂并暗示一旦结合了加标配体，柔韧性得到了提高。质谱表明溶液中复杂的TGT同型二聚体明显不稳定，但没有完全破坏。由于环-螺旋基序的直接相互作用显然不能决定二聚体的稳定性，因此建议将由几种芳香族氨基酸组成的结构保守的疏水性斑作为

  DOI：

  10.1021/cb400020b