5-amino-1-(5-O-tert-butyldimethylsilyl-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)imidazole-4-carboxamide | 197437-76-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 咪唑核糖核苷和核糖核苷酸
• 英文名称: 5-amino-1-(5-O-tert-butyldimethylsilyl-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)imidazole-4-carboxamide
• 英文别名: 5-amino-1-(5′-O-tert-butyldimethylsilyl-2′,3′-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)imidazole-4-carboxamide；1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-5-aminoimidazole-4-carboxamide
• CAS: 197437-76-6
• 化学式: C₁₈H₃₂N₄O₅Si
• 分子量: 412.561
• InChiKey: VRGWBIRXFXTUSD-XNIJJKJLSA-N

物化性质

• 沸点：
  573.4±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.31±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.0
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  124
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-amino-1-(5-O-tert-butyldimethylsilyl-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)imidazole-4-carboxamide 在 三氟乙酸 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 17.0h， 以78%的产率得到阿卡地新
  参考文献：
  名称：

  探究 AIR 羧化酶紧密结合抑制剂的作用机制

  摘要：

  氨基咪唑核糖核苷酸 (AIR) 羧化酶催化嘌呤中间体 4-羧基-5-氨基咪唑核糖核苷酸 (CAIR) 的合成。以前，我们已经表明化合物 4-硝基-5-氨基咪唑核糖核苷酸 (NAIR) 是一种缓慢、紧密结合的酶抑制剂，Ki 为 0.34 nM。NAIR 的结构属性和缓慢、紧密的结合特性表明该化合物是一种过渡态或反应性中间体类似物。然而，尚不清楚 NAIR 的哪些分子特征有助于 AIR 羧化酶的两种拟议机制中的任何一种的模拟特性。为了获得关于 NAIR 对 AIR 羧化酶的有效抑制机制的更多信息，制备并评估了一系列杂环类似物。我们发现所有化合物都是比 NAIR 更弱的抑制剂，并且 CAIR 类似物不是该酶的替代底物。令人惊讶的是，NAIR 结构的相当细微的变化会导致结合亲和力的深刻变化。酶中间体和这些抑制剂的计算研究表明，NAIR 显示出类似于提议的反应中间体的静电势表面。结果表明 AIR 羧

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2008.11.057
• 作为产物：
  描述：

  阿卡地新 在 咪唑 、 对甲苯磺酸 、 原甲酸三乙酯 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 5-amino-1-(5-O-tert-butyldimethylsilyl-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)imidazole-4-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Hutchinson, Edward J.; Taylor, Brian F.; Blackburn, G. Michael, Chemical Communications, 1997, # 19, p. 1859 - 1860

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Isatins Inhibit N⁵-CAIR Synthetase by a Substrate Depletion Mechanism
  作者：Cale C. Streeter、Qian Lin、Steven M. Firestine

  DOI：10.1021/acs.biochem.8b00939

  日期：2019.4.30

  new agents is de novo purine biosynthesis as studies have shown that bacteria and lower eukaryotes synthesize purines differently than humans. Microorganisms utilize two enzymes, N5-CAIR synthetase and N5-CAIR mutase, to convert 5-aminoimidazole ribonucleotide (AIR) into 4-carboxy-5-aminoimidazole ribonucleotide (CAIR) through the intermediate N5-carboxy-5-aminoimidazole ribonucleotide (N5-CAIR). In

  抗生素耐药性感染的持续增加，加上新的抗菌药物渠道有限，凸显了对开发新的抗菌药物的迫切需求。从头研究嘌呤的生物合成是新药的一种潜在途径，因为研究表明细菌和低等真核生物合成嘌呤的方法与人类不同。微生物利用N5-CAIR合成酶和N5-CAIR突变酶这两种酶通过中间N5-羧基-5-氨基咪唑核糖核苷酸（N5- CAIR）。相反，脊椎动物通过AIR羧化酶直接将AIR转换为CAIR。针对N5-CAIR合成酶的高通量筛选确定了一组具有2,3-吲哚二酮（isatin）核心抑制该酶的化合物。虽然最初的研究表明isatins通过非竞争性机制抑制酶，但在这里我们显示isatins通过底物耗竭机制抑制N5-CAIR合成酶。出乎意料的是，我们发现Isatin与底物AIR迅速且可逆地反应。反应速率取决于Isatin苯基部分上的取代基，其中5-和7-Bromoisatin的速度快于4-Bromoisatin。这些研究表明
• Nucleosides and Nucleotides. 184. Synthesis and Conformational Investigation of Anti-Fixed 3-Deaza-3-halopurine Ribonucleosides¹^,²
  作者：Noriaki Minakawa、Naoshi Kojima、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/jo990638x

  日期：1999.9.1

  A versatile synthetic route to 3-deaza-3-haloinosines 6-8 and 46, -adenosines 15-17 and 64, and -guanosines 25, 26, and 52 is described. 3-Deaza-3-chloro-, -bromo-, and -iodopurine ribonucleosides can be synthesized by treating the 3-deazapurine ribonucleosides with N-halosuccinimides. For the synthesis of 3-deaza-3-fluoropurine ribonucleosides, 5-formylimidazole-4-carboxamide ribosides 34 and 35 prepared from 5-iodoimidazole-4-carboxamide derivatives 29 and 31 were us ed as the key intermediates. The reaction of 34 and 35 with lithium (trimethylsilyl)acetylide and sodium cyanide, respectively, followed by appropriate manipulations gave 3-deaza-3-fluoroinosine derivative 46 and 3-deaza-3-fluoroguanosine derivative 52. 3-Deaza-3-fluoroadenosine (64) was also synthesized by selective reductive deamination of 4,6-diamino-7-fluoroimidazo[4,5-c]pyridine derivative 51, followed by deprotection. A conformational analysis using H-1 NMR and NOE experiments showed that the introduction of halogens (chloro, bromo, and iodo) into the 3-position of 3-deazapurine ribonucleosides forced fixation of the glycosyl torsion angle in the anti region, but did not-abnormally influence sugar puckering. On the other hand, 3-deaza-3-fluoropurine ribonucleosides should rotate freely around the glycosyl bond.
• Nucleosides and Nucleotides. Part 207: Studies in the Chemical Conversion of the 4-Carboxamide Group of 5-Amino-1-β-d-ribofuranosylimidazole-4-carboxamide (AICA-Riboside). Application for the Synthesis of 1-Deazaguanosine
  作者：Naoshi Kojima、Noriaki Minakawa、Akira Matsuda

  DOI：10.1016/s0040-4020(00)00712-2

  日期：2000.9

  A mild and versatile chemical conversion of the 4-carboxamide group of 5-amino-1-beta-D-ribofuranosylimidazole-4-carboxamide (AICA-riboside) is described. The reaction of protected AICA-riboside with di-tert-butyl dicarbonate gave 5-[N,N-di-(tert-butoxycarbonyl)]-amino-1-(5-O-tert-butyldimethylsilyl-2,3-O-isopropylidene-beta-D-ribofurnaosyl)imidazole-4-[N,N-di-(tert-butoxycarbonyl)]carboxamide in 71% yield. The resulting tetraBoc derivative was treated with sodium methoxide, benzylamine, or acetonitrile anion to give the corresponding methyl ester, N-benzylcarboxamide, or cyanoacetyl products. The 4-cyanoacetylimidazole derivative was converted into 1-deazaguanosine via an intramolecular cyclization. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Hutchinson, Edward J.; Taylor, Brian F.; Blackburn, G. Michael, Chemical Communications, 1997, # 19, p. 1859 - 1860
  作者：Hutchinson, Edward J.、Taylor, Brian F.、Blackburn, G. Michael

  DOI：——

  日期：——
• Interrogating the mechanism of a tight binding inhibitor of AIR carboxylase
  作者：Steven M. Firestine、Weidong Wu、Hasik Youn、V. Jo Davisson

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.11.057

  日期：2009.1

  The enzyme aminoimidazole ribonucleotide (AIR) carboxylase catalyzes the synthesis of the purine intermediate, 4-carboxy-5-aminoimidazole ribonucleotide (CAIR). Previously, we have shown that the compound 4-nitro-5-aminoimidazole ribonucleotide (NAIR) is a slow, tight binding inhibitor of the enzyme with a Ki of 0.34 nM. The structural attributes and the slow, tight binding characteristics of NAIR implicated

  氨基咪唑核糖核苷酸 (AIR) 羧化酶催化嘌呤中间体 4-羧基-5-氨基咪唑核糖核苷酸 (CAIR) 的合成。以前，我们已经表明化合物 4-硝基-5-氨基咪唑核糖核苷酸 (NAIR) 是一种缓慢、紧密结合的酶抑制剂，Ki 为 0.34 nM。NAIR 的结构属性和缓慢、紧密的结合特性表明该化合物是一种过渡态或反应性中间体类似物。然而，尚不清楚 NAIR 的哪些分子特征有助于 AIR 羧化酶的两种拟议机制中的任何一种的模拟特性。为了获得关于 NAIR 对 AIR 羧化酶的有效抑制机制的更多信息，制备并评估了一系列杂环类似物。我们发现所有化合物都是比 NAIR 更弱的抑制剂，并且 CAIR 类似物不是该酶的替代底物。令人惊讶的是，NAIR 结构的相当细微的变化会导致结合亲和力的深刻变化。酶中间体和这些抑制剂的计算研究表明，NAIR 显示出类似于提议的反应中间体的静电势表面。结果表明 AIR 羧