O-nitrophenyl-2-propargylaminylinosine | 1403992-10-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: O-nitrophenyl-2-propargylaminylinosine
• CAS: 1403992-10-8
• 化学式: C₂₁H₂₂N₆O₇
• 分子量: 470.442
• InChiKey: FNWDNOCEJHOCAS-WVSUBDOOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.01
• 重原子数：
  34.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  177.92
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O-nitrophenyl-2-propargylaminylinosine 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 反应 12.0h， 以95%的产率得到5‘-O-DMT-O6-nitrophenyl-2-propargylaminylinosine
  参考文献：
  名称：

  A modified guanosine phosphoramidite for click functionalization of RNA on the sugar edge

  摘要：

  合成了一种含有丙炔基的鸟苷酸磷酰胺，该化合物被纳入siRNA中，使得能够与叠氮荧光团在核苷酸的糖边缘进行点击连接。在这个新位置的标记并没有影响双链的稳定性，这使得能够解构标记、结构和连接位置对RNAi活性的影响。

  DOI：

  10.1039/c2cc34015a
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-三乙酰鸟苷 在 tetrafluoroboric acid 、 三苯基膦 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 、 丙酮 为溶剂， 反应 79.5h， 生成 O-nitrophenyl-2-propargylaminylinosine
  参考文献：
  名称：

  A modified guanosine phosphoramidite for click functionalization of RNA on the sugar edge

  摘要：

  合成了一种含有丙炔基的鸟苷酸磷酰胺，该化合物被纳入siRNA中，使得能够与叠氮荧光团在核苷酸的糖边缘进行点击连接。在这个新位置的标记并没有影响双链的稳定性，这使得能够解构标记、结构和连接位置对RNAi活性的影响。

  DOI：

  10.1039/c2cc34015a