同位素编码的亲和标签 (ICAT) 是基于质谱的定量蛋白质组学的宝贵工具,特别是用于比较正常、应激和患病组织中的蛋白质(半胱
氨酸残基)
硫醇
氧化状态。然而,在大多数商业 ICAT 中使用的
碘乙
酰胺亲电试剂具有较差的
硫醇选择性和适度的加合物形成率,这可能导致虚假结果。因此,我们设计并合成了三种含有
硫醇选择性N-烷基马来
酰亚胺亲电试剂(同位素编码的马来
酰亚胺亲和标签 = IC
MAT)的 ICAT,并将它们评估为用于溶菌酶和肌肉蛋白质组比例分析的质谱探针。两个包含
丁烯/D 8 的IC
MAT 对-
丁烯接头是有效的 MS 探针,但对于典型的蛋白质组学工作流程而言并不理想,因为带有这些标签的肽段通常不会与 HPLC 共流出。转换为亚
苯基/ 13 C 6 -亚
苯基接头解决了这个问题,同时不影响加合物形成的效率。