9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-1-(2,4-dinitrophenyl)purin-6-one | 1072463-01-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-1-(2,4-dinitrophenyl)purin-6-one
• CAS: 1072463-01-4
• 化学式: C₂₅H₃₂N₆O₉Si
• 分子量: 588.649
• InChiKey: LRVACMWLVUGBPH-ZDXOVATRSA-N

物化性质

• 沸点：
  740.9±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.46±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.84
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  179
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-1-(2,4-dinitrophenyl)purin-6-one 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 17.0h， 生成 1-(5-hydroxypentyl)-2',3'-O-isopropylideneinosine
  参考文献：
  名称：

  cIDPR 衍生物的新线性前体作为 cADPR 的稳定类似物：从海胆卵中分离出具有 Ca2+ 调节活性的有效第二信使。

  摘要：

  在此，我们报道了环状 ADP-核糖肌苷类似物 (cADPR) 的一小组线性前体的合成，cADPR 是首先从海胆卵提取物中分离出来的兰尼碱受体库中参与 Ca2+ 动员的第二信使。合成的化合物是从肌苷开始获得的，其特征在于N1-烷基链取代了“北”核糖，并且在N1-烷基链和/或5'-糖位置的末端连接有磷酸基团。还报告了在分化的 C2C12 细胞上进行的初步 Ca2+ 动员测定。

  DOI：

  10.3390/md17080476
• 作为产物：
  描述：

  1-氯-2,4-二硝基苯 、 5'-O-TBDMS-2',3'-O-isopropylideneinosine 在 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-1-(2,4-dinitrophenyl)purin-6-one
  参考文献：
  名称：

  Concise synthesis of novel acyclic analogues of cADPR with an ether chain as the northern moiety

  摘要：

  为了研究环腺苷二磷酸核糖（cADPR）水解产物的性质，合成了一系列以醚链作为北基团，8取代腺嘌呤或次黄嘌呤作为碱基团的新型无环类cADPR类似物，合成过程包括N1取代反应，随后进行双磷酸化、磷酰胺化或焦磷酸化。这些化合物还提供了合成cADPR类似物的多种前体。

  DOI：

  10.1039/b9nj00595a

文献信息

• Isatins Inhibit N⁵-CAIR Synthetase by a Substrate Depletion Mechanism
  作者：Cale C. Streeter、Qian Lin、Steven M. Firestine

  DOI：10.1021/acs.biochem.8b00939

  日期：2019.4.30

  new agents is de novo purine biosynthesis as studies have shown that bacteria and lower eukaryotes synthesize purines differently than humans. Microorganisms utilize two enzymes, N5-CAIR synthetase and N5-CAIR mutase, to convert 5-aminoimidazole ribonucleotide (AIR) into 4-carboxy-5-aminoimidazole ribonucleotide (CAIR) through the intermediate N5-carboxy-5-aminoimidazole ribonucleotide (N5-CAIR). In

  抗生素耐药性感染的持续增加，加上新的抗菌药物渠道有限，凸显了对开发新的抗菌药物的迫切需求。从头研究嘌呤的生物合成是新药的一种潜在途径，因为研究表明细菌和低等真核生物合成嘌呤的方法与人类不同。微生物利用N5-CAIR合成酶和N5-CAIR突变酶这两种酶通过中间N5-羧基-5-氨基咪唑核糖核苷酸（N5- CAIR）。相反，脊椎动物通过AIR羧化酶直接将AIR转换为CAIR。针对N5-CAIR合成酶的高通量筛选确定了一组具有2,3-吲哚二酮（isatin）核心抑制该酶的化合物。虽然最初的研究表明isatins通过非竞争性机制抑制酶，但在这里我们显示isatins通过底物耗竭机制抑制N5-CAIR合成酶。出乎意料的是，我们发现Isatin与底物AIR迅速且可逆地反应。反应速率取决于Isatin苯基部分上的取代基，其中5-和7-Bromoisatin的速度快于4-Bromoisatin。这些研究表明
• Design and synthesis of 4″,6″-unsaturated cyclic ADP-carbocyclic-ribose, a Ca2+-mobilizing agent selectively active in T cells
  作者：Takashi Kudoh、Takashi Murayama、Minako Hashii、Haruhiro Higashida、Takashi Sakurai、Clarisse Maechling、Bernard Spiess、Karin Weber、Andreas H. Guse、Barry V.L. Potter、Mitsuhiro Arisawa、Akira Matsuda、Satoshi Shuto

  DOI：10.1016/j.tet.2008.07.068

  日期：2008.10

  We previously developed cyclic ADP-carbocyclic-ribose (cADPcR, 3a) as a stable mimic of cyclic ADP-ribose (cADPR, 1), a Ca2+-mobilizing second messenger. The unsaturated carbocyclic-ribose analogs of cADPR, i.e., 4″,6″-didehydro-cADPcR (8a) and its inosine congener 4″,6″-didehydro-cIDPcR (8b) were newly designed and successfully synthesized using the key intramolecular condensation reaction with S-phenyl

  我们先前开发了环状ADP-碳环核糖（cADPcR，3a）作为环状ADP-核糖（cADPR，1）（一种动员Ca 2+的第二信使）的稳定模拟物。cADPR的不饱和碳环核糖类似物，即4”，6” -didehydro-cADPcR（8a）及其肌苷同源物4”，6” -didehydro-cIDPcR（8b）进行了新的设计，并利用关键的分子内缩合成功合成了与S-苯基硫代磷酸酯型底物反应。Ca 2+在海胆卵匀浆，NG108-15神经元细胞和透化的Jurkat T淋巴细胞中检测了化合物的动员能力，这可能表明4“，6” -didehydro-cADPcR是第一个在T细胞中有选择性活性的cADPR类似物。还研究了8a的酸碱行为和构象，并将其与cADPcR进行了比较。