N2,N6-bis(4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl)-4-(prop-2-yn-1-yloxy)pyridine-2,6-dicarboxamide | 1393488-13-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: N2,N6-bis(4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl)-4-(prop-2-yn-1-yloxy)pyridine-2,6-dicarboxamide
• 英文别名: 2-N,6-N-bis[4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl]-4-prop-2-ynoxypyridine-2,6-dicarboxamide
• CAS: 1393488-13-5
• 化学式: C₃₂H₂₉N₇O₅
• 分子量: 591.626
• InChiKey: OHNZSENJQDTLFJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.16
• 拓扑面积：
  177
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2,N6-bis(4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl)-4-(prop-2-yn-1-yloxy)pyridine-2,6-dicarboxamide 、 1-(2-叠氮乙基)吡咯烷 在 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 sodium ascorbate 作用下， 以 水 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 0.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  通过原位点击化学选择性 RNA 与 DNA G-四链体靶向

  摘要：

  一切都按部就班：通过使用由非沃森-克里克 DNA 二级结构催化的一系列炔烃和叠氮化物构件的无铜 1,3-偶极环加成，已经鉴定出一种有效的端粒靶向小分子（参见图片）。这种方法可以快速识别出意想不到的有效小分子探针，以选择性地靶向给定的 RNA 或 DNA。

  DOI：

  10.1002/anie.201206281
• 作为产物：
  描述：

  dimethyl 4-(prop-2-yn-1-yloxy)pyridine-2,6-dicarboxylate 在 1-氯-N,N,2-三甲基丙烯胺 、 水 、 三氟乙酸 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N2,N6-bis(4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl)-4-(prop-2-yn-1-yloxy)pyridine-2,6-dicarboxamide
  参考文献：
  名称：

  通过原位点击化学选择性 RNA 与 DNA G-四链体靶向

  摘要：

  一切都按部就班：通过使用由非沃森-克里克 DNA 二级结构催化的一系列炔烃和叠氮化物构件的无铜 1,3-偶极环加成，已经鉴定出一种有效的端粒靶向小分子（参见图片）。这种方法可以快速识别出意想不到的有效小分子探针，以选择性地靶向给定的 RNA 或 DNA。

  DOI：

  10.1002/anie.201206281

文献信息

• Reprogramming the Mechanism of Action of Chlorambucil by Coupling to a G-Quadruplex Ligand
  作者：Marco Di Antonio、Keith I. E. McLuckie、Shankar Balasubramanian

  DOI：10.1021/ja5014344

  日期：2014.4.23

  The nitrogen mustard Chlorambucil (Chl) generates covalent adducts with double-helical DNA and inhibits cell proliferation. Among these adducts, interstrand cross-links (ICLs) are the most toxic, as they stall replication by generating DNA double strand breaks (DSBs). Conversely, intrastrand cross-links generated by Chl are efficiently repaired by a dedicated Nucleotide Excision Repair (NER) enzyme. We synthesized a novel cross-linking agent that combines Chl with the G-quadruplex (G4) ligand PDS (PDS-Chl). We demonstrated that PDS-Chl alkylates G4 structures at low mu M concentrations, without reactivity toward double- or single-stranded DNA. Since intramolecular G4s arise from a single DNA strand, we reasoned that preferential alkylation of such structures might prevent the generation of ICLs, while favoring intrastrand cross-links. We observed that PDS-Chl selectively impairs growth in cells genetically deficient in NER, but did not show any sensitivity to the repair gene BRCA2, involved in double-stranded break repair. Our findings suggest that G4 targeting of this clinically important alkylating agent alters the overall mechanism of action. These insights may inspire new opportunities for intervention in diseases specifically characterized by genetic impairment of NER, such as skin and testicular cancers.