diethyl [1'-(5',6'-dideoxy-2',3'-O-isopropylidene-β-D-ribo-5'-hexenofuranosyl)uracil]-6'-phosphonate | 310408-79-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: diethyl [1'-(5',6'-dideoxy-2',3'-O-isopropylidene-β-D-ribo-5'-hexenofuranosyl)uracil]-6'-phosphonate
• 英文别名: 1-(2',3'-O-isopropylidene-5',6'-dideoxy-6'-diethylphosphono-β-D-ribo-5'(E)-hexenofuranosyl)uracil；1-[5,6-dideoxy-6-(diethoxyphosphinyl)-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribo-hex-5-enofuranosyl]uracil
• CAS: 310408-79-8
• 化学式: C₁₇H₂₅N₂O₈P
• 分子量: 416.368
• InChiKey: IJCPCLTUHFAHSE-RAUDDLCTSA-N

物化性质

• 密度：
  1.341±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.73
• 重原子数：
  28.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  118.08
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  diethyl [1'-(5',6'-dideoxy-2',3'-O-isopropylidene-β-D-ribo-5'-hexenofuranosyl)uracil]-6'-phosphonate 在 三甲基溴硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 1-(5',6'-dideoxy-6'-phosphono-β-D-ribo-5'(E)-hexenofuranosyl)uracil disodium salt
  参考文献：
  名称：

  5'，6'-核苷磷酸酯类似物体系结构：代谢酶的合成和比较评价

  摘要：

  核苷膦酸酯已被设计为稳定的5'-单核苷酸模拟物，如今被认为是一类有效的抗病毒剂。在细胞内，它们必须代谢为相应的二磷酸酯才能发挥其生物学活性。在该过程中，已经提出了由核苷单磷酸激酶（NMP激酶）催化的第一步磷酸化步骤是一个瓶颈。在这里，我们报道了一系列与5'-单核苷酸等排的核糖核苷膦酸酯衍生物的合成，在5'，6'- C内具有不同程度的柔性通过引入羟基，C键以及不同的极性。已经研究了这些修饰对化合物充当参与核酸代谢的适当人NMP激酶的底物的能力的影响。柔韧性低，以及核糖-磷结构中不存在羟基，对于有效的磷转移至关重要。在一系列嘧啶类似物中，一种衍生物被人UMP-CMP激酶磷酸化，其速率与dUMP相似，甚至优于dCMP。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201100068
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 吡啶 、 chromium(VI) oxide 、 乙酸酐 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 23.5h， 生成 diethyl [1'-(5',6'-dideoxy-2',3'-O-isopropylidene-β-D-ribo-5'-hexenofuranosyl)uracil]-6'-phosphonate
  参考文献：
  名称：

  5'，6'-核苷磷酸酯类似物体系结构：代谢酶的合成和比较评价

  摘要：

  核苷膦酸酯已被设计为稳定的5'-单核苷酸模拟物，如今被认为是一类有效的抗病毒剂。在细胞内，它们必须代谢为相应的二磷酸酯才能发挥其生物学活性。在该过程中，已经提出了由核苷单磷酸激酶（NMP激酶）催化的第一步磷酸化步骤是一个瓶颈。在这里，我们报道了一系列与5'-单核苷酸等排的核糖核苷膦酸酯衍生物的合成，在5'，6'- C内具有不同程度的柔性通过引入羟基，C键以及不同的极性。已经研究了这些修饰对化合物充当参与核酸代谢的适当人NMP激酶的底物的能力的影响。柔韧性低，以及核糖-磷结构中不存在羟基，对于有效的磷转移至关重要。在一系列嘧啶类似物中，一种衍生物被人UMP-CMP激酶磷酸化，其速率与dUMP相似，甚至优于dCMP。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201100068

文献信息

• Synthesis of phosphonate derivatives of uridine, cytidine, and cytosine arabinoside
  作者：Kang-Yeoun Jung、Raymond J. Hohl、Andrew J. Wiemer、David F. Wiemer

  DOI：10.1016/s0968-0896(00)00183-8

  日期：2000.10

  The vinyl phosphonate derivatives of uridine, cytidine, and cytosine arabinoside (ara-C) have been prepared through oxidation of appropriately protected nucleosides to the 5' aldehydes and Wittig condensation with [(diethoxyphosphinyl)methylidine]triphenylphosphorane. Dihydroxylation of these vinyl phosphonates with an AD-mix reagent generated the new 5',6'-dihydroxy-6'-phosphonates. After hydrolysis

  尿苷，胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）的乙烯基膦酸酯衍生物是通过将适当保护的核苷氧化成5'醛并与[（二乙氧基膦基）亚甲基]三苯基磷烷进行Wittig缩合反应制得的。用AD-mix试剂将这些乙烯基膦酸酯二羟基化，生成新的5'，6'-二羟基-6'-膦酸酯。在膦酸酯和各种保护基水解后，测试了六种膦酸作为核苷酸单磷酸激酶底物的能力以及对K562细胞的毒性。
• Synthesis and P2Y receptor activity of nucleoside 5′-phosphonate derivatives
  作者：Liesbet Cosyn、Serge Van Calenbergh、Bhalchandra V. Joshi、Hyojin Ko、Rhonda L. Carter、T. Kendall Harden、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1016/j.bmcl.2009.04.027

  日期：2009.6

  Ribose-based nucleoside 5′-diphosphates and triphosphates and related nucleotides were compared in their potency at the P2Y receptors with the corresponding nucleoside 5′-phosphonate derivatives. Phosphonate derivatives of UTP and ATP activated the P2Y2 receptor but were inactive or weakly active at P2Y4 receptor. Uridine 5′-(diphospho)phosphonate was approximately as potent at the P2Y2 receptor as

  将基于核糖的核苷 5'-二磷酸酯和三磷酸酯以及相关核苷酸与相应的核苷 5'-膦酸酯衍生物对 P2Y 受体的效力进行比较。UTP和ATP的磷酸酯衍生物激活P2Y 2受体，但对P2Y 4受体无活性或弱活性。尿苷 5'-（二磷酸）膦酸酯对 P2Y 2受体的作用与对 UDP 激活的 P2Y 6受体的作用大致相同。这些结果表明，从核苷酸激动剂衍生物中去除5'-氧原子会减少但不会阻止与P2Y 2受体的相互作用。尿苷 5'-（磷酸）膦酸酯以及 UMP 的 5'-亚甲基膦酸酯等价物对 P2Y 4受体无活性，但对 P2Y 2受体表现出最大作用，其作用相当于 UTP 的 50%，表明这些类似物具有新作用。