6-氨基-1-(2-脱氧-BETA-D-赤式-呋喃戊糖基)-1,5-二氢-4H-吡唑并[3,4-D]嘧啶-4-酮 | 100644-70-0

• 物质功能分类: 医药中间体 - 嘧啶类化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡唑并嘧啶类
• 中文名称: 6-氨基-1-(2-脱氧-BETA-D-赤式-呋喃戊糖基)-1,5-二氢-4H-吡唑并[3,4-D]嘧啶-4-酮
• 英文名称: 8-aza-7-deaza-2'-deoxyguanosine
• 英文别名: 7-deaza-8-aza-2'-deoxyguanosine；6-amino-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one
• CAS: 100644-70-0
• 化学式: C₁₀H₁₃N₅O₄
• 分子量: 267.244
• InChiKey: DLLZQBWJRMFLAD-RRKCRQDMSA-N

物化性质

• 密度：
  2.08±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.9
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  135
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-氨基-1-(2-脱氧-BETA-D-赤式-呋喃戊糖基)-1,5-二氢-4H-吡唑并[3,4-D]嘧啶-4-酮 在 偶氮二异丁腈 、 三正丁基氢锡 、 sodium methylate 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 1,2-二氯乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 58.0h， 生成 6-amino-1-<2',3'-dideoxy-β-D-glycero-pentofuranosyl>-1H-pyrazolo<3,4-d>pyrimidin-4(5H)-one
  参考文献：
  名称：

  8-Aza-7-deaza-2'，3'-dideoxyguanosine：2'deoxy-β-D-rifurfuranoside的脱氧

  摘要：

  6-氨基-1-（2'，3'-二脱氧-β-D-甘油-呋喃呋喃糖基）-1 H-吡唑并[3,4- d ]嘧啶-4（5 H）-one（= 8描述了通过五步脱氧途径从其2′-脱氧核糖呋喃糖苷5a中得到的-aza-7-deaza-2′，3′-二脱氧鸟苷；1）。通过固-液相转移糖基化制备5a，3a的前体，其产率比液-液法高（57％）。3b的氨甲酰苯胺提供了二氨基核苷3c。与2'，3'-二脱氧鸟苷（2）相比，化合物1在N-糖基键上对酸的敏感性较低。

  DOI：

  10.1002/hlca.19880710410
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-4,6-二氯嘧啶-5-甲醛 在 四丁基硫酸氢铵 氢氧化钾 、 sodium hydroxide 、 sodium methylate 、 一水合肼 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 27.2h， 生成 6-氨基-1-(2-脱氧-BETA-D-赤式-呋喃戊糖基)-1,5-二氢-4H-吡唑并[3,4-D]嘧啶-4-酮
  参考文献：
  名称：

  8-Aza-7-脱氮鸟嘌呤和相关的吡唑并[3,4- d ]嘧啶的2'-脱氧核糖呋喃糖苷的合成

  摘要：

  所述Ñ（1） -和Ñ（2） - （2'- deoxyribofuranosides）1和2，分别为8-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤的制备通过相转移的糖基化在存在或不存在卜4 NHSO 4作为6-氨基-4-甲氧基-1 H-吡唑并[3,4- d ]嘧啶（7c）与2-脱氧-3,5-二-O-（对甲苯甲酰基）-α-D-赤型-的催化剂戊呋喃糖酰氯（10）。以类似的方式，但是没有催化剂并且使用THF作为有机相，6-氨基-4-氯核苷11b和12b从7a合成并分别转化为N（1）-和N（2）-取代的4-thioxo类似物17a和18a。的比率Ñ（1） -至Ñ（2）-glycosylation为2：1 7C和1：1为图7a，即 取决于核碱基的结构。与N（1）化合物相比，N（2）-（β-D-2'-脱氧核糖呋喃糖苷）的H +催化N-糖基水解速率大大降低。但是，N（1）-核苷1它是2'-脱氧鸟苷的等排物，具有足够的稳定性，可稍后用于固相寡核苷酸合成。

  DOI：

  10.1002/hlca.19860690714

文献信息

• Synthesis of 7-Halogenated 8-Aza-7-deaza-2′-deoxyguanosines and Related Pyrazolo[3,4-d]pyrimidine 2′-Deoxyribonucleosides
  作者：Frank Seela、Georg Becher

  DOI：10.1055/s-1998-4483

  日期：1998.2

  The synthesis of 7-bromo and 7-iodo derivatives of 8-aza-7-deaza-2′-deoxyguanosine (2, 3) as well as the halogenated 4-alkoxy derivatives 4 a - c and 5 a - c is described. Glycosylation of the halogenated pyrazolo[3,4-d]pyrimidine anions of 7 a -c or 8 a - c with 2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-d-erythro-pentofuranosyl chloride (9) yields regioisomeric glycosylation products, the N(1)-isomers 10 a - c and 11 a - c as well as the N(2)-compounds 12 a - c. The latter isomers lose their halogen during the glycosylation in the presence of non-anhydrous KOH. Anhydrous conditions (NaH) furnished 10 c, 11 c together with the halogenated N(2)-isomers 13 a,b. Compounds 10 a - c, and 11 a - c were deprotected and converted to the 4-alkoxy nucleosides 4 a - c and 5 a - c. The N(1)-nucleosides 4 c and 5 c were hydrolyzed to give the 7-bromo or 7-iodo derivatives of 8-aza-7-deaza-2′-deoxyguanosines 2 and 3. Different from regular 2′-deoxyribonucleosides the sugar moiety of pyrazolo[3,4-d]pyrimidine 2′-deoxyribonucleosides shows a preferred N-type pucker (3T2) in solution, a conformation which is also detected in the solid state.

  描述了8-氮杂-7-脱氮-2′-去氧鸟苷（2, 3）的7-溴和7-碘衍生物的合成，以及卤化的4-烷氧基衍生物4a-c和5a-c。将7a-c或8a-c的卤化吡唑[3,4-d]嘧啶阴离子与2-去氧-3,5-二-O-(对甲苯酰基)-α-d-赤糖善氟糖氯化物（9）进行糖苷化反应，得到区域异构糖苷化产物，N(1)-异构体10a-c和11a-c，以及N(2)-化合物12a-c。后者异构体在无水氢氧化钾存在下糖苷化时失去卤素。在无水条件下（氢化钠）生成了10c、11c以及卤化的N(2)-异构体13a,b。化合物10a-c和11a-c被去保护并转化为4-烷氧基核糖苷4a-c和5a-c。N(1)-核糖苷4c和5c被水解，得到8-氮杂-7-脱氮-2′-去氧鸟苷的7-溴或7-碘衍生物2和3。与常规的2′-去氧核糖核苷不同，吡唑[3,4-d]嘧啶2′-去氧核糖核苷的糖部分在溶液中显示出优先的N型扭曲（3T2），这种构象在固态中也得到了验证。
• Investigation of 8-Aza-7-Deaza Purine Nucleoside Derivatives
  作者：Hang Ren、Haoyun An、Jingchao Tao

  DOI：10.3390/molecules24050983

  日期：——

  6-amino-4-methoxy-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine and its iodo- and bromo- analogues with the protected ribofuranose and 2'-deoxyribofuranose under different conditions resulted in the synthesis of N⁸- and N⁸-glycosylated purine nucleosides. Five key intermediate nucleosides, having 6-methoxy, 7-iodo, and 2-bromo groups, were further derivatized to 23 final 8-aza-7-deazapurine nucleoside derivatives. The structures

  在不同条件下，6-氨基-4-甲氧基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶及其碘代-和溴代类似物与被保护的呋喃核糖和2'-脱氧核糖呋喃糖的糖基化反应导致N⁸-和N⁸的合成-糖基化嘌呤核苷。具有6-甲氧基，7-碘和2-溴基团的五个关键的中间核苷被进一步衍生为23个最终的8-氮杂-7-脱氮嘌呤核苷衍生物。基于UV和NMR光谱确定N +和N +-糖基化产物的结构。代表性化合物的2D NMR谱图的HMBC分析和X射线晶体学研究清楚地证实了核糖环与嘌呤环的N +或N +位置的连接。评估了这些新化合物的抗癌活性。
• [EN] MODIFIED DNA-ENCODED CHEMICAL LIBRARY AND METHODS RELATED THERETO<br/>[FR] BIBLIOTHÈQUE CHIMIQUE D'ADN CODÉ MODIFIÉ ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS
  申请人：UNIV DORTMUND TECH

  公开号：WO2021191333A1

  公开（公告）日：2021-09-30

  The present invention relates to a compound library comprising a plurality of conjugate molecules, wherein said conjugates comprise a small organic molecule covalently coupled to a nucleic acid moiety, wherein the nucleic acid moiety comprises or consists of 7-deazapurines and/or 7-deaza-8-azapurines, and, optionally, modified and/or unmodified pyrimidine nucleotides. Further, the present invention relates to the use of said library for screening compounds binding to a target molecule and methods of synthesizing said library.

  本发明涉及一种化合物库，其中包含多个共轭分子，所述共轭物包含一个小有机分子与一个核酸基团共价耦合，其中核酸基团包含或仅包含7-脱氮嘌呤和/或7-脱氮-8-氮杂嘧啶，以及可选的修饰和/或未修饰的嘧啶核苷酸。此外，本发明还涉及使用该库筛选与目标分子结合的化合物和合成该库的方法。
• Synthesis of Oligodeoxynucleotides Eliminating the Use of Acetonitrile
  作者：Jiří Smrt、Luboš Arnold、Jan Svoboda、Roman Hák、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1135/cccc19931692

  日期：——

  H-Phosphonate synthesis of oligodeoxynucleotids is described in which acetonitrile is replaced by dichloromethane. This solvent is thereafter easily regenerated and reused. Practically "one solvent" procedure of oligonucleotide synthesis has been established. The preparation of 5'-O-(4,4'-dimethoxytriphenylmethyl)-N²-(N,N-dimethylaminomethylene)-2'-deoxyguanosine (Ic) and 5'-O-(4,4'-dimethoxytriphenylmethyl)-N⁶-(N,N-dimethylaminomethylene)-2'-deoxyadenosine (Id) is described.

  本文介绍了一种使用二氯甲烷替代乙腈的H-磷酸酯合成寡聚脱氧核苷酸的方法。该溶剂可以被轻松再生和重复使用，从而建立了一种“单溶剂”合成寡核苷酸的实用程序。同时，文中还介绍了5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N²-(N,N-二甲基氨基甲烷基)-2'-脱氧鸟嘌呤核苷（Ic）和5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N⁶-(N,N-二甲基氨基甲烷基)-2'-脱氧腺嘌呤核苷（Id）的制备方法。
• Oligonucleotide duplexes containing N⁸-glycosylated 8-aza-7-deazaguanine and self-assembly of 8-aza-7-deazapurines on the nucleoside and the oligomeric level
  作者：Frank Seela、Rita Kröschel

  DOI：10.1039/b309485p

  日期：——

  8-aza-7-deazaguanine N8-(2'-deoxy-beta-D-ribofuranoside) (1) was synthesized, converted into the phosphoramidite 4 and incorporated into oligonucleotides. Nucleoside 1 forms stable base pairs with 2'-deoxy-5-methylisocytidine in DNA with antiparallel chain orientation (aps) and with 2'-deoxycytidine in duplexes with parallel chains (ps). According to the CD spectra self-complementary oligonucleotides d(1-m5isoC)3

  合成了8-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤N8-（2'-脱氧-β-D-核呋喃糖苷）（1），转化为亚磷酰胺4，并掺入了寡核苷酸中。核苷1与DNA中具有反平行链方向（aps）的2'-脱氧-5-甲基异胞苷和与平行链（ps）形成双链体的2'-脱氧胞苷形成稳定的碱基对。根据CD光谱，自互补寡核苷酸d（1-m5isoC）3和d（1-C）形成自主DNA结构。核苷1或规则连接的8-氮杂-7-脱氮基-2'-脱氧鸟嘌呤均不形成G样四联体，而规则连接的8-氮杂-7-脱氮基2'-脱氧异鸟嘌呤则不能提供较大的分子组装体，这些分子会被大体积破坏7-溴取代基。通过ESI-MS光谱在单体核苷上进行了验证，通过HPLC分析在寡核苷酸上进行了验证。