4-((1H-indol-1-yl)methyl)-N-hydroxybenzamide | 1392835-31-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 4-((1H-indol-1-yl)methyl)-N-hydroxybenzamide
• 英文别名: N-hydroxy-4-[(1H-indol-1-yl)methyl]benzamide；N-hydroxy-4-(indol-1-ylmethyl)benzamide
• CAS: 1392835-31-2
• 化学式: C₁₆H₁₄N₂O₂
• 分子量: 266.299
• InChiKey: SUWMPMSWSJBENV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.06
• 拓扑面积：
  54.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  聚合甲醛 、 4-((1H-indol-1-yl)methyl)-N-hydroxybenzamide 、 二甲胺 在 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 48.0h， 以46%的产率得到4-((3-((dimethylamino)methyl)-1H-indol-1-yl)methyl)-N-hydroxybenzamide
  参考文献：
  名称：

  作为 HDAC6/8/10 抑制剂的二异羟肟酸的设计和合成。

  摘要：

  我们报告了一类用于抑制 HDAC6、HDAC8 和 HDAC10 的选择性多靶点药物的合成和评估。这项研究的概念源于对两种选择性抑制剂图巴他汀 A (HDAC6/10) 和 PCI-34051 (HDAC8) 的结构分析，我们认识到它们具有相同的N-苄吲哚核心。两种抑制剂结构的杂交产生了具有苄基吲哚和吲唑核心基序的二异羟肟酸。这些物质对 HDAC6、HDAC8 和 HDAC10 表现出有效的活性，同时保留对 HDAC1、HDAC2 和 HDAC3 的选择性。最好的物质抑制 SK-N-BE(2)C 神经母细胞瘤细胞系的活力，其 IC 50值与图巴他汀 A 和 PCI-34051 的联合治疗相似。该化合物类别为此类混合分子建立了概念验证，并可作为进一步开发增强型 HDAC6/8/10 抑制剂的起点。

  DOI：

  10.1002/cmdc.202000149
• 作为产物：
  描述：

  吲哚 在 potassium cyanide 、 羟胺 、 sodium hydride 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 4-((1H-indol-1-yl)methyl)-N-hydroxybenzamide
  参考文献：
  名称：

  作为 HDAC6/8/10 抑制剂的二异羟肟酸的设计和合成。

  摘要：

  我们报告了一类用于抑制 HDAC6、HDAC8 和 HDAC10 的选择性多靶点药物的合成和评估。这项研究的概念源于对两种选择性抑制剂图巴他汀 A (HDAC6/10) 和 PCI-34051 (HDAC8) 的结构分析，我们认识到它们具有相同的N-苄吲哚核心。两种抑制剂结构的杂交产生了具有苄基吲哚和吲唑核心基序的二异羟肟酸。这些物质对 HDAC6、HDAC8 和 HDAC10 表现出有效的活性，同时保留对 HDAC1、HDAC2 和 HDAC3 的选择性。最好的物质抑制 SK-N-BE(2)C 神经母细胞瘤细胞系的活力，其 IC 50值与图巴他汀 A 和 PCI-34051 的联合治疗相似。该化合物类别为此类混合分子建立了概念验证，并可作为进一步开发增强型 HDAC6/8/10 抑制剂的起点。

  DOI：

  10.1002/cmdc.202000149

文献信息

• IDO/HDAC双靶点化合物及其合成方法和应用
  申请人：华东师范大学

  公开号：CN110668992B

  公开（公告）日：2023-06-09

  本发明公开了一种IDO/HDAC双靶点化合物，及其药用衍生物、水合物、含有所述化合物的组合物，及其制备方法。本发明还公开了所述化合物作为IDO和HDAC的双靶点抑制剂，用于治疗恶性肿瘤，提高目前IDO和HDAC单靶点小分子抗癌药物的疗效，并减少其毒副作用。本发明还公开了所述化合物用于具有IDO介导的色氨酸代谢途径的病理性特征的疾病，包括自身免疫性疾病、阿尔兹海默症、抑郁症、焦虑症、病毒感染等。
• HDAC INHIBITORS AND THERAPEUTIC METHODS USING THE SAME
  申请人：Kozikowski Alan

  公开号：US20140128408A1

  公开（公告）日：2014-05-08

  Histone deacetylases inhibitors (HDACIs) and compositions containing the same are disclosed. Methods of treating diseases and conditions wherein inhibition of HDAC provides a benefit, like a cancer, a neurodegenerative disorder, a peripheral neuropathy, a neurological disease, traumatic brain injury, stroke, hypertension, malaria, an autoimmune disease, autism, autism spectrum disorders, and inflammation, also are disclosed.

  本发明公开了组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACIs）及其组成物。公开了治疗疾病和状况的方法，其中抑制HDAC提供了益处，如癌症、神经退行性疾病、周围神经病变、神经疾病、创伤性脑损伤、中风、高血压、疟疾、自身免疫疾病、自闭症、自闭症谱系障碍和炎症。
• Selective Inhibition of Histone Deacetylase 10: Hydrogen Bonding to the Gatekeeper Residue is Implicated
  作者：Magalie Géraldy、Michael Morgen、Peter Sehr、Raphael R. Steimbach、Davide Moi、Johannes Ridinger、Ina Oehme、Olaf Witt、Mona Malz、Mauro S. Nogueira、Oliver Koch、Nikolas Gunkel、Aubry K. Miller

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b01936

  日期：2019.5.9

  The discovery of isozyme-selective histone deacetylase (HDAC) inhibitors is critical for understanding the biological functions of individual HDACs and for validating HDACs as drug targets. The isozyme HDAC10 contributes to chemotherapy resistance and has recently been described to be a polyamine deacetylase, but no studies toward selective HDAC10 inhibitors have been published. Using two complementary assays, we found Tubastatin A, an HDAC6 inhibitor, to potently bind HDAC10. We synthesized Tubastatin A derivatives and found that a basic amine in the cap group was required for strong HDAC10 binding. HDAC10 inhibitors mimicked knockdown by causing dose-dependent accumulation of acidic vesicles in a neuroblastoma cell line. Furthermore, docking into human HDAC10 homology models indicated that a hydrogen bond between a cap group nitrogen and the gatekeeper residue Glu272 was responsible for potent HDAC10 binding. Taken together, our data provide an optimal platform for the development of HDAC10-selective inhibitors, as exemplified with the Tubastatin A scaffold.
• Brain Penetrable Histone Deacetylase 6 Inhibitor SW-100 Ameliorates Memory and Learning Impairments in a Mouse Model of Fragile X Syndrome
  作者：Alan P. Kozikowski、Sida Shen、Marta Pardo、Maurício T. Tavares、Dora Szarics、Veronick Benoy、Chad A. Zimprich、Zsófia Kutil、Guiping Zhang、Cyril Bařinka、Matthew B. Robers、Ludo Van Den Bosch、James H. Eubanks、Richard S. Jope

  DOI：10.1021/acschemneuro.8b00600

  日期：2019.3.20

  Disease-modifying therapies are needed for Fragile X Syndrome (FXS), as at present there are no effective treatments or cures. Herein, we report on a tetrahydroquinoline-based selective histone deacetylase 6 (HDAC6) inhibitor SW-100, its pharmacological and ADMET properties, and its ability to improve upon memory performance in a mouse model of FXS, Fmr1-1- mice. This small molecule demonstrates good brain penetrance, low-nanomolar potency for the inhibition of HDAC6 (IC50 = 2.3 nM), with at least a thousand-fold selectivity over all other class I, II, and IV HDAC isoforms. Moreover, through its inhibition of the alpha-tubulin deacetylase domain of HDAC6 (CD2), in cells SW-100 upregulates alpha-tubulin acetylation with no effect on histone acetylation and selectively restores the impaired acetylated alpha-tubulin levels in the hippocampus of Fmr1(-/-) mice. Lastly, SW-100 ameliorates several memory and learning impairments in Fmr1(-/-) mice, thus modeling the intellectual deficiencies associated with FXS, and hence providing a strong rationale for pursuing HDAC6-based therapies for the treatment of this rare disease.
• [EN] HDAC INHIBITORS AND THERAPEUTIC METHODS USING THE SAME<br/>[FR] INHIBITEURS DE HDAC ET PROCÉDÉS THÉRAPEUTIQUES LES UTILISANT
  申请人：UNIV ILLINOIS

  公开号：WO2012106343A3

  公开（公告）日：2012-10-04